RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618610.1

PTPRT-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 3,230 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-211ENST00000618610 HERC6Q8IVU3 1022 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 FAM20CQ8IXL6 584 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 NIM1KQ8IY84 436 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 EXOC8Q8IYI6 725 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 OR7G1Q8NGA0 311 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF597Q96LX8 424 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 STRA6Q9BX79 667 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 NANOGQ9H9S0 305 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 GABBR1Q9UBS5 961 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 HACL1Q9UJ83 578 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-211ENST00000618610 IL1BP01584 269 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 CCT8P50990 548 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 CRADDP78560 199 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 PIGFQ07326 219 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 SLC27A3Q5K4L6 730 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 HMBOX1Q6NT76 420 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 ITIH5Q86UX2 942 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 MPP5Q8N3R9 675 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 CBR4Q8N4T8 237 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 COPS5Q92905 334 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 FAF2Q96CS3 445 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 CAMKK2Q96RR4 588 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 RTKNQ9BST9 563 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 FANCEQ9HB96 536 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 FEM1BQ9UK73 627 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 CDH7Q9ULB5 785 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 EMCNQ9ULC0 261 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 MSI1O43347 362 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 ICMTO60725 284 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 GSRP00390 522 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 IST1P53990 364 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 PHC1P78364 1004 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 Q3C1V9 767 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 CYP4A22Q5TCH4 519 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 DCUN1D2Q6PH85 259 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 CHSY3Q70JA7 882 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 PIGZQ86VD9 579 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 SLC22A16Q86VW1 577 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 RCOR2Q8IZ40 523 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 BSNDQ8WZ55 320 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 DEFB129Q9H1M3 183 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 TRIM39Q9HCM9 518 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 RAB6BQ9NRW1 208 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 DSEQ9UL01 958 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 AURKCQ9UQB9 309 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 FIS1Q9Y3D6 152 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 MYO7AQ13402 2215 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 DHX15O43143 795 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 TMCC2O75069 709 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 VAPBO95292 243 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 MT-ND1P03886 318 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 CXCR2P25025 360 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 PRKAA2P54646 552 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 TUBA4AP68366 448 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 CYP24A1Q07973 514 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 DLG2Q15700 870 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 PCSK7Q16549 785 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 SWSAP1Q6NVH7 229 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 ZFP1Q6P2D0 407 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 CCDC81Q6ZN84 652 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 GPD1LQ8N335 351 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 ELMOD1Q8N336 334 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 LRRC71Q8N4P6 559 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 SAMD3Q8N6K7 520 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 NATD1Q8N6N6 113 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 ABHD11Q8NFV4 315 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 ZFP90Q8TF47 636 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 NACC2Q96BF6 587 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 OTUD5Q96G74 571 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 CSF3RQ99062 836 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 IFT52Q9Y366 437 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 TRIOO75962 3097 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 LRRIQ4A6NIV6 560 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 A8MV72 311 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF195O14628 629 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 AXIN1O15169 862 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 XYLBO75191 536 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 CLPXO76031 633 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 MFN2O95140 757 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 HSPA4LO95757 839 aa8.32□□□□□ -1.08
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