RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415055.2

PTPRK-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, human

TSL 5

Gene PTPRK, Length 782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRK-210	ENST00000415055	TMTC2	Q8N394	836 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	CHCHD4	Q8N4Q1	142 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	PAF1	Q8N7H5	531 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	RNF149	Q8NC42	400 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	C3orf20	Q8ND61	904 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	GPR156	Q8NFN8	814 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	PPP1R14C	Q8TAE6	165 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	DEPDC1B	Q8WUY9	529 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	PRPF31	Q8WWY3	499 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	RGMA	Q96B86	450 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	ZFYVE19	Q96K21	471 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	BBC3	Q96PG8	261 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	SORCS2	Q96PQ0	1159 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	TMEM209	Q96SK2	561 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	TACO1	Q9BSH4	297 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	UNK	Q9C0B0	810 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	GLT8D2	Q9H1C3	349 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	MANSC1	Q9H8J5	431 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	CYP4F11	Q9HBI6	524 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	PPP4R1L	Q9P1A2	415 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	FBXO10	Q9UK96	956 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	PTPRD	P23468	1912 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	DENND4C	Q5VZ89	1909 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	BCLAF3	A2AJT9	711 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	CFAP69	A5D8W1	941 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	CYSRT1	A8MQ03	144 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	RHPN2P1	A8MT19	583 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	PATE3	B3GLJ2	98 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	PHGDH	O43175	533 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	PRKCB	P05771	671 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	CYP3A4	P08684	503 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	HSD3B1	P14060	373 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	TACR2	P21452	398 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	HOXA6	P31267	233 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	SFN	P31947	248 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	MCM5	P33992	734 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	CCR2	P41597	374 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	GDF5	P43026	501 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	TRAPPC10	P48553	1259 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	DHPS	P49366	369 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	CASP5	P51878	434 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	DGKE	P52429	567 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	ATXN3	P54252	364 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	NPEPPS	P55786	919 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	IRX4	P78413	519 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	DSC2	Q02487	901 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	PTH1R	Q03431	593 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	SCAP	Q12770	1279 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	TEAD2	Q15562	447 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	HAUS6	Q7Z4H7	955 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	SPRED1	Q7Z699	444 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	TTC30A	Q86WT1	665 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	RALGPS2	Q86X27	583 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	HDDC3	Q8N4P3	179 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	STPG3	Q8N7X2	389 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	FANCB	Q8NB91	859 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	GLB1L3	Q8NCI6	653 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	PIGK	Q92643	395 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	ARL8A	Q96BM9	186 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	MSANTD3	Q96H12	275 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	CEP170P1	Q96L14	293 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	ZNF512	Q96ME7	567 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	CDK5RAP1	Q96SZ6	601 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	TBCB	Q99426	244 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	TMEM168	Q9H0V1	697 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	L2HGDH	Q9H9P8	463 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	TRPV5	Q9NQA5	729 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	DMRT3	Q9NQL9	472 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	DLL4	Q9NR61	685 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	ASAH2	Q9NR71	780 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	POLR3B	Q9NW08	1133 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	GTSE1	Q9NYZ3	720 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	LUZP4	Q9P127	313 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	ARHGAP20	Q9P2F6	1191 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	EVL	Q9UI08	416 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	ZFP69B	Q9UJL9	534 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	CROT	Q9UKG9	612 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	ANK1	P16157	1881 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	AHCTF1	Q8WYP5	2266 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	COL12A1	Q99715	3063 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	TEP1	Q99973	2627 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	IGKV6-21	A0A0C4DH24	114 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRK-210	ENST00000415055	MYBPHL	A2RUH7	354 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRK-210	ENST00000415055	NPEPPSL1	A6NEC2	478 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRK-210	ENST00000415055		H0Y626	953 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRK-210	ENST00000415055		I3L4J1	428 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRK-210	ENST00000415055	SH2B2	O14492	632 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PTPRK-210	ENST00000415055	CDX4	O14627	284 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PTPRK-210	ENST00000415055	CHAD	O15335	359 aa		4.9	□□□□□ -1.63

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