RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367576.5

LTV1-201, Transcript of LTV1 ribosome biogenesis factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTV1, Length 1,847 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1-201ENST00000367576 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 GRXCR2A6NFK2 248 aa18.09■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 NDC80O14777 642 aa18.09■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 GRIA1P42261 906 aa18.09■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 DSC2Q02487 901 aa18.09■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 FNBP1LQ5T0N5 605 aa18.09■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 RNF135Q8IUD6 432 aa18.09■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 DCAF4L2Q8NA75 395 aa18.09■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 FGF14Q92915 247 aa18.09■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP18.09■□□□□ 0.495e-7■■■■□ 23.6
LTV1-201ENST00000367576 SAYSD1Q9NPB0 183 aa18.09■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 OBP2AQ9NY56 170 aa18.09■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 MUSKO15146 869 aa18.09■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 USP12O75317 370 aa18.09■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 AVILO75366 819 aa18.09■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 ZMPSTE24O75844 475 aa18.09■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 HIF1AQ16665 826 aa18.09■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 PLEKHG6Q3KR16 790 aa18.09■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 FUT11Q495W5 492 aa18.09■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 MSS51Q4VC12 460 aa18.09■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 PITRM1Q5JRX3 1037 aa18.09■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 C12orf40Q86WS4 652 aa18.09■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 YAF2Q8IY57 180 aa18.09■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 FATE1Q969F0 183 aa18.09■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 EXOC2Q96KP1 924 aa18.09■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 APOL2Q9BQE5 337 aa18.09■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 MARK1Q9P0L2 795 aa18.09■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 REV3LO60673 3130 aa18.08■□□□□ 0.49
LTV1-201ENST00000367576 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
LTV1-201ENST00000367576 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
LTV1-201ENST00000367576 ADH1CP00326 375 aa18.08■□□□□ 0.48
LTV1-201ENST00000367576 TPSB2P20231 275 aa18.08■□□□□ 0.48
LTV1-201ENST00000367576 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
LTV1-201ENST00000367576 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
LTV1-201ENST00000367576 MAGEA6P43360 314 aa18.08■□□□□ 0.48
LTV1-201ENST00000367576 ARL4CP56559 192 aa18.08■□□□□ 0.48
LTV1-201ENST00000367576 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
LTV1-201ENST00000367576 PRPSAP1Q14558 356 aa18.08■□□□□ 0.48
LTV1-201ENST00000367576 CASP8Q14790 479 aa18.08■□□□□ 0.48
LTV1-201ENST00000367576 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
LTV1-201ENST00000367576 TPSAB1Q15661 275 aa18.08■□□□□ 0.48
LTV1-201ENST00000367576 BBS9Q3SYG4 887 aa18.08■□□□□ 0.48
LTV1-201ENST00000367576 TEX26Q8N6G2 289 aa18.08■□□□□ 0.48
LTV1-201ENST00000367576 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
LTV1-201ENST00000367576 LMLNQ96KR4 655 aa18.08■□□□□ 0.48
LTV1-201ENST00000367576 ZNF599Q96NL3 588 aa18.08■□□□□ 0.48
LTV1-201ENST00000367576 HPS4Q9NQG7 708 aa18.08■□□□□ 0.48
LTV1-201ENST00000367576 GGA2Q9UJY4 613 aa18.08■□□□□ 0.48
LTV1-201ENST00000367576 CHD5Q8TDI0 1954 aa18.08■□□□□ 0.48
LTV1-201ENST00000367576 K7ERQ8 282 aa18.07■□□□□ 0.48
LTV1-201ENST00000367576 PPFIA2O75334 1257 aa18.07■□□□□ 0.48
LTV1-201ENST00000367576 NFATC1O95644 943 aa18.07■□□□□ 0.48
LTV1-201ENST00000367576 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
LTV1-201ENST00000367576 PMS2P54278 862 aa18.07■□□□□ 0.48
LTV1-201ENST00000367576 NIPAL4Q0D2K0 466 aa18.07■□□□□ 0.48
LTV1-201ENST00000367576 ZNF534Q76KX8 674 aa18.07■□□□□ 0.48
LTV1-201ENST00000367576 ANKMY2Q8IV38 441 aa18.07■□□□□ 0.48
LTV1-201ENST00000367576 SUSD6Q92537 303 aa18.07■□□□□ 0.48
LTV1-201ENST00000367576 ATP2A3Q93084 1043 aa18.07■□□□□ 0.48
LTV1-201ENST00000367576 NECTIN4Q96NY8 510 aa18.07■□□□□ 0.48
LTV1-201ENST00000367576 SERPINB12Q96P63 405 aa18.07■□□□□ 0.48
LTV1-201ENST00000367576 FCRL5Q96RD9 977 aa18.07■□□□□ 0.48
LTV1-201ENST00000367576 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
LTV1-201ENST00000367576 TXLNGYQ9BZA5 131 aa18.07■□□□□ 0.48
LTV1-201ENST00000367576 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
LTV1-201ENST00000367576 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
LTV1-201ENST00000367576 DOCK8Q8NF50 2099 aa18.07■□□□□ 0.48
LTV1-201ENST00000367576 MYOFQ9NZM1 2061 aa18.07■□□□□ 0.48
LTV1-201ENST00000367576 PMPCBO75439 489 aa18.07■□□□□ 0.48
LTV1-201ENST00000367576 SASH3O75995 380 aa18.07■□□□□ 0.48
LTV1-201ENST00000367576 TMCC1O94876 653 aa18.07■□□□□ 0.48
LTV1-201ENST00000367576 CD160O95971 181 aa18.07■□□□□ 0.48
LTV1-201ENST00000367576 MT-CO1P00395 513 aa18.07■□□□□ 0.48
LTV1-201ENST00000367576 FOSL2P15408 326 aa18.07■□□□□ 0.48
LTV1-201ENST00000367576 CD86P42081 329 aa18.07■□□□□ 0.48
LTV1-201ENST00000367576 RGRP47804 291 aa18.07■□□□□ 0.48
LTV1-201ENST00000367576 CYTH1Q15438 398 aa18.07■□□□□ 0.48
LTV1-201ENST00000367576 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
LTV1-201ENST00000367576 PCSK7Q16549 785 aa18.07■□□□□ 0.48
LTV1-201ENST00000367576 CENPUQ71F23 418 aa18.07■□□□□ 0.48
LTV1-201ENST00000367576 KDELC2Q7Z4H8 507 aa18.07■□□□□ 0.48
LTV1-201ENST00000367576 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
LTV1-201ENST00000367576 MFSD6LQ8IWD5 586 aa18.07■□□□□ 0.48
LTV1-201ENST00000367576 IPMKQ8NFU5 416 aa18.07■□□□□ 0.48
LTV1-201ENST00000367576 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
LTV1-201ENST00000367576 C9orf72Q96LT7 481 aa18.07■□□□□ 0.48
LTV1-201ENST00000367576 FAM83CQ9BQN1 747 aa18.07■□□□□ 0.48
LTV1-201ENST00000367576 FUT8Q9BYC5 575 aa18.07■□□□□ 0.48
LTV1-201ENST00000367576 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
LTV1-201ENST00000367576 SEMA4AQ9H3S1 761 aa18.07■□□□□ 0.48
LTV1-201ENST00000367576 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
LTV1-201ENST00000367576 SEPT3Q9UH03 358 aa18.07■□□□□ 0.48
LTV1-201ENST00000367576 COL4A3Q01955 1670 aa18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms