RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025522.10

Pdgfrb-201, Transcript of Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pdgfrb, Length 5,407 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Pik3cdO35904 1043 aa11.1□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ctbp1O88712 441 aa11.1□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cyp2b9P12790 491 aa11.1□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Sipa1P46062 1037 aa11.1□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 R3hdm4Q4VBF2 262 aa11.1□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Fbxw10Q5SUS0 1030 aa11.1□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Has1Q61647 583 aa11.1□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr1080Q7TR67 313 aa11.1□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gpat3Q8C0N2 438 aa11.1□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Setd7Q8VHL1 366 aa11.1□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Angptl2Q9R045 493 aa11.1□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ltb4rO88855 351 aa11.1□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 ProcP33587 460 aa11.1□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Meis3P97368 378 aa11.1□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Bmp1P98063 991 aa11.1□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Usp8Q80U87 1080 aa11.1□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Clptm1Q8VBZ3 664 aa11.1□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 KlbQ99N32 1043 aa11.1□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Abcb9Q9JJ59 762 aa11.1□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Sppl2cA2A6C4 690 aa11.1□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr1305A2AVW3 312 aa11.1□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ddx6P54823 483 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ankmy2Q3TPE9 440 aa11.1□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ap5z1Q3U829 807 aa11.1□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Nr2e1Q64104 385 aa11.1□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Hspbap1Q8BK58 483 aa11.1□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Lysmd3Q99LE3 305 aa11.1□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Dnajc19Q9CQV7 116 aa11.1□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Get4Q9D1H7 327 aa11.1□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Slc25a19Q9DAM5 318 aa11.1□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Egfl7Q9QXT5 275 aa11.1□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Mon2Q80TL7 1715 aa11.1□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ift172Q6VH22 1749 aa11.09□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ighv11-2A0A075B5R8 117 aa11.09□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr738L7N1X7 311 aa11.09□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Dsg2O55111 1122 aa11.09□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tap1P21958 724 aa11.09□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ccnb1P24860 430 aa11.09□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 SarsP26638 512 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Usp4P35123 962 aa11.09□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 ItgavP43406 1044 aa11.09□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Echdc2Q3TLP5 296 aa11.09□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Papd7Q6PB75 542 aa11.09□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Trit1Q80UN9 467 aa11.09□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Aldh3b1Q80VQ0 468 aa11.09□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Teddm1aQ810U2 305 aa11.09□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr695Q8VFM3 315 aa11.09□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr853Q8VGG6 305 aa11.09□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cxxc5Q91WA4 317 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 IscuQ9D7P6 168 aa11.09□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Erp27Q9D8U3 272 aa11.09□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Smad9Q9JIW5 430 aa11.09□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Grk1Q9WVL4 564 aa11.09□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Vnn1Q9Z0K8 512 aa11.09□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 UgcgO88693 394 aa11.09□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Aldh3a1P47739 453 aa11.09□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Oaz1P54369 227 aa11.09□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Rps7P62082 194 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ppp3caP63328 521 aa11.09□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Serpina6Q06770 397 aa11.09□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 ZufspQ3T9Z9 577 aa11.09□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Aarsd1Q3THG9 412 aa11.09□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Lrrc55Q3UY51 311 aa11.09□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Hsd3b5Q61694 373 aa11.09□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 CbarpQ66L44 698 aa11.09□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ppm1lQ8BHN0 360 aa11.09□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm5591Q8CDK1 855 aa11.09□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tdrd7Q8K1H1 1086 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Pex19Q8VCI5 299 aa11.09□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Rrp8Q9DB85 457 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gpc1Q9QZF2 557 aa11.09□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Clcn5Q9WVD4 746 aa11.09□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cyp2b13A6H6J2 491 aa11.09□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Trim30bE9PVL6 203 aa11.09□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Kcnn4O89109 425 aa11.09□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 AmhP27106 555 aa11.09□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tmprss11aQ3UQ41 389 aa11.09□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Otol1Q4ZJM7 482 aa11.09□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Adad1Q5SUE7 619 aa11.09□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Sh3gl3Q62421 347 aa11.09□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Lrrc24Q8BHA1 521 aa11.09□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tmc7Q8C428 726 aa11.09□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Sh3glb2Q8R3V5 400 aa11.09□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Reep3Q99KK1 254 aa11.09□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Adgra2Q91ZV8 1336 aa11.09□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Nek2O35942 443 aa11.09□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Lhx5P61375 402 aa11.09□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Adam39Q7M762 756 aa11.09□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Lats2Q7TSJ6 1042 aa11.09□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Slc47a1Q8K0H1 567 aa11.09□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Mapre2Q8R001 326 aa11.09□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Socs4Q91ZA6 436 aa11.09□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Mcrs1Q99L90 462 aa11.09□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 GgcxQ9QYC7 757 aa11.09□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 H2-T24F8VQG4 363 aa11.08□□□□□ -0.64
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Vmn2r38G3UYA8 861 aa11.08□□□□□ -0.64
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Vmn2r33K7N705 861 aa11.08□□□□□ -0.64
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Vmn2r44L7N2E1 861 aa11.08□□□□□ -0.64
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Kdm7aQ3UWM4 940 aa11.08□□□□□ -0.64
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Abl2Q4JIM5 1182 aa11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 42.3 ms