RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614197.4

NPIPB4-222, Transcript of nuclear pore complex interacting protein family member B4, human

TSL 5 BASIC

Gene NPIPB4, Length 1,216 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NPIPB4-222	ENST00000614197	OVGP1	Q12889	678 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NPIPB4-222	ENST00000614197	POLD3	Q15054	466 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
NPIPB4-222	ENST00000614197	CCDC14	Q49A88	953 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NPIPB4-222	ENST00000614197	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NPIPB4-222	ENST00000614197	HS1BP3	Q53T59	392 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NPIPB4-222	ENST00000614197	NEK5	Q6P3R8	708 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NPIPB4-222	ENST00000614197	SCYL2	Q6P3W7	929 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NPIPB4-222	ENST00000614197	C22orf39	Q6P5X5	142 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NPIPB4-222	ENST00000614197	LINGO4	Q6UY18	593 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NPIPB4-222	ENST00000614197	PHF13	Q86YI8	300 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
NPIPB4-222	ENST00000614197	RYBP	Q8N488	228 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
NPIPB4-222	ENST00000614197	PCDH20	Q8N6Y1	951 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
NPIPB4-222	ENST00000614197	C3orf20	Q8ND61	904 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NPIPB4-222	ENST00000614197	TMIE	Q8NEW7	156 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NPIPB4-222	ENST00000614197	OR7D4	Q8NG98	312 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NPIPB4-222	ENST00000614197	FAM172A	Q8WUF8	416 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NPIPB4-222	ENST00000614197	TBC1D31	Q96DN5	1066 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NPIPB4-222	ENST00000614197	CEP44	Q9C0F1	390 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NPIPB4-222	ENST00000614197	OSBPL2	Q9H1P3	480 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NPIPB4-222	ENST00000614197	IL36A	Q9UHA7	158 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NPIPB4-222	ENST00000614197	PCOLCE2	Q9UKZ9	415 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NPIPB4-222	ENST00000614197	MYO6	Q9UM54	1294 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NPIPB4-222	ENST00000614197	CKAP5	Q14008	2032 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NPIPB4-222	ENST00000614197	DCHS1	Q96JQ0	3298 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NPIPB4-222	ENST00000614197		A0A0D9SEW6	157 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NPIPB4-222	ENST00000614197	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NPIPB4-222	ENST00000614197	SIGLEC16	A6NMB1	481 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NPIPB4-222	ENST00000614197	GOLGA8CP	A6NN73	597 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NPIPB4-222	ENST00000614197	PRAMEF26	H0Y7S4	382 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NPIPB4-222	ENST00000614197		H0Y8X5	98 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NPIPB4-222	ENST00000614197	PLRG1	O43660	514 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
NPIPB4-222	ENST00000614197	PCDHGA12	O60330	932 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NPIPB4-222	ENST00000614197	RAMP2	O60895	175 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NPIPB4-222	ENST00000614197	PCDH8	O95206	1070 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NPIPB4-222	ENST00000614197	SERPINC1	P01008	464 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NPIPB4-222	ENST00000614197	PLEK	P08567	350 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
NPIPB4-222	ENST00000614197	FTH1P19	P0C7X4	201 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NPIPB4-222	ENST00000614197	UNG	P13051	313 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
NPIPB4-222	ENST00000614197	RRM1	P23921	792 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NPIPB4-222	ENST00000614197	MAT2A	P31153	395 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
NPIPB4-222	ENST00000614197	AKT2	P31751	481 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZNF165	P49910	485 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NPIPB4-222	ENST00000614197	SERPINH1	P50454	418 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
NPIPB4-222	ENST00000614197	NRG1	Q02297	640 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
NPIPB4-222	ENST00000614197	RAD51	Q06609	339 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NPIPB4-222	ENST00000614197	CNTN1	Q12860	1018 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NPIPB4-222	ENST00000614197	ASIC2	Q16515	512 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NPIPB4-222	ENST00000614197	C15orf59	Q2T9L4	293 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
NPIPB4-222	ENST00000614197	CAVIN1	Q6NZI2	390 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
NPIPB4-222	ENST00000614197	LAYN	Q6UX15	382 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NPIPB4-222	ENST00000614197	SLFN11	Q7Z7L1	901 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NPIPB4-222	ENST00000614197	GLRX5	Q86SX6	157 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NPIPB4-222	ENST00000614197	TRIM69	Q86WT6	500 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZNF683	Q8IZ20	524 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NPIPB4-222	ENST00000614197	CHCHD4	Q8N4Q1	142 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NPIPB4-222	ENST00000614197	MFSD2A	Q8NA29	543 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NPIPB4-222	ENST00000614197	OR52K2	Q8NGK3	314 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NPIPB4-222	ENST00000614197	GRIN3A	Q8TCU5	1115 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NPIPB4-222	ENST00000614197	PSMB7	Q99436	277 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NPIPB4-222	ENST00000614197	ELF4	Q99607	663 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
NPIPB4-222	ENST00000614197	EPAS1	Q99814	870 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NPIPB4-222	ENST00000614197	BPIFA3	Q9BQP9	254 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NPIPB4-222	ENST00000614197	MAGEH1	Q9H213	219 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NPIPB4-222	ENST00000614197	TNKS2	Q9H2K2	1166 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NPIPB4-222	ENST00000614197	ANLN	Q9NQW6	1124 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NPIPB4-222	ENST00000614197	TMPRSS4	Q9NRS4	437 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NPIPB4-222	ENST00000614197	FTSJ1	Q9UET6	329 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NPIPB4-222	ENST00000614197	MSRB2	Q9Y3D2	182 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NPIPB4-222	ENST00000614197	TNRC6B	Q9UPQ9	1833 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
NPIPB4-222	ENST00000614197	GON4L	Q3T8J9	2241 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NPIPB4-222	ENST00000614197	CXorf51A	A0A1B0GTR3	108 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZSCAN5C	A6NGD5	496 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
NPIPB4-222	ENST00000614197		K7ERQ8	282 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NPIPB4-222	ENST00000614197	TLR4	O00206	839 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NPIPB4-222	ENST00000614197	NEMP1	O14524	444 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NPIPB4-222	ENST00000614197	KCNK3	O14649	394 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NPIPB4-222	ENST00000614197	TNFSF14	O43557	240 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NPIPB4-222	ENST00000614197	RNGTT	O60942	597 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
NPIPB4-222	ENST00000614197	MT-CO1	P00395	513 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NPIPB4-222	ENST00000614197	ATP1A3	P13637	1013 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NPIPB4-222	ENST00000614197	PTMS	P20962	102 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NPIPB4-222	ENST00000614197	EPHB2	P29323	1055 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NPIPB4-222	ENST00000614197	RFC1	P35251	1148 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
NPIPB4-222	ENST00000614197	DRD3	P35462	400 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NPIPB4-222	ENST00000614197	NEK3	P51956	506 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NPIPB4-222	ENST00000614197	AIF1	P55008	147 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NPIPB4-222	ENST00000614197	GSC	P56915	257 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
NPIPB4-222	ENST00000614197	FAM193A	P78312	1265 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NPIPB4-222	ENST00000614197	IL9R	Q01113	521 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NPIPB4-222	ENST00000614197	BNC1	Q01954	994 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NPIPB4-222	ENST00000614197	CCDC157	Q569K6	752 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NPIPB4-222	ENST00000614197	CARD16	Q5EG05	197 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NPIPB4-222	ENST00000614197	ARSI	Q5FYB1	569 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NPIPB4-222	ENST00000614197	ACAD10	Q6JQN1	1059 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NPIPB4-222	ENST00000614197	TRNP1	Q6NT89	227 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NPIPB4-222	ENST00000614197	FBXL19	Q6PCT2	694 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NPIPB4-222	ENST00000614197	ERN2	Q76MJ5	926 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
NPIPB4-222	ENST00000614197	IQCH	Q86VS3	1027 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NPIPB4-222	ENST00000614197	OR2A12	Q8NGT7	310 aa		11.19	□□□□□ -0.62

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