RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262291.8

VMP1-201, Transcript of vacuole membrane protein 1, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VMP1, Length 2,712 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VMP1-201	ENST00000262291	STRA8	Q7Z7C7	330 aa		13.81	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	CHSY1	Q86X52	802 aa		13.81	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	SERBP1	Q8NC51	408 aa	Known RBP eCLIP	13.81	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	PSMG2	Q969U7	264 aa		13.81	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	ZNF512	Q96ME7	567 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	NACA2	Q9H009	215 aa		13.81	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	LRRC40	Q9H9A6	602 aa		13.81	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	KLHL14	Q9P2G3	628 aa		13.81	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	TXNDC16	Q9P2K2	825 aa		13.81	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	SLC2A6	Q9UGQ3	507 aa		13.81	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		13.81	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	PLLP	Q9Y342	182 aa		13.81	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	ZCWPW2	A0A1B0GU75	182 aa		13.8	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	MATN3	O15232	486 aa		13.8	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	FGF10	O15520	208 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	MTSS1	O43312	755 aa		13.8	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	ITGA2B	P08514	1039 aa		13.8	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	GSTA2	P09210	222 aa		13.8	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	SPATA31D3	P0C874	917 aa		13.8	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	IRF1	P10914	325 aa		13.8	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	ACVRL1	P37023	503 aa		13.8	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	SLC10A7	Q0GE19	358 aa		13.8	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	SEPT6	Q14141	434 aa		13.8	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	NADSYN1	Q6IA69	706 aa		13.8	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	MSANTD2	Q6P1R3	559 aa		13.8	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		13.8	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	LRRC43	Q8N309	656 aa		13.8	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	CDKL2	Q92772	493 aa		13.8	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	KLHL29	Q96CT2	875 aa		13.8	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	VPS11	Q9H270	941 aa		13.8	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	GKN1	Q9NS71	199 aa		13.8	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	MARCO	Q9UEW3	520 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291		A0A0G2JND7	137 aa		13.8	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	KIT	P10721	976 aa		13.8	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	HOXC13	P31276	330 aa		13.8	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	CA8	P35219	290 aa		13.8	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	DEFB103A	P81534	67 aa		13.8	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	CBLB	Q13191	982 aa		13.8	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	ANKS3	Q6ZW76	656 aa		13.8	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	MARK2	Q7KZI7	788 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	ZNF683	Q8IZ20	524 aa		13.8	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	B4GALNT2	Q8NHY0	566 aa		13.8	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	SPPL2B	Q8TCT7	592 aa		13.8	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	VWCE	Q96DN2	955 aa		13.8	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	NAF1	Q96HR8	494 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	TBL1Y	Q9BQ87	522 aa		13.8	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	ACSS2	Q9NR19	701 aa		13.8	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	ACR	P10323	421 aa		13.79	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	ALAD	P13716	330 aa		13.79	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	CCND1	P24385	295 aa		13.79	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	ITGB8	P26012	769 aa		13.79	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	DSC2	Q02487	901 aa		13.79	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	IHH	Q14623	411 aa		13.79	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	CHI3L2	Q15782	390 aa		13.79	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	DRAXIN	Q8NBI3	349 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	APBB2	Q92870	758 aa		13.79	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	TSSK1B	Q9BXA7	367 aa		13.79	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	MRPL9	Q9BYD2	267 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	ZYG11B	Q9C0D3	744 aa		13.79	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	CWH43	Q9H720	699 aa		13.79	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	MTO1	Q9Y2Z2	717 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	NUMBL	Q9Y6R0	609 aa		13.79	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	CCL22	O00626	93 aa		13.79	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	DHRS4L1	P0CG22	281 aa		13.79	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	PRMT2	P55345	433 aa		13.79	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	RPL10A	P62906	217 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	PDCD2	Q16342	344 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	KCNMB4	Q86W47	210 aa		13.79	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	LGI2	Q8N0V4	545 aa		13.79	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	ARHGAP18	Q8N392	663 aa		13.79	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	DCLK2	Q8N568	766 aa		13.79	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	ATP6V0D2	Q8N8Y2	350 aa		13.79	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	TSGA13	Q96PP4	275 aa		13.79	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	IL12RB2	Q99665	862 aa		13.79	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	UNK	Q9C0B0	810 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		13.79	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		13.79	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	IL37	Q9NZH6	218 aa		13.79	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		13.79	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	STARD13	Q9Y3M8	1113 aa		13.79	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	CFAP73	A6NFT4	308 aa		13.78	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291		H7C4K7	107 aa		13.78	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	GSTA1	P08263	222 aa		13.78	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	KCNA4	P22459	653 aa		13.78	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	CD86	P42081	329 aa		13.78	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	ZNF135	P52742	658 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	SPANXN3	Q5MJ09	141 aa		13.78	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	N4BP2L1	Q5TBK1	243 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	ESRP1	Q6NXG1	681 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	WBP2	Q969T9	261 aa		13.78	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	ERP27	Q96DN0	273 aa		13.78	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	VAT1	Q99536	393 aa		13.78	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	CLSTN3	Q9BQT9	956 aa		13.78	□□□□□ -0.2
VMP1-201	ENST00000262291	FSD1L	Q9BXM9	530 aa		13.78	□□□□□ -0.2

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