RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283351.8

TRAPPC8-201, Transcript of trafficking protein particle complex 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC8, Length 6,226 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8-201ENST00000283351 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 SF1Q15637 639 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 CATSPER2Q96P56 530 aa14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 STBD1O95210 358 aa14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 MPOP05164 745 aa14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 CD44P16070 742 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 PTPN2P17706 415 aa14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 PRMT2P55345 433 aa14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 C16orf46Q6P387 395 aa14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 KIF2BQ8N4N8 673 aa14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 NSL1Q96IY1 281 aa14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 YIPF3Q9GZM5 350 aa14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 ISCUQ9H1K1 167 aa14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 DUSP12Q9UNI6 340 aa14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 CRABP2P29373 138 aa14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 S100A3P33764 101 aa14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 RPL4P36578 427 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 DGKKQ5KSL6 1271 aa14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 ARMCX6Q7L4S7 300 aa14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 FEM1CQ96JP0 617 aa14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 KBTBD4Q9NVX7 518 aa14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 VGLL3A8MV65 326 aa14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 ZNF536O15090 1300 aa14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 FRMPD4Q14CM0 1322 aa14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 AMZ1Q400G9 498 aa14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 FAM151BQ6UXP7 276 aa14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 KRT73Q86Y46 540 aa14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 ZNF786Q8N393 782 aa14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 MCIDASD6RGH6 385 aa14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 KPNA5O15131 536 aa14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 CALCAP01258 141 aa14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 CDH3P22223 829 aa14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 CNTFP26441 200 aa14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 ELK3P41970 407 aa14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 AQP5P55064 265 aa14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 C2orf27AQ580R0 203 aa14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 ZNF248Q8NDW4 579 aa14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 SPPL2BQ8TCT7 592 aa14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 HMGB4Q8WW32 186 aa14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 ZBTB10Q96DT7 871 aa14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 ZDHHC9Q9Y397 364 aa14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 CNTNAP1P78357 1384 aa14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 UGT2B4P06133 528 aa14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 IGFALSP35858 605 aa14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 PCYT1AP49585 367 aa14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP14.93□□□□□ -0.023e-6■■■■□ 20.7
TRAPPC8-201ENST00000283351 MTAPQ13126 283 aa14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 UXS1Q8NBZ7 420 aa14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 ZFP28Q8NHY6 868 aa14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 C10orf88Q9H8K7 445 aa14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 ABI3Q9P2A4 366 aa14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 CPED1A4D0V7 1026 aa14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 MAGEC1O60732 1142 aa14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 LGR5O75473 907 aa14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 GP5P40197 560 aa14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 CRHR2Q13324 411 aa14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 OLFM3Q96PB7 478 aa14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 TMEM237Q96Q45 408 aa14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 IQGAP3Q86VI3 1631 aa14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP14.93□□□□□ -0.023e-7■□□□□ 8.1
TRAPPC8-201ENST00000283351 GCNT1Q02742 428 aa14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 TLE2Q04725 743 aa14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 XKR6Q5GH73 641 aa14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 FAM171BQ6P995 826 aa14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 HOMEZQ8IX15 550 aa14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 MDM1Q8TC05 714 aa14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 SLC38A3Q99624 504 aa14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 ADPRHL2Q9NX46 363 aa14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 NRXN1Q9ULB1 1477 aa14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 A0A096LPK6 155 aa14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 FFAR3O14843 346 aa14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 GPR42O15529 346 aa14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 RPL17P18621 184 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 RBL1P28749 1068 aa14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 POLD2P49005 469 aa14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 MPPE1Q53F39 396 aa14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 SPANXN3Q5MJ09 141 aa14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 GRTP1Q5TC63 336 aa14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 VAT1Q99536 393 aa14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 ARHGEF3Q9NR81 526 aa14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC8-201ENST00000283351 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms