RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414963.2

SF3B1-204, Transcript of splicing factor 3b subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SF3B1, Length 651 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1-204ENST00000414963 PNKPQ96T60 521 aa14.51□□□□□ -0.09
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SF3B1-204ENST00000414963 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
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SF3B1-204ENST00000414963 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
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