RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249499.7

HOXD9-201, Transcript of homeobox D9, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD9, Length 1,870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD9-201ENST00000249499 POLD2P49005 469 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 OCRLQ01968 901 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 SLC20A2Q08357 652 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 CHI3L2Q15782 390 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 CCDC153Q494R4 210 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 C5orf22Q49AR2 442 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 C1orf53Q5VUE5 145 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 FBXW10Q5XX13 1052 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 KLHDC10Q6PID8 442 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 TAS1R1Q7RTX1 841 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 MIB1Q86YT6 1006 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 DCLK2Q8N568 766 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 HMCESQ96FZ2 354 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 FICDQ9BVA6 458 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 SNX15Q9NRS6 342 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 MYCP01106 439 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 DLDP09622 509 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 TPH1P17752 444 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 ATF6P18850 670 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 NMBRP28336 390 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 ARFIP2P53365 341 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 IL10RBQ08334 325 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 BST1Q10588 318 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 UGP2Q16851 508 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 ALFQ53S48 1182 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 MARC1Q5VT66 337 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 RAP1GAP2Q684P5 730 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 LCA5Q86VQ0 697 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 MRGPRX2Q96LB1 330 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 SAR1AQ9NR31 198 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 DNAJC6O75061 913 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 PAMP19021 973 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 FSTL4Q6MZW2 842 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 ASRGL1Q7L266 308 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 IGSF8Q969P0 613 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 SIKE1Q9BRV8 207 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 SP110Q9HB58 689 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 KCNK4Q9NYG8 393 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 DNMT3LQ9UJW3 386 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 EMCNQ9ULC0 261 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 TCAF1Q9Y4C2 921 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 DOCK4Q8N1I0 1966 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 RAMP2O60895 175 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 SIN3BO75182 1162 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 CCL5P13501 91 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 DNAJB1P25685 340 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 PBX3P40426 434 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 CCL23P55773 120 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 OVGP1Q12889 678 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 IKBKEQ14164 716 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 CNKSR3Q6P9H4 555 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 KDELC1Q6UW63 502 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 RFWD2Q8NHY2 731 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 KLHL29Q96CT2 875 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 IGSF21Q96ID5 467 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 RANBP9Q96S59 729 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 AGAP2Q99490 1192 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 TUBB6Q9BUF5 446 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 MECRQ9BV79 373 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 RNF208Q9H0X6 261 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 CWH43Q9H720 699 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 KCNK13Q9HB14 408 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 ATP13A1Q9HD20 1204 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 ARHGEF3Q9NR81 526 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 THAP1Q9NVV9 213 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 TET1Q8NFU7 2136 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 CARNS1A5YM72 827 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 CNTN5O94779 1100 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 GSRP00390 522 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 PROCP04070 461 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 CYB5D1Q6P9G0 228 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 ARMC5Q96C12 935 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 ZNF333Q96JL9 665 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 RHOJQ9H4E5 214 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 KLC4Q9NSK0 619 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 NQO1P15559 274 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 RFC2P35250 354 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 STX3Q13277 289 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 TPGS2Q68CL5 300 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 CRLF3Q8IUI8 442 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 GIPC2Q8TF65 315 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 AZIN2Q96A70 460 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXD9-201ENST00000249499 VPS39Q96JC1 886 aa23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms