RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368210.7

PTPRK-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRK, Length 5,025 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-204ENST00000368210 MAPK11Q15759 364 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 KLHL12Q53G59 568 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 NAT14Q8WUY8 206 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 LRMDAQ9H2I8 198 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 PREBQ9HCU5 417 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 NMRK1Q9NWW6 199 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 VTI1BQ9UEU0 232 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 PRR23AA6NEV1 266 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 PDZK1P1A8MUH7 402 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 STK25O00506 426 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 PEX10O60683 326 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 USP1O94782 785 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 ERBB2P04626 1255 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 ERCC2P18074 760 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 ABCG1P45844 678 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 ITGA7Q13683 1181 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 LCLAT1Q6UWP7 414 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 MON1BQ7L1V2 547 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 POU5F2Q8N7G0 328 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 LGMNQ99538 433 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 RAD54BQ9Y620 910 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 ZNF541Q9H0D2 1346 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 CENPXA8MT69 81 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 NR5A2O00482 541 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 TPP1O14773 563 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 MMP13P45452 471 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 TRAF2Q12933 501 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 CERS2Q96G23 380 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 FANCEQ9HB96 536 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 TAS2R13Q9NYV9 303 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 EFR3BQ9Y2G0 817 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 COL1A2P08123 1366 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 TTLL13PA6NNM8 815 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 TSPAN3O60637 253 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 NFYCQ13952 458 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 PDK4Q16654 411 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 ARMC4Q5T2S8 1044 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 HPS1Q92902 700 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 LPPQ93052 612 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 GINS4Q9BRT9 223 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 CDHR5Q9HBB8 845 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 KCNK4Q9NYG8 393 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 SLC25A13Q9UJS0 675 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 SNX13Q9Y5W8 968 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 MED26O95402 600 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 RNF43Q68DV7 783 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 ITIH5Q86UX2 942 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 FNIP1Q8TF40 1166 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 PCDH18Q9HCL0 1135 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 SIX2Q9NPC8 291 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 SPASTQ9UBP0 616 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 ITM2BQ9Y287 266 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 DERAQ9Y315 318 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 SPEF1Q9Y4P9 236 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 CLDN5O00501 218 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 CILPO75339 1184 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 RPL9P32969 192 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 NCALDP61601 193 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 UNC5AQ6ZN44 842 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 ANKS3Q6ZW76 656 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 DAW1Q8N136 415 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 C1orf127Q8N9H9 656 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 OR6Y1Q8NGX8 325 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 SNTNA6NMZ2 147 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 SPTLC1O15269 473 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 RAD51BO15315 384 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 DCXO43602 365 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 CABYRO75952 493 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 DARSP14868 501 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 ZNF12P17014 697 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 NFKB1P19838 968 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 XIAPP98170 497 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 SPIRE1Q08AE8 756 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 PCID2Q5JVF3 399 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 C9orf57Q5W0N0 161 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 AMIGO3Q86WK7 504 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 LRRN4Q8WUT4 740 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRK-204ENST00000368210 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.1 ms