RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464611.1

ACTB-208, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-208ENST00000464611 DRC3Q9H069 523 aa8.66□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 CDH19Q9H159 772 aa8.66□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 UGT1A7Q9HAW7 530 aa8.66□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 UGT1A10Q9HAW8 530 aa8.66□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 UGT1A8Q9HAW9 530 aa8.66□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 CRTAC1Q9NQ79 661 aa8.66□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 STARD7Q9NQZ5 370 aa8.66□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 TBC1D13Q9NVG8 400 aa8.66□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 OXSMQ9NWU1 459 aa8.66□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 COMMD8Q9NX08 183 aa8.66□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa8.66□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa8.66□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 PDP2Q9P2J9 529 aa8.66□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 SCOCQ9UIL1 159 aa8.66□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 EMCNQ9ULC0 261 aa8.66□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 PHF24Q9UPV7 400 aa8.66□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 A0A1W2PQY0 241 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 RGSL1A5PLK6 1076 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 TRPC5OSA6NMA1 111 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 YJEFN3A6XGL0 299 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 HHLA1C9JL84 531 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 M0QZQ0 153 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 INPPL1O15357 1258 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 HDAC3O15379 428 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 NPHS1O60500 1241 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP8.65□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 MAP3K6O95382 1288 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 IGLV3-25P01717 112 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 C2P06681 752 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 ERVK-10P10266 1014 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 CCR1P32246 355 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 MLH1P40692 756 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 NUMBP49757 651 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 NDUFV1P49821 464 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 CSRP3P50461 194 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 RPL14P50914 215 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 DNAJB13P59910 316 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 SATB1Q01826 763 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 POU4F1Q01851 419 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 BTKQ06187 659 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 GRIK3Q13003 919 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 MTM1Q13496 603 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 TUBB3Q13509 450 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 KCNA10Q16322 511 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 UPP1Q16831 310 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 ZNF618Q5T7W0 954 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 C1orf146Q5VVC0 180 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 LIPMQ5VYY2 423 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 BSPRYQ5W0U4 402 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 PGM2L1Q6PCE3 622 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 CXCL17Q6UXB2 119 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 C10orf107Q8IVU9 208 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 CATSPER1Q8NEC5 780 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 TTC8Q8TAM2 541 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 TMEM40Q8WWA1 233 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 PEX13Q92968 403 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 RANBP9Q96S59 729 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 MCMBPQ9BTE3 642 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 THTPAQ9BU02 230 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 MAGEB5Q9BZ81 275 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 TKTL2Q9H0I9 626 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 C11orf49Q9H6J7 331 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 ARNT2Q9HBZ2 717 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 VPS45Q9NRW7 570 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 TMEM216Q9P0N5 145 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 ACOT9Q9Y305 439 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 TSC2P49815 1807 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTB-208ENST00000464611 A0A0U1RQF3 1178 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 CCDC189A1A4V9 331 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 ARL5CA6NH57 179 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 G3V2L1 256 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 KCNK1O00180 336 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 CLDN5O00501 218 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 ZNF195O14628 629 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 NRP1O14786 923 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 TBX10O75333 385 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 NEBLO76041 1014 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 BEST1O76090 585 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 JCHAINP01591 159 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 RBP1P09455 135 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 USP17L7P0C7H9 530 aa8.64□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms