RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378543.2

FAAP20-201, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-201ENST00000378543 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 ZMPSTE24O75844 475 aa24.03■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 CHRNA3P32297 505 aa24.03■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 CLCN6P51797 869 aa24.03■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 GNA12Q03113 381 aa24.03■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 ZNF423Q2M1K9 1284 aa24.03■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 FAM72AQ5TYM5 149 aa24.03■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 FAM72DQ6L9T8 149 aa24.03■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 C22orf39Q6P5X5 142 aa24.03■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 DCUN1D2Q6PH85 259 aa24.03■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 FAM72BQ86X60 149 aa24.03■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 CCDC185Q8N715 623 aa24.03■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 CHST14Q8NCH0 376 aa24.03■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 TNKS2Q9H2K2 1166 aa24.03■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 KDM4CQ9H3R0 1056 aa24.03■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 ATP13A1Q9HD20 1204 aa24.03■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 NDFIP2Q9NV92 336 aa24.03■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 BTBD3Q9Y2F9 522 aa24.03■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP24.03■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa24.02■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 A0A1W2PR77 199 aa24.02■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa24.02■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 RNF103O00237 685 aa24.02■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 LATO43561 262 aa24.02■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 C1QTNF9P0C862 333 aa24.02■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 MYBL1P10243 752 aa24.02■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 CD38P28907 300 aa24.02■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 C21orf59P57076 290 aa24.02■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 SCAPQ12770 1279 aa24.02■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa24.02■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 RHBDD1Q8TEB9 315 aa24.02■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 SERAC1Q96JX3 654 aa24.02■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 CCDC114Q96M63 670 aa24.02■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 CNPY3Q9BT09 278 aa24.02■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 IFNKQ9P0W0 207 aa24.02■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa24.02■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 NEU3Q9UQ49 428 aa24.02■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 FLRT2O43155 660 aa24.01■■□□□ 1.43
FAAP20-201ENST00000378543 TRIM16O95361 564 aa24.01■■□□□ 1.43
FAAP20-201ENST00000378543 FTH1P19P0C7X4 201 aa24.01■■□□□ 1.43
FAAP20-201ENST00000378543 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
FAAP20-201ENST00000378543 ACVRL1P37023 503 aa24.01■■□□□ 1.43
FAAP20-201ENST00000378543 CCT8P50990 548 aa24.01■■□□□ 1.43
FAAP20-201ENST00000378543 TAS2R38P59533 333 aa24.01■■□□□ 1.43
FAAP20-201ENST00000378543 ARF5P84085 180 aa24.01■■□□□ 1.43
FAAP20-201ENST00000378543 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
FAAP20-201ENST00000378543 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa24.01■■□□□ 1.43
FAAP20-201ENST00000378543 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa24.01■■□□□ 1.43
FAAP20-201ENST00000378543 RETSATQ6NUM9 610 aa24.01■■□□□ 1.43
FAAP20-201ENST00000378543 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
FAAP20-201ENST00000378543 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa24.01■■□□□ 1.43
FAAP20-201ENST00000378543 GLRX5Q86SX6 157 aa24.01■■□□□ 1.43
FAAP20-201ENST00000378543 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
FAAP20-201ENST00000378543 NLRP14Q86W24 1093 aa24.01■■□□□ 1.43
FAAP20-201ENST00000378543 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
FAAP20-201ENST00000378543 ARRDC3Q96B67 414 aa24.01■■□□□ 1.43
FAAP20-201ENST00000378543 MCEEQ96PE7 176 aa24.01■■□□□ 1.43
FAAP20-201ENST00000378543 KLK13Q9UKR3 277 aa24.01■■□□□ 1.43
FAAP20-201ENST00000378543 ACTL7AQ9Y615 435 aa24.01■■□□□ 1.43
FAAP20-201ENST00000378543 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
FAAP20-201ENST00000378543 CCP110O43303 1012 aa24■■□□□ 1.43
FAAP20-201ENST00000378543 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
FAAP20-201ENST00000378543 LRIG2O94898 1065 aa24■■□□□ 1.43
FAAP20-201ENST00000378543 PROS1P07225 676 aa24■■□□□ 1.43
FAAP20-201ENST00000378543 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
FAAP20-201ENST00000378543 RHOQP17081 205 aa24■■□□□ 1.43
FAAP20-201ENST00000378543 ETFBP38117 255 aa24■■□□□ 1.43
FAAP20-201ENST00000378543 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
FAAP20-201ENST00000378543 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
FAAP20-201ENST00000378543 IL9RQ01113 521 aa24■■□□□ 1.43
FAAP20-201ENST00000378543 TRIM14Q14142 442 aa24■■□□□ 1.43
FAAP20-201ENST00000378543 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa24■■□□□ 1.43
FAAP20-201ENST00000378543 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
FAAP20-201ENST00000378543 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa24■■□□□ 1.43
FAAP20-201ENST00000378543 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
FAAP20-201ENST00000378543 PNPLA1Q8N8W4 532 aa24■■□□□ 1.43
FAAP20-201ENST00000378543 TMIEQ8NEW7 156 aa24■■□□□ 1.43
FAAP20-201ENST00000378543 TMEM248Q9NWD8 314 aa24■■□□□ 1.43
FAAP20-201ENST00000378543 TAS2R14Q9NYV8 317 aa24■■□□□ 1.43
FAAP20-201ENST00000378543 DNAI1Q9UI46 699 aa24■■□□□ 1.43
FAAP20-201ENST00000378543 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa24■■□□□ 1.43
FAAP20-201ENST00000378543 SCINQ9Y6U3 715 aa24■■□□□ 1.43
FAAP20-201ENST00000378543 USP24Q9UPU5 2620 aa24■■□□□ 1.43
FAAP20-201ENST00000378543 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP23.99■■□□□ 1.432e-8■■■■□ 23.1
FAAP20-201ENST00000378543 CD160O95971 181 aa23.99■■□□□ 1.43
FAAP20-201ENST00000378543 FTLP02792 175 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
FAAP20-201ENST00000378543 SERPING1P05155 500 aa23.99■■□□□ 1.43
FAAP20-201ENST00000378543 SLC20A2Q08357 652 aa23.99■■□□□ 1.43
FAAP20-201ENST00000378543 MAMLD1Q13495 774 aa23.99■■□□□ 1.43
FAAP20-201ENST00000378543 ARSIQ5FYB1 569 aa23.99■■□□□ 1.43
FAAP20-201ENST00000378543 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa23.99■■□□□ 1.43
FAAP20-201ENST00000378543 SLFN11Q7Z7L1 901 aa23.99■■□□□ 1.43
FAAP20-201ENST00000378543 SLCO6A1Q86UG4 719 aa23.99■■□□□ 1.43
FAAP20-201ENST00000378543 TRIM69Q86WT6 500 aa23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.2 ms