RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 A0A0G2JND7 137 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 GMNCA6NCL1 334 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 MSH3P20585 1137 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 SSTR1P30872 391 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 MTHFRP42898 656 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 CAP1Q01518 475 aa8.4□□□□□ -1.06
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PTPRD-211ENST00000486161 SLC12A1Q13621 1099 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 CA9Q16790 459 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 GRTP1Q5TC63 336 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF470Q6ECI4 717 aa8.4□□□□□ -1.06
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PTPRD-211ENST00000486161 STK40Q8N2I9 435 aa8.4□□□□□ -1.06
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PTPRD-211ENST00000486161 TBX21Q9UL17 535 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM120BA0PK00 339 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 C5orf60A6NFR6 353 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 GJA1P17302 382 aa8.4□□□□□ -1.06
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PTPRD-211ENST00000486161 XKR4Q5GH76 650 aa8.4□□□□□ -1.06
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PTPRD-211ENST00000486161 FBXL22Q6P050 247 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 SH2D3CQ8N5H7 860 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 OR7D4Q8NG98 312 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 CXorf40AQ8TE69 158 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 ART4Q93070 314 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 ACDQ96AP0 544 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 ZBTB18Q99592 522 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 CENPKQ9BS16 269 aa8.4□□□□□ -1.06
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PTPRD-211ENST00000486161 SUN2Q9UH99 717 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM59LQ9UK28 342 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 TRIM33Q9UPN9 1127 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
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PTPRD-211ENST00000486161 SNX10Q9Y5X0 201 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRD-211ENST00000486161 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa8.4□□□□□ -1.07
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PTPRD-211ENST00000486161 SUPT3HO75486 399 aa8.4□□□□□ -1.07
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PTPRD-211ENST00000486161 MYO1HQ8N1T3 1032 aa8.4□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 WDTC1Q8N5D0 677 aa8.4□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 NETO2Q8NC67 525 aa8.4□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 C3orf58Q8NDZ4 430 aa8.4□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 SNX19Q92543 992 aa8.4□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 CHMP6Q96FZ7 201 aa8.4□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 CPNE1Q99829 537 aa8.4□□□□□ -1.07
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PTPRD-211ENST00000486161 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 FSCBQ5H9T9 825 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 TCEAL8Q8IYN2 117 aa8.39□□□□□ -1.07
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PTPRD-211ENST00000486161 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
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PTPRD-211ENST00000486161 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 APPL1Q9UKG1 709 aa8.39□□□□□ -1.07
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PTPRD-211ENST00000486161 MLNP12872 115 aa8.39□□□□□ -1.07
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PTPRD-211ENST00000486161 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
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PTPRD-211ENST00000486161 SLC25A51Q9H1U9 297 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 ILVBLA1L0T0 632 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 GCATO75600 419 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 TMCC1O94876 653 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 RHOP08100 348 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 CHN1P15882 459 aa8.39□□□□□ -1.07
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