RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa12.93□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 FAM46CQ5VWP2 391 aa12.93□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 TMC6Q7Z403 805 aa12.93□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 PDZD3Q86UT5 571 aa12.93□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 TRIM69Q86WT6 500 aa12.93□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 MFSD2AQ8NA29 543 aa12.93□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 TMEM35BQ8NCS4 154 aa12.93□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 OR7D4Q8NG98 312 aa12.93□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 OR2A12Q8NGT7 310 aa12.93□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 NT5C3BQ969T7 300 aa12.93□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 CFAP57Q96MR6 1250 aa12.93□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 PDCL3Q9H2J4 239 aa12.93□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 KDM4CQ9H3R0 1056 aa12.93□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 HS3ST2Q9Y278 367 aa12.93□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 DRGXA6NNA5 263 aa12.92□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 E9PAM4 449 aa12.92□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 ALOX15BO15296 676 aa12.92□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 SLC7A4O43246 635 aa12.92□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 SRGAP2O75044 1071 aa12.92□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 MMEP08473 750 aa12.92□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 CYP11B1P15538 503 aa12.92□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 CHRNA3P32297 505 aa12.92□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 GABRB2P47870 512 aa12.92□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 RXRGP48443 463 aa12.92□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 SNX16P57768 344 aa12.92□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 KRT83P78385 493 aa12.92□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 STAT4Q14765 748 aa12.92□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 SLC25A52Q3SY17 297 aa12.92□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 SLC45A4Q5BKX6 768 aa12.92□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 BRMS1LQ5PSV4 323 aa12.92□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 SFMBT2Q5VUG0 894 aa12.92□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa12.92□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa12.92□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 ERICH1Q86X53 443 aa12.92□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 FAM131BQ86XD5 332 aa12.92□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa12.92□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa12.92□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 CPA5Q8WXQ8 436 aa12.92□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 TSC1Q92574 1164 aa12.92□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 C18orf8Q96DM3 657 aa12.92□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 LRIG1Q96JA1 1093 aa12.92□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 PPP1R9BQ96SB3 815 aa12.92□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa12.92□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 DKK4Q9UBT3 224 aa12.92□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 KNTC1P50748 2209 aa12.92□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa12.91□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 A0A1W2PQU0 124 aa12.91□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 EPHB6O15197 1021 aa12.91□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 YKT6O15498 198 aa12.91□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 JUPP14923 745 aa12.91□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 CLDN2P57739 230 aa12.91□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 BPIFB4P59827 614 aa12.91□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP12.91□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 ZNF284Q2VY69 593 aa12.91□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 ARSIQ5FYB1 569 aa12.91□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 HES3Q5TGS1 186 aa12.91□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 NAA35Q5VZE5 725 aa12.91□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 SEL1L3Q68CR1 1132 aa12.91□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 C22orf39Q6P5X5 142 aa12.91□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 TMPRSS12Q86WS5 348 aa12.91□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 EMC1Q8N766 993 aa12.91□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 DCAF4L2Q8NA75 395 aa12.91□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 SPC24Q8NBT2 197 aa12.91□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 SLC20A1Q8WUM9 679 aa12.91□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 SPON2Q9BUD6 331 aa12.91□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 MAGEB5Q9BZ81 275 aa12.91□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 TTYH3Q9C0H2 523 aa12.91□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 GANQ9H2C0 597 aa12.91□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 PREBQ9HCU5 417 aa12.91□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 UCKL1Q9NWZ5 548 aa12.91□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 RRN3Q9NYV6 651 aa12.91□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 ZNF212Q9UDV6 495 aa12.91□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 TMEM59LQ9UK28 342 aa12.91□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 STAP1Q9ULZ2 295 aa12.91□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 DMTF1Q9Y222 760 aa12.91□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa12.91□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 TRPM6Q9BX84 2022 aa12.9□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa12.9□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 TRIM38O00635 465 aa12.9□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 LEFTY1O75610 366 aa12.9□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 GJB6O95452 261 aa12.9□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 UCHL3P15374 230 aa12.9□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 OR1E1P30953 314 aa12.9□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 NOMO3P69849 1222 aa12.9□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 ATP11AP98196 1134 aa12.9□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 MTA1Q13330 715 aa12.9□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms