RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249504.6

HOXD11-201, Transcript of homeobox D11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene HOXD11, Length 1,533 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11-201ENST00000249504 DCAF4L2Q8NA75 395 aa19.86■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 TSGA13Q96PP4 275 aa19.86■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 SPON2Q9BUD6 331 aa19.86■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 ATP13A1Q9HD20 1204 aa19.86■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa19.86■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 SLC25A13Q9UJS0 675 aa19.86■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 HCN2Q9UL51 889 aa19.86■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 DNPEPQ9ULA0 475 aa19.86■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 MMP17Q9ULZ9 603 aa19.86■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF318Q5VUA4 2279 aa19.86■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa19.86■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 HACD1B0YJ81 288 aa19.86■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 LAMTOR5O43504 91 aa19.86■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 KDELR3O43731 214 aa19.86■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 MAFKO60675 156 aa19.86■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 WASP42768 502 aa19.86■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 ECT2LQ008S8 904 aa19.86■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF33AQ06730 810 aa19.86■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa19.86■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 MMGT1Q8N4V1 131 aa19.86■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP19.86■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 ACOX2Q99424 681 aa19.86■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 LGMNQ99538 433 aa19.86■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP19.86■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 ERVW-1Q9UQF0 538 aa19.86■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 V9GYY5 206 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 H7C0C1 242 aa19.85■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 CCDC188H7C350 402 aa19.85■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 SGK1O00141 431 aa19.85■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 PHF2O75151 1096 aa19.85■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 ZMPSTE24O75844 475 aa19.85■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 CCNCP24863 283 aa19.85■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 ATP5OP48047 213 aa19.85■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 CXCL12P48061 93 aa19.85■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 IL10RBQ08334 325 aa19.85■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 OASLQ15646 514 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 SLC45A4Q5BKX6 768 aa19.85■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 SYT13Q7L8C5 426 aa19.85■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 C1orf210Q8IVY1 113 aa19.85■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 CCNYQ8ND76 341 aa19.85■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 LRRN4Q8WUT4 740 aa19.85■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 VPS51Q9UID3 782 aa19.85■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 HPCAL4Q9UM19 191 aa19.85■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 SLC8A2Q9UPR5 921 aa19.85■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 STON1Q9Y6Q2 735 aa19.85■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 CBX4O00257 560 aa19.84■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 SNAP91O60641 907 aa19.84■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 PRAMEF11O60813 436 aa19.84■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 HOXB2P14652 356 aa19.84■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 GLDCP23378 1020 aa19.84■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 NNMTP40261 264 aa19.84■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 IL12RB1P42701 662 aa19.84■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 SATB1Q01826 763 aa19.84■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 SNX1Q13596 522 aa19.84■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 ELF2Q15723 593 aa19.84■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 PTPRNQ16849 979 aa19.84■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP19.84■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 CCDC13Q8IYE1 715 aa19.84■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 FATE1Q969F0 183 aa19.84■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 SP110Q9HB58 689 aa19.84■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 PDFQ9HBH1 243 aa19.84■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa19.83■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 J3KR12 359 aa19.83■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 ADAM23O75077 832 aa19.83■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 VAV1P15498 845 aa19.83■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 NUBP1P53384 320 aa19.83■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 ARF5P84085 180 aa19.83■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 C2orf54Q08AI8 447 aa19.83■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 AP1B1Q10567 949 aa19.83■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 STARD3Q14849 445 aa19.83■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP19.83■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 TTC27Q6P3X3 843 aa19.83■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 MAMSTRQ6ZN01 415 aa19.83■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa19.83■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP19.83■□□□□ 0.77
HOXD11-201ENST00000249504 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP19.82■□□□□ 0.76
HOXD11-201ENST00000249504 WASH3PC4AMC7 463 aa19.82■□□□□ 0.76
HOXD11-201ENST00000249504 PEX11BO96011 259 aa19.82■□□□□ 0.76
HOXD11-201ENST00000249504 ITGAVP06756 1048 aa19.82■□□□□ 0.76
HOXD11-201ENST00000249504 EPHX1P07099 455 aa19.82■□□□□ 0.76
HOXD11-201ENST00000249504 TUBBP07437 444 aa19.82■□□□□ 0.76
HOXD11-201ENST00000249504 RBL1P28749 1068 aa19.82■□□□□ 0.76
HOXD11-201ENST00000249504 CHRNA3P32297 505 aa19.82■□□□□ 0.76
HOXD11-201ENST00000249504 COILP38432 576 aaPredicted RBP19.82■□□□□ 0.76
HOXD11-201ENST00000249504 FNTAP49354 379 aa19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.9 ms