RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265339.6

UBE2B-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2B, Length 2,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-201ENST00000265339 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 GSTA5Q7RTV2 222 aa20.72■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 RFX6Q8HWS3 928 aa20.72■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF276Q8N554 614 aa20.72■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 CCDC89Q8N998 374 aa20.72■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 TIFAQ96CG3 184 aa20.72■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 FAF2Q96CS3 445 aa20.72■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 LRRC3Q9BY71 257 aa20.72■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 LMAN2LQ9H0V9 348 aa20.72■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa20.72■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 CST8O60676 142 aa20.71■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 HAUS5O94927 633 aa20.71■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 C1RP00736 705 aa20.71■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 P3H1Q32P28 736 aa20.71■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 CFAP157Q5JU67 520 aa20.71■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 HECTD3Q5T447 861 aa20.71■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 CHRDL2Q6WN34 429 aa20.71■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 TRIM42Q8IWZ5 723 aa20.71■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 DENND1AQ8TEH3 1009 aa20.71■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 MAML1Q92585 1016 aa20.71■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 OLFM3Q96PB7 478 aa20.71■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 RNF157Q96PX1 679 aa20.71■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 PRO3102Q9H379 93 aa20.71■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 SNX10Q9Y5X0 201 aa20.71■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa20.71■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 C2orf78A6NCI8 922 aa20.71■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 FAM72CH0Y354 149 aa20.71■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 RFXAPO00287 272 aa20.71■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 COCHO43405 550 aa20.71■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 GOT1P17174 413 aa20.71■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 MAGEA4P43358 317 aa20.71■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 TBX4P57082 545 aa20.71■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 PPP2R5DQ14738 602 aa20.71■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 FAM72AQ5TYM5 149 aa20.71■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 FAM72DQ6L9T8 149 aa20.71■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 RGS9BPQ6ZS82 235 aa20.71■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 BBS12Q6ZW61 710 aa20.71■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 SPATA24Q86W54 205 aa20.71■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 FAM72BQ86X60 149 aa20.71■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 ELMOD1Q8N336 334 aa20.71■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 NAT14Q8WUY8 206 aa20.71■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 CSPG4P5Q96PW8 444 aa20.71■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 TRABDQ9H4I3 376 aa20.71■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 EURLQ9NYK6 297 aa20.71■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 CHMP2BQ9UQN3 213 aa20.71■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 SLC12A8A0AV02 714 aa20.7■□□□□ 0.9
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF487B1APH4 448 aa20.7■□□□□ 0.9
UBE2B-201ENST00000265339 CA4P22748 312 aa20.7■□□□□ 0.9
UBE2B-201ENST00000265339 PPP3CCP48454 512 aa20.7■□□□□ 0.9
UBE2B-201ENST00000265339 SEMA3BQ13214 749 aa20.7■□□□□ 0.9
UBE2B-201ENST00000265339 MAP7Q14244 749 aa20.7■□□□□ 0.9
UBE2B-201ENST00000265339 CCNG2Q16589 344 aa20.7■□□□□ 0.9
UBE2B-201ENST00000265339 RINLQ6ZS11 566 aa20.7■□□□□ 0.9
UBE2B-201ENST00000265339 TRABD2AQ86V40 505 aa20.7■□□□□ 0.9
UBE2B-201ENST00000265339 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
UBE2B-201ENST00000265339 PQLC3Q8N755 202 aa20.7■□□□□ 0.9
UBE2B-201ENST00000265339 PCDH19Q8TAB3 1148 aa20.7■□□□□ 0.9
UBE2B-201ENST00000265339 HAUS1Q96CS2 278 aa20.7■□□□□ 0.9
UBE2B-201ENST00000265339 NSL1Q96IY1 281 aa20.7■□□□□ 0.9
UBE2B-201ENST00000265339 CCDC28BQ9BUN5 200 aa20.7■□□□□ 0.9
UBE2B-201ENST00000265339 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
UBE2B-201ENST00000265339 DNMT3LQ9UJW3 386 aa20.7■□□□□ 0.9
UBE2B-201ENST00000265339 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa20.7■□□□□ 0.9
UBE2B-201ENST00000265339 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa20.7■□□□□ 0.9
UBE2B-201ENST00000265339 KCNU1A8MYU2 1149 aa20.7■□□□□ 0.9
UBE2B-201ENST00000265339 ASLP04424 464 aa20.7■□□□□ 0.9
UBE2B-201ENST00000265339 AMPD1P23109 780 aa20.7■□□□□ 0.9
UBE2B-201ENST00000265339 GABRR2P28476 465 aa20.7■□□□□ 0.9
UBE2B-201ENST00000265339 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
UBE2B-201ENST00000265339 RGS19P49795 217 aa20.7■□□□□ 0.9
UBE2B-201ENST00000265339 OVGP1Q12889 678 aa20.7■□□□□ 0.9
UBE2B-201ENST00000265339 MTA1Q13330 715 aa20.7■□□□□ 0.9
UBE2B-201ENST00000265339 SLC1A5Q15758 541 aa20.7■□□□□ 0.9
UBE2B-201ENST00000265339 GAREM2Q75VX8 874 aa20.7■□□□□ 0.9
UBE2B-201ENST00000265339 RTL10Q7L3V2 364 aa20.7■□□□□ 0.9
UBE2B-201ENST00000265339 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
UBE2B-201ENST00000265339 DENND4CQ5VZ89 1909 aa20.7■□□□□ 0.9
UBE2B-201ENST00000265339 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
UBE2B-201ENST00000265339 OPHN1O60890 802 aa20.69■□□□□ 0.9
UBE2B-201ENST00000265339 IGLV3-27P01718 113 aa20.69■□□□□ 0.9
UBE2B-201ENST00000265339 KRT15P19012 456 aa20.69■□□□□ 0.9
UBE2B-201ENST00000265339 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
UBE2B-201ENST00000265339 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
UBE2B-201ENST00000265339 KLHDC10Q6PID8 442 aa20.69■□□□□ 0.9
UBE2B-201ENST00000265339 GLIS1Q8NBF1 620 aa20.69■□□□□ 0.9
UBE2B-201ENST00000265339 BBOF1Q8ND07 529 aa20.69■□□□□ 0.9
UBE2B-201ENST00000265339 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
UBE2B-201ENST00000265339 SAYSD1Q9NPB0 183 aa20.69■□□□□ 0.9
UBE2B-201ENST00000265339 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa20.69■□□□□ 0.9
UBE2B-201ENST00000265339 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
UBE2B-201ENST00000265339 GMEB1Q9Y692 573 aa20.69■□□□□ 0.9
UBE2B-201ENST00000265339 A0A0G2JND7 137 aa20.69■□□□□ 0.9
UBE2B-201ENST00000265339 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms