RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473722.5

SCIN-205, Transcript of scinderin, human

TSL 4

Gene SCIN, Length 656 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SCIN-205	ENST00000473722	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	NAPB	Q9H115	298 aa		5.82	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	NRIP3	Q9NQ35	241 aa		5.82	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		5.82	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		5.82	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		5.81	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	PSME4	Q14997	1843 aa		5.81	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722		A0A087WV62	115 aa		5.81	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		5.81	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	DNAJC9-AS1	A6NH13	148 aa		5.81	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	YDJC	A8MPS7	323 aa		5.81	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	NPC1	O15118	1278 aa		5.81	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	ANXA6	P08133	673 aa		5.81	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	TDO2	P48775	406 aa		5.81	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	MCM2	P49736	904 aa		5.81	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	ALDH18A1	P54886	795 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	TRDN	Q13061	729 aa		5.81	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	TNFAIP1	Q13829	316 aa		5.81	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	GRM4	Q14833	912 aa		5.81	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	ELF2	Q15723	593 aa		5.81	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	GPR162	Q16538	588 aa		5.81	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	ZNF626	Q68DY1	528 aa		5.81	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	PGBD2	Q6P3X8	592 aa		5.81	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	ACSM6	Q6P461	480 aa		5.81	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	CNGA4	Q8IV77	575 aa		5.81	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	GPC2	Q8N158	579 aa		5.81	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	ZNF527	Q8NB42	609 aa		5.81	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		5.81	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		5.81	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	NUAK2	Q9H093	628 aa		5.81	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		5.81	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		5.81	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		5.81	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		5.81	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	WDR91	A4D1P6	747 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	AQP12B	A6NM10	295 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	TTC34	A8MYJ7	566 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722		M0QZQ0	153 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	PSMD14	O00487	310 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	ITGA5	P08648	1049 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	BTD	P43251	543 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	5.8	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	RHBDL3	P58872	404 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	CXCL9	Q07325	125 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	SPARCL1	Q14515	664 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	NECTIN1	Q15223	517 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	ANKRD1	Q15327	319 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	SLC2A7	Q6PXP3	512 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	CERS5	Q8N5B7	392 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	AKAP1	Q92667	903 aa	Known RBP eCLIP	5.8	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	PMM1	Q92871	262 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	CRB3	Q9BUF7	120 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	ARL8B	Q9NVJ2	186 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	AATF	Q9NY61	560 aa	Known RBP eCLIP	5.8	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	TAGLN3	Q9UI15	199 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	GXYLT2	A0PJZ3	443 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	ASNA1	O43681	348 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	CDK4	P11802	303 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	ATP5F1	P24539	256 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	TACR3	P29371	465 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	VPS41	P49754	854 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	GAB1	Q13480	694 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	CBFB	Q13951	182 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	MORC3	Q14149	939 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	DLGAP5	Q15398	846 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	SBK1	Q52WX2	424 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	ADGRA1	Q86SQ6	560 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	GATAD2A	Q86YP4	633 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	HSCB	Q8IWL3	235 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	TEX11	Q8IYF3	940 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	NRSN1	Q8IZ57	195 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	NCOA7	Q8NI08	942 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	FAM71B	Q8TC56	605 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	SLC22A17	Q8WUG5	538 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	STYX	Q8WUJ0	223 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	WDR60	Q8WVS4	1066 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	GLMP	Q8WWB7	406 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SCIN-205	ENST00000473722	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		5.79	□□□□□ -1.48

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