RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464283.5

CTPS1-205, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTPS1, Length 643 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-205ENST00000464283 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 TMEM25Q86YD3 366 aa5.49□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 CPNE8Q86YQ8 564 aa5.49□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa5.49□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 ZNF843Q8N446 348 aa5.49□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 CCDC33Q8N5R6 958 aa5.49□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 LZTR1Q8N653 840 aa5.49□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 ALLCQ8N6M5 410 aa5.49□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 NAT16Q8N8M0 369 aa5.49□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 ZNF454Q8N9F8 522 aa5.49□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 TERB1Q8NA31 727 aa5.49□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 SPATA4Q8NEY3 305 aa5.49□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 FAM71BQ8TC56 605 aa5.49□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 USP33Q8TEY7 942 aa5.49□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 GAB3Q8WWW8 586 aa5.49□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 P3H4Q92791 437 aa5.49□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 WBP2Q969T9 261 aa5.49□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 TBC1D31Q96DN5 1066 aa5.49□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 SLC39A13Q96H72 371 aa5.49□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 RNF157Q96PX1 679 aa5.49□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 PEBP4Q96S96 227 aa5.49□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 HEMGNQ9BXL5 484 aa5.49□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 AP1M1Q9BXS5 423 aa5.49□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 SIK2Q9H0K1 926 aa5.49□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 PCDH18Q9HCL0 1135 aa5.49□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa5.49□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 MARK1Q9P0L2 795 aa5.49□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP5.49□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 MMP17Q9ULZ9 603 aa5.49□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 RAD54BQ9Y620 910 aa5.49□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 ABCA12Q86UK0 2595 aa5.49□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 NOTCH2Q04721 2471 aa5.48□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 A0A087WV48 116 aa5.48□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa5.48□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 CFAP69A5D8W1 941 aa5.48□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 K7EQS6 105 aa5.48□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa5.48□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 SGK1O00141 431 aa5.48□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 NDC80O14777 642 aa5.48□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 GIPC1O14908 333 aa5.48□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 ACSL4O60488 711 aa5.48□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 GREM1O60565 184 aa5.48□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 PHF2O75151 1096 aa5.48□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 STK10O94804 968 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 EPN2O95208 641 aa5.48□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 GAS8O95995 478 aa5.48□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 IGLV3-27P01718 113 aa5.48□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 APOC2P02655 101 aa5.48□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 CYBBP04839 570 aa5.48□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 TUBBP07437 444 aa5.48□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 CD48P09326 243 aa5.48□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 NUDT7P0C024 238 aa5.48□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 KRT10P13645 584 aa5.48□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 HOXB2P14652 356 aa5.48□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 GOT1P17174 413 aa5.48□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 EPHB2P29323 1055 aa5.48□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 HOXC13P31276 330 aa5.48□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 CCR10P46092 362 aa5.48□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 FNTAP49354 379 aa5.48□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 DGKGP49619 791 aa5.48□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 ARSEP51690 589 aa5.48□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 DYNLT1P63172 113 aa5.48□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 MESP2Q0VG99 397 aa5.48□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 MMRN1Q13201 1228 aa5.48□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 XRCC4Q13426 336 aa5.48□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 AUHQ13825 339 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 PDK1Q15118 436 aa5.48□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 LLGL1Q15334 1064 aa5.48□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 PPP1R7Q15435 360 aa5.48□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 ELF2Q15723 593 aa5.48□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 CRY1Q16526 586 aa5.48□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 TAZQ16635 292 aa5.48□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 CA9Q16790 459 aa5.48□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 RAB6CQ53S08 254 aa5.48□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 TEX35Q5T0J7 233 aa5.48□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 ADGRF1Q5T601 910 aa5.48□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 RNF43Q68DV7 783 aa5.48□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 SLC9A4Q6AI14 798 aa5.48□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 C8orf74Q6P047 294 aa5.48□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 RFX8Q6ZV50 586 aa5.48□□□□□ -1.53
CTPS1-205ENST00000464283 GSTA5Q7RTV2 222 aa5.48□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.4 ms