RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 PMS2CLQ68D20 193 aa7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 CD300LGQ6UXG3 332 aa7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 ANKS3Q6ZW76 656 aa7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 RTL10Q7L3V2 364 aa7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 ARMCX6Q7L4S7 300 aa7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 VSIG1Q86XK7 387 aa7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 PARP9Q8IXQ6 854 aa7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 PALM2Q8IXS6 379 aa7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 TCEAL8Q8IYN2 117 aa7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 ELMOD1Q8N336 334 aa7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 SYNPOQ8N3V7 929 aa7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC35B2Q8TB61 432 aa7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 LRRC8CQ8TDW0 803 aa7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 PYROXD1Q8WU10 500 aa7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 PIGKQ92643 395 aa7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 CHFRQ96EP1 664 aa7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM176AQ96HP8 235 aa7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 C9orf72Q96LT7 481 aa7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM209Q96SK2 561 aa7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 FERMT1Q9BQL6 677 aa7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 TPSD1Q9BZJ3 242 aa7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 CDT1Q9H211 546 aa7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 TRABDQ9H4I3 376 aa7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 PTPRHQ9HD43 1115 aa7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 DERAQ9Y315 318 aa7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 URB1O60287 2271 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 TSC2P49815 1807 aa7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 UNC79Q9P2D8 2635 aa7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 F8VP50 259 aa7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 ABLIM1O14639 778 aa7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 XPOTO43592 962 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 PRPSAP2O60256 369 aa7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 CST8O60676 142 aa7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 CILPO75339 1184 aa7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 GJB6O95452 261 aa7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 PRAMEF12O95522 483 aa7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 APBB3O95704 486 aa7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 ERBB2P04626 1255 aa7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 GSTA2P09210 222 aa7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 PLA2G2AP14555 144 aa7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 ENGP17813 658 aa7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 GPD1P21695 349 aa7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 TNFSF9P41273 254 aa7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 MSH2P43246 934 aa7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 ASPAP45381 313 aa7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 DGKEP52429 567 aa7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 KRT81Q14533 505 aa7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 AGERQ15109 404 aa7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 LLGL1Q15334 1064 aa7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 TAZQ16635 292 aa7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 WDR72Q3MJ13 1102 aa7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF394Q53GI3 561 aa7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 BOLA3Q53S33 107 aa7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 C2CD6Q53TS8 623 aa7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 TRIM61Q5EBN2 209 aa7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 LGSNQ5TDP6 509 aa7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 FBXW10Q5XX13 1052 aa7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC8B1Q6J4K2 584 aa7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 DENND1BQ6P3S1 775 aa7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 VSTM1Q6UX27 236 aa7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 RGS9BPQ6ZS82 235 aa7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 PIP4P1Q86T03 277 aa7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 TRABD2AQ86V40 505 aa7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 XYLT1Q86Y38 959 aa7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 TRIM42Q8IWZ5 723 aa7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 ZBED8Q8IZ13 594 aa7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC4A11Q8NBS3 891 aa7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 OR2I1PQ8NGU4 316 aa7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 ELMO3Q96BJ8 720 aa7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 HPDLQ96IR7 371 aa7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 ACAP3Q96P50 834 aa7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 TSPAN18Q96SJ8 248 aa7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 CYTH2Q99418 400 aa7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 TBCBQ99426 244 aa7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 CNPY3Q9BT09 278 aa7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 NT5C1AQ9BXI3 368 aa7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 PITPNM3Q9BZ71 974 aa7.22□□□□□ -1.25
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