RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216877.10

PTPRA-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type A, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRA, Length 3,725 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRA-201ENST00000216877 C1orf220Q5T0J3 134 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 SDE2Q6IQ49 451 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 PAGE2Q7Z2X7 111 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 ZNF354CQ86Y25 554 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 VPS33AQ96AX1 596 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 ANKRD60Q9BZ19 345 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 CDH7Q9ULB5 785 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 EI24O14681 340 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 ACOT2P49753 483 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 CDH6P55285 790 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 SPCS2Q15005 226 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 TMEM236Q5W0B7 351 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP14.88□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 OAZ3Q9UMX2 235 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 CDYLQ9Y232 598 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 SNX5Q9Y5X3 404 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 PDZK1P1A8MUH7 402 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 FAM189A1O60320 539 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 GSNP06396 782 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 ARRB2P32121 409 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 LAMC2Q13753 1193 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 PCLAFQ15004 111 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 MON1BQ7L1V2 547 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 SLC51AQ86UW1 340 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 DDIASQ8IXT1 998 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 PMEPA1Q969W9 287 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 TSNARE1Q96NA8 513 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 SORT1Q99523 831 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 ZNF577Q9BSK1 485 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 TMEM8AQ9HCN3 771 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 PIGNO95427 931 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 ALBP02768 609 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 INHBBP09529 407 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 DCKP27707 260 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 GRIA1P42261 906 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 LRRC49Q8IUZ0 686 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 LGI2Q8N0V4 545 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 SNX19Q92543 992 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 SEPHS2Q99611 448 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 TMEM246Q9BRR3 403 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 TIAM2Q8IVF5 1701 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 SEC24AO95486 1093 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 L1CAMP32004 1257 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 CASP2P42575 452 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 KRT6CP48668 564 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 GTF2A2P52657 109 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 PTP4A2Q12974 167 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 TRIM32Q13049 653 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 SPPL2CQ8IUH8 684 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 ARMC8Q8IUR7 673 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 FLCNQ8NFG4 579 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 TFAP2CQ92754 450 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 DPP3Q9NY33 737 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 TCP10L2B9ZVM9 353 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 ALOX12P18054 663 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 GNG2P59768 71 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 STILQ15468 1287 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 BNIPLQ7Z465 357 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 OR7A2PQ8NGA2 310 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 GAKO14976 1311 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 KMOO15229 486 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 GH2P01242 217 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 ADORA2AP29274 412 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 FMO4P31512 558 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 SERPINB9P50453 376 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 NAGLUP54802 743 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 OGDHQ02218 1023 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 NLGN1Q8N2Q7 840 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 CADM2Q8N3J6 435 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 LHPPQ9H008 270 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 STMN3Q9NZ72 180 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 BAG5Q9UL15 447 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 WDR27A2RRH5 827 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 TTC34A8MYJ7 566 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 SLC7A2P52569 658 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 PGGT1BP53609 377 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 IL1RL1Q01638 556 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 RHDQ02161 417 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 GRAPQ13588 217 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 AOC3Q16853 763 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 LDHDQ86WU2 507 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 SFRP1Q8N474 314 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms