RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628078.2

TCF4-262, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 1,277 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-262	ENST00000628078	EXOC3L4	Q17RC7	722 aa		13.84	□□□□□ -0.19
TCF4-262	ENST00000628078	PTPN20	Q4JDL3	420 aa		13.84	□□□□□ -0.19
TCF4-262	ENST00000628078	SETMAR	Q53H47	684 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
TCF4-262	ENST00000628078	ARSI	Q5FYB1	569 aa		13.84	□□□□□ -0.19
TCF4-262	ENST00000628078	PIP5KL1	Q5T9C9	394 aa		13.84	□□□□□ -0.19
TCF4-262	ENST00000628078	TTC39B	Q5VTQ0	682 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
TCF4-262	ENST00000628078	SFMBT2	Q5VUG0	894 aa		13.84	□□□□□ -0.19
TCF4-262	ENST00000628078	OTUD1	Q5VV17	481 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
TCF4-262	ENST00000628078	ENOSF1	Q7L5Y1	443 aa		13.84	□□□□□ -0.19
TCF4-262	ENST00000628078	IRF2BP1	Q8IU81	584 aa		13.84	□□□□□ -0.19
TCF4-262	ENST00000628078	OR7D4	Q8NG98	312 aa		13.84	□□□□□ -0.19
TCF4-262	ENST00000628078	GRIN3A	Q8TCU5	1115 aa		13.84	□□□□□ -0.19
TCF4-262	ENST00000628078	NAF1	Q96HR8	494 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
TCF4-262	ENST00000628078	SPON2	Q9BUD6	331 aa		13.84	□□□□□ -0.19
TCF4-262	ENST00000628078	WDCP	Q9H6R7	721 aa		13.84	□□□□□ -0.19
TCF4-262	ENST00000628078	ERVMER34-1	Q9H9K5	563 aa		13.84	□□□□□ -0.19
TCF4-262	ENST00000628078	SIX2	Q9NPC8	291 aa		13.84	□□□□□ -0.19
TCF4-262	ENST00000628078	VPS51	Q9UID3	782 aa		13.84	□□□□□ -0.19
TCF4-262	ENST00000628078	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		13.84	□□□□□ -0.19
TCF4-262	ENST00000628078	ACTL7A	Q9Y615	435 aa		13.84	□□□□□ -0.19
TCF4-262	ENST00000628078	YKT6	O15498	198 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TCF4-262	ENST00000628078	SLC7A4	O43246	635 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TCF4-262	ENST00000628078	SRGAP2	O75044	1071 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TCF4-262	ENST00000628078	CLDN11	O75508	207 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TCF4-262	ENST00000628078	DAB1	O75553	588 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TCF4-262	ENST00000628078	GLI1	P08151	1106 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TCF4-262	ENST00000628078	C1S	P09871	688 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TCF4-262	ENST00000628078	DGKA	P23743	735 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TCF4-262	ENST00000628078	NOS2	P35228	1153 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TCF4-262	ENST00000628078	DNA2	P51530	1060 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TCF4-262	ENST00000628078	CDH4	P55283	916 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TCF4-262	ENST00000628078	DEUP1	Q05D60	604 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TCF4-262	ENST00000628078	CCDC173	Q0VFZ6	552 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TCF4-262	ENST00000628078	TAF3	Q5VWG9	929 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TCF4-262	ENST00000628078	SEL1L3	Q68CR1	1132 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TCF4-262	ENST00000628078	LRRC69	Q6ZNQ3	347 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TCF4-262	ENST00000628078	PHLDB2	Q86SQ0	1253 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TCF4-262	ENST00000628078	TRIM69	Q86WT6	500 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TCF4-262	ENST00000628078	OXR1	Q8N573	874 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TCF4-262	ENST00000628078	OR13H1	Q8NG92	308 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TCF4-262	ENST00000628078	OR2A12	Q8NGT7	310 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TCF4-262	ENST00000628078	SHC3	Q92529	594 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TCF4-262	ENST00000628078	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TCF4-262	ENST00000628078	TBCB	Q99426	244 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TCF4-262	ENST00000628078	PDCL3	Q9H2J4	239 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TCF4-262	ENST00000628078	KDM4C	Q9H3R0	1056 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TCF4-262	ENST00000628078	ASNSD1	Q9NWL6	643 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TCF4-262	ENST00000628078	FASTKD2	Q9NYY8	710 aa	Known RBP eCLIP	13.83	□□□□□ -0.2
TCF4-262	ENST00000628078	PCDHGC3	Q9UN70	934 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TCF4-262	ENST00000628078	ZFR2	Q9UPR6	939 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
TCF4-262	ENST00000628078	CLCA2	Q9UQC9	943 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TCF4-262	ENST00000628078	DMTF1	Q9Y222	760 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TCF4-262	ENST00000628078	GOLGA8S	H3BPF8	625 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TCF4-262	ENST00000628078	BRINP1	O60477	761 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TCF4-262	ENST00000628078	KRT83	P78385	493 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TCF4-262	ENST00000628078	KCNMA1	Q12791	1236 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TCF4-262	ENST00000628078	MEA1	Q16626	185 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF284	Q2VY69	593 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TCF4-262	ENST00000628078	PROX2	Q3B8N5	592 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TCF4-262	ENST00000628078	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TCF4-262	ENST00000628078	FAM131C	Q96AQ9	280 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TCF4-262	ENST00000628078	NPY6R	Q99463	290 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TCF4-262	ENST00000628078	DYRK4	Q9NR20	520 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TCF4-262	ENST00000628078	RWDD2A	Q9UIY3	292 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TCF4-262	ENST00000628078	TBC1D30	Q9Y2I9	924 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TCF4-262	ENST00000628078	FARP1	Q9Y4F1	1045 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
TCF4-262	ENST00000628078	PCDHB1	Q9Y5F3	818 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TCF4-262	ENST00000628078	MAGEC1	O60732	1142 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TCF4-262	ENST00000628078	LEFTY1	O75610	366 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TCF4-262	ENST00000628078	NEBL	O76041	1014 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TCF4-262	ENST00000628078	PAK4	O96013	591 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
TCF4-262	ENST00000628078	MT-CO3	P00414	261 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TCF4-262	ENST00000628078	OR1E1	P30953	314 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TCF4-262	ENST00000628078	GK	P32189	559 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TCF4-262	ENST00000628078	CXCR3	P49682	368 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TCF4-262	ENST00000628078	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TCF4-262	ENST00000628078	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
TCF4-262	ENST00000628078	RAB6C	Q53S08	254 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TCF4-262	ENST00000628078	DPY19L3	Q6ZPD9	716 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TCF4-262	ENST00000628078	SLC26A9	Q7LBE3	791 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TCF4-262	ENST00000628078	IQCH	Q86VS3	1027 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TCF4-262	ENST00000628078	HORMAD1	Q86X24	394 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF683	Q8IZ20	524 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TCF4-262	ENST00000628078	RAB6C	Q9H0N0	254 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TCF4-262	ENST00000628078	PREB	Q9HCU5	417 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TCF4-262	ENST00000628078	ARHGEF38	Q9NXL2	777 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TCF4-262	ENST00000628078	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TCF4-262	ENST00000628078	IL36A	Q9UHA7	158 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TCF4-262	ENST00000628078	LOC400499	M0QZD8	3231 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TCF4-262	ENST00000628078		E9PAM4	449 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TCF4-262	ENST00000628078	ALOX15B	O15296	676 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TCF4-262	ENST00000628078	RAD51B	O15315	384 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TCF4-262	ENST00000628078	RRP8	O43159	456 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
TCF4-262	ENST00000628078	CDK4	P11802	303 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TCF4-262	ENST00000628078	ACP1	P24666	158 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TCF4-262	ENST00000628078	AKT2	P31751	481 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF211	Q13398	564 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
TCF4-262	ENST00000628078	RTP5	Q14D33	572 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TCF4-262	ENST00000628078	C5orf22	Q49AR2	442 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TCF4-262	ENST00000628078	FAM102A	Q5T9C2	384 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2

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