RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415046.6

PTPRK-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 1,029 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-209ENST00000415046 MYO1CO00159 1063 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 MEIS2O14770 477 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 TXNP10599 105 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 RENBPP51606 427 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 SP4Q02446 784 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 GHRHRQ02643 423 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 LAMB3Q13751 1172 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 FGL2Q14314 439 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 STXBP2Q15833 593 aa4.88□□□□□ -1.63
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PTPRK-209ENST00000415046 KRT73Q86Y46 540 aa4.88□□□□□ -1.63
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PTPRK-209ENST00000415046 IZUMO1Q8IYV9 350 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 OR6J1Q8NGC5 347 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa4.88□□□□□ -1.63
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PTPRK-209ENST00000415046 IWS1Q96ST2 819 aa4.88□□□□□ -1.63
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PTPRK-209ENST00000415046 STK36Q9NRP7 1315 aa4.88□□□□□ -1.63
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PTPRK-209ENST00000415046 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 H3BML4 177 aa4.87□□□□□ -1.63
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PTPRK-209ENST00000415046 GGPS1O95749 300 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 MYL3P08590 195 aa4.87□□□□□ -1.63
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PTPRK-209ENST00000415046 GNA11P29992 359 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 KRT17Q04695 432 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 TRIM29Q14134 588 aa4.87□□□□□ -1.63
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PTPRK-209ENST00000415046 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa4.87□□□□□ -1.63
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PTPRK-209ENST00000415046 BLIDQ8IZY5 108 aa4.87□□□□□ -1.63
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PTPRK-209ENST00000415046 KIAA1671Q9BY89 1806 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa4.86□□□□□ -1.63
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PTPRK-209ENST00000415046 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 TRIM38O00635 465 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 PEX14O75381 377 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 GH1P01241 217 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 ZNF286BP0CG31 522 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 GJB2P29033 226 aa4.86□□□□□ -1.63
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PTPRK-209ENST00000415046 NR4A2P43354 598 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 ACLYP53396 1101 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 PSMC6P62333 389 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 E2F1Q01094 437 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 ARHGAP1Q07960 439 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 NPY5RQ15761 445 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 Q4G0T1 1027 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 DUSP28Q4G0W2 176 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 AWAT2Q6E213 333 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 CXCL17Q6UXB2 119 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 ZNF783Q6ZMS7 281 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 ZNF813Q6ZN06 617 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 PLA2G4DQ86XP0 818 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 SLC15A4Q8N697 577 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-209ENST00000415046 PIGOQ8TEQ8 1089 aa4.86□□□□□ -1.63
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