RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	ARHGAP42	A6NI28	874 aa		18.1	■□□□□ 0.49
USP19-210	ENST00000465902	DFFA	O00273	331 aa		18.1	■□□□□ 0.49
USP19-210	ENST00000465902	MCF2L	O15068	1137 aa		18.1	■□□□□ 0.49
USP19-210	ENST00000465902	MTA2	O94776	668 aa		18.1	■□□□□ 0.49
USP19-210	ENST00000465902	ADH1B	P00325	375 aa		18.1	■□□□□ 0.49
USP19-210	ENST00000465902	KRT7	P08729	469 aa		18.1	■□□□□ 0.49
USP19-210	ENST00000465902	TNNT1	P13805	278 aa		18.1	■□□□□ 0.49
USP19-210	ENST00000465902	MPL	P40238	635 aa		18.1	■□□□□ 0.49
USP19-210	ENST00000465902	SERINC3	Q13530	473 aa		18.1	■□□□□ 0.49
USP19-210	ENST00000465902	PUM1	Q14671	1186 aa	Known RBP eCLIP	18.1	■□□□□ 0.49
USP19-210	ENST00000465902	FAM46C	Q5VWP2	391 aa		18.1	■□□□□ 0.49
USP19-210	ENST00000465902	TMCO3	Q6UWJ1	677 aa		18.1	■□□□□ 0.49
USP19-210	ENST00000465902	RGL4	Q8IZJ4	473 aa		18.1	■□□□□ 0.49
USP19-210	ENST00000465902	HDDC3	Q8N4P3	179 aa		18.1	■□□□□ 0.49
USP19-210	ENST00000465902	NETO2	Q8NC67	525 aa		18.1	■□□□□ 0.49
USP19-210	ENST00000465902	HSPA12B	Q96MM6	686 aa		18.1	■□□□□ 0.49
USP19-210	ENST00000465902	CSPG4P5	Q96PW8	444 aa		18.1	■□□□□ 0.49
USP19-210	ENST00000465902	TM6SF2	Q9BZW4	377 aa		18.1	■□□□□ 0.49
USP19-210	ENST00000465902	CEP44	Q9C0F1	390 aa		18.1	■□□□□ 0.49
USP19-210	ENST00000465902	SLC39A8	Q9C0K1	460 aa		18.1	■□□□□ 0.49
USP19-210	ENST00000465902	KLC2	Q9H0B6	622 aa		18.1	■□□□□ 0.49
USP19-210	ENST00000465902	BTBD1	Q9H0C5	482 aa		18.1	■□□□□ 0.49
USP19-210	ENST00000465902	DNAH14	Q0VDD8	3507 aa		18.09	■□□□□ 0.49
USP19-210	ENST00000465902	FAM47DP	A6NHR8	397 aa		18.09	■□□□□ 0.49
USP19-210	ENST00000465902	MEI4	A8MW99	385 aa		18.09	■□□□□ 0.49
USP19-210	ENST00000465902	PRR5-ARHGAP8	B1AHC4	643 aa		18.09	■□□□□ 0.49
USP19-210	ENST00000465902	C1QTNF3-AMACR	E9PGA6	284 aa		18.09	■□□□□ 0.49
USP19-210	ENST00000465902	IGLV3-19	P01714	112 aa		18.09	■□□□□ 0.49
USP19-210	ENST00000465902	C5AR1	P21730	350 aa		18.09	■□□□□ 0.49
USP19-210	ENST00000465902	FECH	P22830	423 aa		18.09	■□□□□ 0.49
USP19-210	ENST00000465902	ACSL1	P33121	698 aa		18.09	■□□□□ 0.49
USP19-210	ENST00000465902	PAPOLA	P51003	745 aa	Known RBP	18.09	■□□□□ 0.49
USP19-210	ENST00000465902	NAP1L1	P55209	391 aa	Known RBP	18.09	■□□□□ 0.49
USP19-210	ENST00000465902	ARHGAP8	P85298	464 aa		18.09	■□□□□ 0.49
USP19-210	ENST00000465902	LMNB2	Q03252	620 aa		18.09	■□□□□ 0.49
USP19-210	ENST00000465902	ZNF33A	Q06730	810 aa		18.09	■□□□□ 0.49
USP19-210	ENST00000465902	MMRN1	Q13201	1228 aa		18.09	■□□□□ 0.49
USP19-210	ENST00000465902	DPYS	Q14117	519 aa		18.09	■□□□□ 0.49
USP19-210	ENST00000465902	ODF2	Q5BJF6	829 aa		18.09	■□□□□ 0.49
USP19-210	ENST00000465902	SPDYC	Q5MJ68	293 aa		18.09	■□□□□ 0.49
USP19-210	ENST00000465902	RAD9B	Q6WBX8	426 aa		18.09	■□□□□ 0.49
USP19-210	ENST00000465902	PCDH20	Q8N6Y1	951 aa	Known RBP	18.09	■□□□□ 0.49
USP19-210	ENST00000465902	OR2A12	Q8NGT7	310 aa		18.09	■□□□□ 0.49
USP19-210	ENST00000465902	PIP4K2C	Q8TBX8	421 aa		18.09	■□□□□ 0.49
USP19-210	ENST00000465902	GRIN3A	Q8TCU5	1115 aa		18.09	■□□□□ 0.49
USP19-210	ENST00000465902	LRRC19	Q9H756	370 aa		18.09	■□□□□ 0.49
USP19-210	ENST00000465902	PCDHGA5	Q9Y5G8	931 aa		18.09	■□□□□ 0.49
USP19-210	ENST00000465902	ATXN2	Q99700	1313 aa	Known RBP	18.08	■□□□□ 0.49
USP19-210	ENST00000465902	BCLAF3	A2AJT9	711 aa	Known RBP	18.08	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	KPNA3	O00505	521 aa	Predicted RBP	18.08	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	ALOX15B	O15296	676 aa		18.08	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	SPOP	O43791	374 aa		18.08	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	CD48	P09326	243 aa		18.08	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	ITPKA	P23677	461 aa		18.08	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	CHRNA3	P32297	505 aa		18.08	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	RSPO4	Q2I0M5	234 aa	Predicted RBP	18.08	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	CARD16	Q5EG05	197 aa		18.08	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	ARSI	Q5FYB1	569 aa		18.08	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	SYCP2L	Q5T4T6	812 aa		18.08	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	RAB11FIP1	Q6WKZ4	1283 aa	Predicted RBP	18.08	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	DPY19L3	Q6ZPD9	716 aa		18.08	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	USP30	Q70CQ3	517 aa		18.08	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	KIAA1328	Q86T90	577 aa		18.08	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	MAP7D3	Q8IWC1	876 aa		18.08	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	LZTR1	Q8N653	840 aa		18.08	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	NPW	Q8N729	165 aa		18.08	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	CHST14	Q8NCH0	376 aa		18.08	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	SNX19	Q92543	992 aa		18.08	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	FOXJ1	Q92949	421 aa		18.08	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	NEUROG2	Q9H2A3	272 aa		18.08	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	SMOC1	Q9H4F8	434 aa		18.08	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	SP110	Q9HB58	689 aa		18.08	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	SEMA4G	Q9NTN9	838 aa		18.08	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	SERGEF	Q9UGK8	458 aa		18.08	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	IL36A	Q9UHA7	158 aa		18.08	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	SARDH	Q9UL12	918 aa		18.08	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	MFHAS1	Q9Y4C4	1052 aa		18.08	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	HYOU1	Q9Y4L1	999 aa		18.08	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	CACNA1A	O00555	2505 aa		18.08	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902		J3KR12	359 aa		18.07	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	PLK4	O00444	970 aa		18.07	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	TMCC1	O94876	653 aa		18.07	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	SEMA4F	O95754	770 aa		18.07	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	CD160	O95971	181 aa		18.07	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	PRNP	P04156	253 aa		18.07	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	SDHB	P21912	280 aa		18.07	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	METAP1	P53582	386 aa		18.07	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	GSDMD	P57764	484 aa		18.07	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	DPYSL3	Q14195	570 aa		18.07	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	PDK2	Q15119	407 aa		18.07	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	TCEAL1	Q15170	157 aa		18.07	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	SLC41A1	Q8IVJ1	513 aa		18.07	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	AADAT	Q8N5Z0	425 aa		18.07	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	C12orf50	Q8NA57	414 aa	Predicted RBP	18.07	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	ACRBP	Q8NEB7	543 aa		18.07	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	OR6K2	Q8NGY2	324 aa		18.07	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	ISG20	Q96AZ6	181 aa	Known RBP	18.07	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	ZDHHC6	Q9H6R6	413 aa		18.07	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	SGK2	Q9HBY8	427 aa		18.07	■□□□□ 0.48
USP19-210	ENST00000465902	DYRK4	Q9NR20	520 aa		18.07	■□□□□ 0.48

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