RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 ItgavP43406 1044 aa12.87□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Itga11P61622 1188 aa12.87□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vps45P97390 570 aa12.87□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tespa1Q3U132 458 aa12.87□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zbtb16Q3UQ17 673 aa12.87□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gcnt3Q5JCT0 437 aa12.87□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Chi3l1Q61362 389 aa12.87□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ino80dQ66JY2 873 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mib1Q80SY4 1006 aa12.87□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tbx10Q810F8 385 aa12.87□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rmnd1Q8CI78 450 aa12.87□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mtss1Q8R1S4 759 aa12.87□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rem2Q8VEL9 341 aa12.87□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dcp2Q9CYC6 422 aa12.87□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Atg7Q9D906 698 aa12.87□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 LipaQ9Z0M5 397 aa12.87□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam81bA0A140LI28 432 aa12.86□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kctd18E0CZ26 429 aa12.86□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ccdc144bE9PVZ3 520 aa12.86□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm5160F8VPN3 147 aa12.86□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr611K7N609 323 aa12.86□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr612L7N462 323 aa12.86□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ercc2O08811 760 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 En1P09065 401 aa12.86□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ccnd1P25322 295 aa12.86□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rab17P35292 214 aa12.86□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kcnj6P48542 425 aa12.86□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PolgP54099 1218 aa12.86□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cdh9P70407 786 aa12.86□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Atxn7l3bQ3UD01 97 aa12.86□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Afg1lQ3V384 480 aa12.86□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nemp1Q6ZQE4 437 aa12.86□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr299Q7TS05 330 aa12.86□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Npas4Q8BGD7 802 aa12.86□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Best2Q8BGM5 508 aa12.86□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lyve1Q8BHC0 318 aa12.86□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pcmtd2Q8BHD8 359 aa12.86□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Usp3Q91W36 520 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 FtcdQ91XD4 541 aa12.86□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 AadacQ99PG0 398 aa12.86□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 QpctQ9CYK2 362 aa12.86□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 EtfbQ9DCW4 255 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 TfebQ9R210 475 aa12.86□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 FancfE9Q5Z5 343 aa12.86□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rpl5P47962 297 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 SnnP61807 88 aa12.86□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 1810049J17RikQ3V2G9 153 aa12.86□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nxpe4Q52KP5 543 aa12.86□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fbxw11Q5SRY7 542 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nab1Q61122 486 aa12.86□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rasa4Q6PFQ7 802 aa12.86□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pcsk9Q80W65 694 aa12.86□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hspbap1Q8BK58 483 aa12.86□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Daam1Q8BPM0 1077 aa12.86□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trim35Q8C006 501 aa12.86□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem30aQ8VEK0 364 aa12.86□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Znf622Q91VY9 476 aa12.86□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mtif2Q91YJ5 727 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Jph2Q9ET78 696 aa12.86□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Noa1Q9JJG9 693 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PignQ9R1S3 931 aa12.86□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc2a5Q9WV38 501 aa12.86□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tle6Q9WVB3 581 aa12.86□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Oaz2O08608 189 aa12.85□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mup5P11591 180 aa12.85□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Emilin3P59900 758 aa12.85□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Atp6v1b2P62814 511 aa12.85□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Bop1P97452 732 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Htr1aQ64264 421 aa12.85□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cyp3a13Q64464 503 aa12.85□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fnip1Q68FD7 1165 aa12.85□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ubxn7Q6P5G6 467 aa12.85□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ckap2lQ7TS74 745 aa12.85□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mis18bp1Q80WQ8 998 aa12.85□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Stk32aQ8BGW6 398 aa12.85□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam163bQ8BUM6 167 aa12.85□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Agap3Q8VHH5 910 aa12.85□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ubap2Q91VX2 1132 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Atp6v1b1Q91YH6 513 aa12.85□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tspan17Q9D7W4 270 aa12.85□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ube4bQ9ES00 1173 aa12.85□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Myo10F8VQB6 2062 aa12.85□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mki67E9PVX6 3177 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 BC049352E9Q2Z6 85 aa12.85□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Adam15O88839 864 aa12.85□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cdc6O89033 562 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Odc1P00860 461 aa12.85□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Crhr1P35347 415 aa12.85□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dact3Q0PHV7 610 aa12.85□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Faf2Q3TDN2 445 aa12.85□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pdp2Q504M2 532 aa12.85□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 ADGRF3Q58Y75 991 aa12.85□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm11487Q5RIS0 354 aa12.85□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mapre1Q61166 268 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 VwdeQ6DFV8 926 aa12.85□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rad54bQ6PFE3 886 aa12.85□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem169Q8BG50 297 aa12.85□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fra10ac1Q8BP78 315 aa12.85□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slco2b1Q8BXB6 683 aa12.85□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 DrgxQ8BYH0 263 aa12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 31.1 ms