RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420940.6

WDR48-203, Transcript of WD repeat domain 48, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene WDR48, Length 3,772 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR48-203ENST00000420940 KCNC1P48547 511 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 DAOAP59103 153 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 MXRA7P84157 204 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 BST2Q10589 180 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 ITGA9Q13797 1035 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 HERC3Q15034 1050 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 SLC14A2Q15849 920 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 ZNF789Q5FWF6 425 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 SPRYD7Q5W111 196 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 DCUN1D2Q6PH85 259 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 C4orf22Q6V702 233 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 RFX6Q8HWS3 928 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 DNAJB3Q8WWF6 145 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 FAM161BQ96MY7 647 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 SPATA13Q96N96 652 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 RBBP8Q99708 897 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 CRISPLD1Q9H336 500 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 ACSS2Q9NR19 701 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 SCOCQ9UIL1 159 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 KIAA1257Q9ULG3 409 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 RAB26Q9ULW5 256 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 PLXNA2O75051 1894 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 FBP2O00757 339 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 COPEO14579 308 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 MAP3K7O43318 606 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 MED7O43513 233 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 CRTAMO95727 393 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 TNNC2P02585 160 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 SERPINE1P05121 402 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 KRT19P08727 400 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 SLC35E2BP0CK96 405 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 SETSIPP0DME0 302 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 KCNA5P22460 613 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 IREB2P48200 963 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 NR2C2P49116 596 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 CXCR3P49682 368 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 BEX3Q00994 111 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 ADIGQ0VDE8 80 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 ADGRE1Q14246 886 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 FAM110CQ1W6H9 321 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 SH2D4BQ5SQS7 431 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 KLHDC10Q6PID8 442 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 ARPINQ7Z6K5 226 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 PGBD5Q8N414 524 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 KLHDC9Q8NEP7 349 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 THTPAQ9BU02 230 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 CALN1Q9BXU9 219 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 IL22Q9GZX6 179 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 CDH19Q9H159 772 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 COG4Q9H9E3 785 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 OLAHQ9NV23 265 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 OXSMQ9NWU1 459 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 RNF181Q9P0P0 153 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 FBXW11Q9UKB1 542 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 IKZF3Q9UKT9 509 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 CDH7Q9ULB5 785 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 ASB14A6NK59 587 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 M0QZQ0 153 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 MAFKO60675 156 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 SMIM24O75264 130 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 ALDH2P05091 517 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 ZCCHC18P0CG32 403 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 CHN2P52757 468 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 AP2B1P63010 937 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 LRP8Q14114 963 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 PDK3Q15120 406 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 NHSL2Q5HYW2 709 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 MDH1BQ5I0G3 518 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 FBXO47Q5MNV8 452 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 PPM1LQ5SGD2 360 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 CES3Q6UWW8 571 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 CMC1Q7Z7K0 106 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 FAM131BQ86XD5 332 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 SCML4Q8N228 414 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 OR52K2Q8NGK3 314 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 ADAM32Q8TC27 787 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 HTR3CQ8WXA8 447 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 NTAN1Q96AB6 310 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 DCUN1D1Q96GG9 259 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 UBXN10Q96LJ8 280 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-203ENST00000420940 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms