RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489318.1

C9orf3-220, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 682 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-220ENST00000489318 USP33Q8TEY7 942 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 ACDQ96AP0 544 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 E2F7Q96AV8 911 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 PKNOX2Q96KN3 472 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 PSKH2Q96QS6 385 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 MGME1Q9BQP7 344 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 MUC3BQ9H195 1237 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 ACBD3Q9H3P7 528 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 SEMA4AQ9H3S1 761 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 LRRC40Q9H9A6 602 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 VPS45Q9NRW7 570 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 HAUS2Q9NVX0 235 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 FAM53CQ9NYF3 392 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 NFS1Q9Y697 457 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 WNT6Q9Y6F9 365 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 TEX264Q9Y6I9 313 aa11.69□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 CDH23Q9H251 3354 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 MYOFQ9NZM1 2061 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 GOLGA8MH3BSY2 632 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 AGPSO00116 658 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 ANXA9O76027 345 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 CYP17A1P05093 508 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 CR2P20023 1033 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 GLDCP23378 1020 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 HLA-FP30511 346 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 ADRA1AP35348 466 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 MTHFRP42898 656 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 MAGEA4P43358 317 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 GEMP55040 296 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 SARNPP82979 210 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 FCHO2Q0JRZ9 810 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 MPP3Q13368 585 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 PRPSAP1Q14558 356 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 PLEKHG6Q3KR16 790 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 CCDC38Q502W7 563 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 ARMC3Q5W041 872 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 KDELC1Q6UW63 502 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 TPGS1Q6ZTW0 290 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 OTOP3Q7RTS5 596 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 TMEM25Q86YD3 366 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 ZBED8Q8IZ13 594 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 BBS5Q8N3I7 341 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 SMRP1Q8NCR6 262 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 RIPOR3Q96MK2 946 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 ZIM3Q96PE6 472 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 SH3GL2Q99962 352 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 APOL5Q9BWW9 433 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 SLC2A11Q9BYW1 496 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 SAYSD1Q9NPB0 183 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 CASS4Q9NQ75 786 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 SEPT3Q9UH03 358 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 VPS51Q9UID3 782 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 VPS28Q9UK41 221 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 FBXO10Q9UK96 956 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 CLEC4EQ9ULY5 219 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 PLAAQ9Y263 795 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 ANKRD36A6QL64 1941 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 HEPACAM2A8MVW5 462 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 AP3B1O00203 1094 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 MUSKO15146 869 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 SPAG6O75602 509 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 MMP2P08253 660 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 TYRP14679 529 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 CD70P32970 193 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 VIPR2P41587 438 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 GRIA1P42261 906 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 DMC1Q14565 340 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 ZNF235Q14590 738 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 PDGFRLQ15198 375 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 DHCR24Q15392 516 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 RALGPS1Q5JS13 557 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 LY6G5CQ5SRR4 150 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 DENND2CQ68D51 928 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 LINC00523Q86TU6 105 aa11.67□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
C9orf3-220ENST00000489318 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.9 ms