RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 TCEAL4Q96EI5 215 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 MED8Q96G25 268 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 TRIM4Q9C037 500 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 PSTPIP2Q9H939 334 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 TRPV4Q9HBA0 871 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 LY9Q9HBG7 655 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 FSCN3Q9NQT6 498 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM74BQ9NUR3 256 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 EVPLQ92817 2033 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 FAM149AA5PLN7 773 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 MEIS2O14770 477 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 DRD1P21728 446 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 BCKDHBP21953 392 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 LSP1P33241 339 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 MCM5P33992 734 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 MLH1P40692 756 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 TERF1P54274 439 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 DSC1Q08554 894 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 FCHO2Q0JRZ9 810 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 CCDC173Q0VFZ6 552 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 BMT2Q1RMZ1 405 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM196Q5HYL7 178 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 SPDYCQ5MJ68 293 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 ANO7Q6IWH7 933 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 CNNM4Q6P4Q7 775 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 GLRX5Q86SX6 157 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 MARCH9Q86YJ5 346 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 RHPN2Q8IUC4 686 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 SIMC1Q8NDZ2 872 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 ENGASEQ8NFI3 743 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 CAVIN3Q969G5 261 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 TMX3Q96JJ7 454 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 ZFYVE19Q96K21 471 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 NLRP4Q96MN2 994 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 ASAH2Q9NR71 780 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 GABBR1Q9UBS5 961 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 MAD2L2Q9UI95 211 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 TPCN1Q9ULQ1 816 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 PCDHA6Q9UN73 950 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 CDY1Q9Y6F8 540 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 WDR81Q562E7 1941 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 APC2O95996 2303 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 PLK4O00444 970 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 ADAM12O43184 909 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 CCNE2O96020 404 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 EGFP01133 1207 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 RBP3P10745 1247 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 JUPP14923 745 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 GJA1P17302 382 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 PTGER3P43115 390 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 ARPP19P56211 112 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 TCEA2Q15560 299 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 TEAD2Q15562 447 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 C19orf54Q5BKX5 351 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 ABHD17BQ5VST6 288 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 OR2I1PQ8NGU4 316 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 HASPINQ8TF76 798 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 SNX33Q8WV41 574 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 TFAP2CQ92754 450 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 EVI5LQ96CN4 794 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 PILRBQ9UKJ0 227 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 NUP205Q92621 2012 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 DOCK6Q96HP0 2047 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 THADAQ6YHU6 1953 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 ARHGEF37A1IGU5 675 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 AP5Z1O43299 807 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 ERLIN2O94905 339 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 MYF5P13349 255 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 CTSSP25774 331 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 LSSP48449 732 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 UCNP55089 124 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 TMPRSS3P57727 454 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 RESTQ13127 1097 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 PLEKHG6Q3KR16 790 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 CEP55Q53EZ4 464 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 PITRM1Q5JRX3 1037 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa6.69□□□□□ -1.34
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