RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486539.1

CACNA2D1-211, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1, humanhuman

TSL 5

Gene CACNA2D1, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1-211ENST00000486539 GAGE12IP0CL82 117 aa2.86□□□□□ -1.95
CACNA2D1-211ENST00000486539 FMO4P31512 558 aa2.86□□□□□ -1.95
CACNA2D1-211ENST00000486539 DRG2P55039 364 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
CACNA2D1-211ENST00000486539 GAGE1Q13065 139 aa2.86□□□□□ -1.95
CACNA2D1-211ENST00000486539 GAGE4Q13068 117 aa2.86□□□□□ -1.95
CACNA2D1-211ENST00000486539 DAG1Q14118 895 aa2.86□□□□□ -1.95
CACNA2D1-211ENST00000486539 SYT16Q17RD7 645 aa2.86□□□□□ -1.95
CACNA2D1-211ENST00000486539 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
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CACNA2D1-211ENST00000486539 PCDH12Q9NPG4 1184 aa2.86□□□□□ -1.95
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CACNA2D1-211ENST00000486539 HLA-DQA2P01906 255 aa2.85□□□□□ -1.95
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CACNA2D1-211ENST00000486539 C5orf22Q49AR2 442 aa2.85□□□□□ -1.95
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CACNA2D1-211ENST00000486539 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.85□□□□□ -1.95
CACNA2D1-211ENST00000486539 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
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CACNA2D1-211ENST00000486539 CDH19Q9H159 772 aa2.85□□□□□ -1.95
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CACNA2D1-211ENST00000486539 PNPLA8Q9NP80 782 aa2.85□□□□□ -1.95
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CACNA2D1-211ENST00000486539 LRFN1Q9P244 771 aa2.85□□□□□ -1.95
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CACNA2D1-211ENST00000486539 OR1F2PQ96R84 312 aa2.84□□□□□ -1.95
CACNA2D1-211ENST00000486539 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa2.84□□□□□ -1.95
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CACNA2D1-211ENST00000486539 MST1RQ04912 1400 aa2.84□□□□□ -1.96
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CACNA2D1-211ENST00000486539 J3KTA2 159 aa2.83□□□□□ -1.96
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZBED1O96006 694 aa2.83□□□□□ -1.96
CACNA2D1-211ENST00000486539 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
CACNA2D1-211ENST00000486539 MCM3P25205 808 aa2.83□□□□□ -1.96
CACNA2D1-211ENST00000486539 GABRB3P28472 473 aa2.83□□□□□ -1.96
CACNA2D1-211ENST00000486539 CLCNKBP51801 687 aa2.83□□□□□ -1.96
CACNA2D1-211ENST00000486539 OAZ1P54368 228 aa2.83□□□□□ -1.96
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZBTB17Q13105 803 aa2.83□□□□□ -1.96
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CACNA2D1-211ENST00000486539 NCAPH2Q6IBW4 605 aa2.83□□□□□ -1.96
CACNA2D1-211ENST00000486539 BEND5Q7L4P6 421 aa2.83□□□□□ -1.96
CACNA2D1-211ENST00000486539 RASGRP3Q8IV61 690 aa2.83□□□□□ -1.96
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CACNA2D1-211ENST00000486539 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
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CACNA2D1-211ENST00000486539 CDH22Q9UJ99 828 aa2.83□□□□□ -1.96
CACNA2D1-211ENST00000486539 SLC12A4Q9UP95 1085 aa2.83□□□□□ -1.96
CACNA2D1-211ENST00000486539 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP2.82□□□□□ -1.96
CACNA2D1-211ENST00000486539 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa2.82□□□□□ -1.96
CACNA2D1-211ENST00000486539 C16orf97H3BN30 126 aa2.82□□□□□ -1.96
CACNA2D1-211ENST00000486539 M0QYT0 321 aa2.82□□□□□ -1.96
CACNA2D1-211ENST00000486539 SLC5A1P13866 664 aa2.82□□□□□ -1.96
CACNA2D1-211ENST00000486539 TYK2P29597 1187 aa2.82□□□□□ -1.96
CACNA2D1-211ENST00000486539 RPL3P39023 403 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
CACNA2D1-211ENST00000486539 MAPKAPK3Q16644 382 aa2.82□□□□□ -1.96
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