RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459758.5

TTLL3-222, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 555 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-222	ENST00000459758	IRX4	P78413	519 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	CRADD	P78560	199 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	ZBTB17	Q13105	803 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	PCLAF	Q15004	111 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	HSP90AA5P	Q58FG0	334 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	MARC1	Q5VT66	337 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	LIPM	Q5VYY2	423 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	RAPH1	Q70E73	1250 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	CLEC14A	Q86T13	490 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	HOMEZ	Q8IX15	550 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	KIF2B	Q8N4N8	673 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	TEX9	Q8N6V9	391 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	ENDOV	Q8N8Q3	282 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	SEPT8	Q92599	483 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	THOC1	Q96FV9	657 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	SLC39A13	Q96H72	371 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	DDX50	Q9BQ39	737 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	CEP41	Q9BYV8	373 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	ILKAP	Q9H0C8	392 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	UGT1A7	Q9HAW7	530 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	UGT1A10	Q9HAW8	530 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	UGT1A8	Q9HAW9	530 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	SP110	Q9HB58	689 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	ALG13	Q9NP73	1137 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	TMPRSS4	Q9NRS4	437 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	RBM22	Q9NW64	420 aa	Known RBP eCLIP	11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	CAMSAP3	Q9P1Y5	1249 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	HSFX1	Q9UBD0	423 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	DNAJB4	Q9UDY4	337 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	ACOT9	Q9Y305	439 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	TTC3	P53804	2025 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	IGLV3-10	A0A075B6K4	115 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758		A0A1W2PQH9	124 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	ARVCF	O00192	962 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	PITPNM1	O00562	1244 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	HGS	O14964	777 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	PFDN6	O15212	129 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	PIAS1	O75925	651 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	CBX6	O95503	412 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	ETFB	P38117	255 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	CD151	P48509	253 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	CLCN5	P51795	746 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	RAP1GDS1	P52306	607 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	RAB10	P61026	200 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	MXRA7	P84157	204 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	IL10RB	Q08334	325 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	PRKAA1	Q13131	559 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	MRPL58	Q14197	206 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	USP10	Q14694	798 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	TRMT5	Q32P41	509 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	CMPK2	Q5EBM0	449 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	VARS2	Q5ST30	1063 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	NET1	Q7Z628	596 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	ARHGAP12	Q8IWW6	846 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	CCDC33	Q8N5R6	958 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	ANKLE1	Q8NAG6	615 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	PPFIBP2	Q8ND30	876 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	SCAMP5	Q8TAC9	235 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	TTC8	Q8TAM2	541 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	CASP10	Q92851	521 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	FBXO32	Q969P5	355 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	FCRL3	Q96P31	734 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	SLC39A8	Q9C0K1	460 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	IARS2	Q9NSE4	1012 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	TMEM30A	Q9NV96	361 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	TMLHE	Q9NVH6	421 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	OSER1	Q9NX31	292 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	RIMKLB	Q9ULI2	386 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	DNAJC16	Q9Y2G8	782 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	C15orf41	Q9Y2V0	281 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	RAP2C	Q9Y3L5	183 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	HS3ST4	Q9Y661	456 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	MICAL3	Q7RTP6	2002 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	CCDC195	A0A1B0GUA6	201 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	CCDC189	A1A4V9	331 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	TRPC5OS	A6NMA1	111 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	CAPN14	A8MX76	684 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	GSC2	O15499	205 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	SLC7A4	O43246	635 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	PENK	P01210	267 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	EPO	P01588	193 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	C2	P06681	752 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	CPB1	P15086	417 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	HLA-DPA1	P20036	260 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	FGFR3	P22607	806 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	ADRA1A	P35348	466 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	GCK	P35557	465 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	MAP2K2	P36507	400 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	PPP3CC	P48454	512 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	TUFM	P49411	452 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	SERPINH1	P50454	418 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	AFF1	P51825	1210 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
TTLL3-222	ENST00000459758	IRX1	P78414	480 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54

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