RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460170.2

PTPRU-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,337 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-205ENST00000460170 IPPQ9Y573 584 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRU-205ENST00000460170 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 MDM4O15151 490 aa14.96□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 CLOCKO15516 846 aa14.96□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 TFEBP19484 476 aa14.96□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 HLA-DPA1P20036 260 aa14.96□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 TKTP29401 623 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 CRHR1P34998 444 aa14.96□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 RUNX1T1Q06455 604 aa14.96□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 VAC14Q08AM6 782 aa14.96□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 CTBP1Q13363 440 aa14.96□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 FAM45BPQ6NSW5 357 aa14.96□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 GPSM1Q86YR5 675 aa14.96□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 BBS7Q8IWZ6 715 aa14.96□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 FAM45AQ8TCE6 357 aa14.96□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 SPOCK2Q92563 424 aa14.96□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 ARL8BQ9NVJ2 186 aa14.96□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 XPR1Q9UBH6 696 aa14.96□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 TTLL13PA6NNM8 815 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 BUD23O43709 281 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 CABYRO75952 493 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 RIPK1Q13546 671 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 CPNE8Q86YQ8 564 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 ZNF112Q9UJU3 913 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 GIT1Q9Y2X7 761 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 TULP2O00295 520 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 ULK2Q8IYT8 1036 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 PLEKHA8Q96JA3 519 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 DHX15O43143 795 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 FAM155BO75949 473 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 RAP1GDS1P52306 607 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 MBTD1Q05BQ5 628 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 FIG4Q92562 907 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 MARK4Q96L34 752 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 NDNQ99608 321 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 FAM105AQ9NUU6 356 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 TMEM59LQ9UK28 342 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 KDM3BQ7LBC6 1761 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 SOWAHBA6NEL2 793 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 DNM1LO00429 736 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 VNN1O95497 513 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 PGK1P00558 417 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 ANPEPP15144 967 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 CCT8P50990 548 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 DEFB128Q7Z7B8 93 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 FAM13CQ8NE31 585 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 PEX10O60683 326 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 EPHA3P29320 983 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 HK2P52789 917 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 ARHGAP8P85298 464 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 DCAF12L1Q5VU92 463 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 STK40Q8N2I9 435 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 RNF145Q96MT1 663 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 PNPOQ9NVS9 261 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 WFS1O76024 890 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 PTPN9P43378 593 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 NEK3P51956 506 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 ARMC12Q5T9G4 340 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 SEMA3CQ99985 751 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 NMUR2Q9GZQ4 415 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 SDCBP2Q9H190 292 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 MYRFQ9Y2G1 1151 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 TSPAN1O60635 241 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 SEC22BO75396 215 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 USP2O75604 605 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 PAX7P23759 505 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 BRMS1LQ5PSV4 323 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 LPCAT2Q7L5N7 544 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 DHDDSQ86SQ9 333 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 TERB1Q8NA31 727 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 DDHD1Q8NEL9 900 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 FAM192AQ9GZU8 254 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 RHOJQ9H4E5 214 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 PACSIN3Q9UKS6 424 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 MYH2Q9UKX2 1941 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 C2CD4BA6NLJ0 364 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 C2P06681 752 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 MMP3P08254 477 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 CREB1P16220 341 aa14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.9 ms