RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490478.5

CACNA2D3-210, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CACNA2D3, Length 3,557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D3-210ENST00000490478 SSX4O60224 188 aa6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 SGPL1O95470 568 aa6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 TDP2O95551 362 aa6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 RECKO95980 971 aa6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 NR3C1P04150 777 aa6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 GSNP06396 782 aa6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 ATF6P18850 670 aa6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 ALAS2P22557 587 aa6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 MMP8P22894 467 aa6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 HTR1BP28222 390 aa6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 CENPAP49450 140 aa6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 HARS2P49590 506 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 ARPP19P56211 112 aa6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 BST2Q10589 180 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 MERTKQ12866 999 aa6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 TMEM236Q5W0B7 351 aa6.99□□□□□ -1.29
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CACNA2D3-210ENST00000490478 BBS12Q6ZW61 710 aa6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 ARCQ7LC44 396 aa6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 EPHX4Q8IUS5 362 aa6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 LACC1Q8IV20 430 aa6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 CCDC103Q8IW40 242 aa6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 KYQ8NBH2 561 aa6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLAIN1Q8ND83 568 aa6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 PLBD2Q8NHP8 589 aa6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 ASB2Q96Q27 587 aa6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 GHITMQ9H3K2 345 aa6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 NTN4Q9HB63 628 aa6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 FBXO8Q9NRD0 319 aa6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 HOMER2Q9NSB8 354 aa6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 IL20Q9NYY1 176 aa6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 PCDH10Q9P2E7 1040 aa6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 APEX2Q9UBZ4 518 aa6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 KLF15Q9UIH9 416 aa6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 PDPK1O15530 556 aa6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 LIASO43766 372 aa6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 DAB1O75553 588 aa6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 RFPL1O75677 317 aa6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 UPK1BO75841 260 aa6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 PAHP00439 452 aa6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 CYP2D6P10635 497 aa6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 ABCG1P45844 678 aa6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 NT5C2P49902 561 aa6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 NME5P56597 212 aa6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 GPR85P60893 370 aa6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 CTF1Q16619 201 aa6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 ESCO2Q56NI9 601 aa6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 METTL24Q5JXM2 366 aa6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 KRT28Q7Z3Y7 464 aa6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 CBR4Q8N4T8 237 aa6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 TBCKQ8TEA7 893 aa6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 RCN3Q96D15 328 aa6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 SORT1Q99523 831 aa6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 PIF1Q9H611 641 aa6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 TCF7L2Q9NQB0 619 aa6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 VWA7Q9Y334 891 aa6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 C9IYK1 514 aa6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 ATG13O75143 517 aa6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 UGT2B11O75310 529 aa6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 TIPRLO75663 272 aa6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 MAP3K6O95382 1288 aa6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 CLEC2LP0C7M8 214 aa6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 RFC4P35249 363 aa6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 SOX9P48436 509 aa6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLC1A6P48664 564 aa6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 FMO5P49326 533 aa6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 HLCSP50747 726 aa6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 NDST1P52848 882 aa6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 TAP1Q03518 808 aa6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 GALNT3Q14435 633 aa6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 CALCRLQ16602 461 aa6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 GEN1Q17RS7 908 aa6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 C1orf141Q5JVX7 400 aa6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 C16orf89Q6UX73 402 aa6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 ADGRA1Q86SQ6 560 aa6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 ADAM32Q8TC27 787 aa6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 LRRC20Q8TCA0 184 aa6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D3-210ENST00000490478 CYGBQ8WWM9 190 aa6.99□□□□□ -1.29
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