RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284073.6

MSI2-201, Transcript of musashi RNA binding protein 2, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene MSI2, Length 6,364 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI2-201ENST00000284073 ERAP1Q9NZ08 941 aa16■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 ERGIC3Q9Y282 383 aa16■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 SALL1Q9NSC2 1324 aa16■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 TTLL13PA6NNM8 815 aa16■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 STX11O75558 287 aa16■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 FMO4P31512 558 aa16■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 ADAM32Q8TC27 787 aa16■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 KAZALD1Q96I82 304 aa16■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 VCPIP1Q96JH7 1222 aa16■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 ACSS3Q9H6R3 686 aa16■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 MARCH7Q9H992 704 aa16■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 COMMD9Q9P000 198 aa16■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 CHADO15335 359 aa16■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 ITGA2BP08514 1039 aa16■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 SLC2A3P11169 496 aa16■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 PPP2R1BP30154 601 aa16■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 SREBF1P36956 1147 aa16■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 ST8SIA6P61647 398 aa16■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 PACS1Q6VY07 963 aa16■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 GK5Q6ZS86 529 aa16■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 TMEM110Q86TL2 294 aa16■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 RTKNQ9BST9 563 aa16■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 PREBQ9HCU5 417 aa16■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa16■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 A0A1W2PQ72 361 aa16■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 UBE2QL1A1L167 161 aa16■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 MICAL2O94851 1124 aa16■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 EPN2O95208 641 aa16■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 F9P00740 461 aa16■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 ACLYP53396 1101 aa16■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 CDH8P55286 799 aa16■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 DPYSQ14117 519 aa16■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 OGFOD2Q6N063 350 aa16■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 SKA1Q96BD8 255 aa16■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 CPB2Q96IY4 423 aa16■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 TAS2R13Q9NYV9 303 aa16■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 FAM50BQ9Y247 325 aa16■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 FAM149AA5PLN7 773 aa16■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 UBXN8O00124 270 aa16■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 ASS1P00966 412 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 PSMB4P28070 264 aa16■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 PLET1Q6UQ28 207 aa16■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 PPP1R14AQ96A00 147 aa16■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 PTGFRNQ9P2B2 879 aa16■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 RAP2CQ9Y3L5 183 aa16■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 A0A087X1B8 175 aa15.99■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 PRLP01236 227 aa15.99■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 ITGALP20701 1170 aa15.99■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 NAB1Q13506 487 aa15.99■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 RFX4Q33E94 735 aa15.99■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 MPZL3Q6UWV2 235 aa15.99■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 WDR49Q8IV35 697 aa15.99■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 TBC1D16Q8TBP0 767 aa15.99■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 ALG3Q92685 438 aa15.99■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 STAG3L1P0CL83 205 aa15.99■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 SPPL2CQ8IUH8 684 aa15.99■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 DYRK1BQ9Y463 629 aa15.99■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 RGS14O43566 566 aa15.99■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 IFI30P13284 250 aa15.99■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 TKTP29401 623 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 RCVRNP35243 200 aa15.99■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 NAMPTP43490 491 aa15.99■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa15.99■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 GALNT5Q7Z7M9 940 aa15.99■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 CDK20Q8IZL9 346 aa15.99■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 TTLL6Q8N841 843 aa15.99■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 CYP2W1Q8TAV3 490 aa15.99■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 TBL1YQ9BQ87 522 aa15.99■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 MCUBQ9NWR8 336 aa15.99■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa15.99■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa15.99■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 TMEM94Q12767 1356 aa15.99■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa15.99■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 G3V2T6 193 aa15.99■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 HGFP14210 728 aa15.99■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 IST1P53990 364 aa15.99■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 STARD3Q14849 445 aa15.99■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 TMEM119Q4V9L6 283 aa15.99■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 CDH19Q9H159 772 aa15.99■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 ALDH4A1P30038 563 aa15.99■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 BNIP2Q12982 314 aa15.99■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 FAM187BQ17R55 369 aa15.99■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP15.99■□□□□ 0.152e-6■■■■□ 23.4
MSI2-201ENST00000284073 ALDH1A1P00352 501 aa15.98■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 CXCL8P10145 99 aa15.98■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
MSI2-201ENST00000284073 CRATP43155 626 aa15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.8 ms