RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609525.1

CSNK2A1-208, Transcript of casein kinase 2 alpha 1, human

TSL 5

Gene CSNK2A1, Length 581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RANBP6	O60518	1105 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GNA14	O95837	355 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FTH1P19	P0C7X4	201 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CCNE1	P24864	410 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PRDX5	P30044	214 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TPTE	P56180	551 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	VSNL1	P62760	191 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GHRHR	Q02643	423 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	UBXN1	Q04323	297 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	LRRC63	Q05C16	580 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PDIA5	Q14554	519 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CCDC122	Q5T0U0	273 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CFAP58	Q5T655	872 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FAM160B1	Q5W0V3	765 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MMS22L	Q6ZRQ5	1243 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525		Q6ZWC4	215 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TADA2B	Q86TJ2	420 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TBC1D10C	Q8IV04	446 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	IFT20	Q8IY31	132 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SLC35F6	Q8N357	371 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FAM46D	Q8NEK8	389 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MAGEC3	Q8TD91	643 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GLG1	Q92896	1179 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PHKB	Q93100	1093 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	COA7	Q96BR5	231 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	R3HDM4	Q96D70	268 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CCDC42	Q96M95	316 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SNX18	Q96RF0	628 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RUFY1	Q96T51	708 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GLT8D2	Q9H1C3	349 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MRPL44	Q9H9J2	332 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	LZTFL1	Q9NQ48	299 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SAMSN1	Q9NSI8	373 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	EXOC1	Q9NV70	894 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RSPH14	Q9UHP6	348 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	BZW2	Q9Y6E2	419 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	KLHL33	A6NCF5	533 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GOLGA6C	A6NDK9	693 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CYSRT1	A8MQ03	144 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	HMGB1P1	B2RPK0	211 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ADAM10	O14672	748 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	HSF2BP	O75031	334 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GFPT2	O94808	682 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	KIAA0754	O94854	1291 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ABLIM3	O94929	683 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SEC31A	O94979	1220 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GOLGA6D	P0CG33	693 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SCG2	P13521	617 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CNGA1	P29973	690 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GNA11	P29992	359 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	UBA7	P41226	1012 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	IFFO1	Q0D2I5	559 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TROAP	Q12815	778 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	BIRC3	Q13489	604 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ERV3-1	Q14264	604 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SEMA3A	Q14563	771 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SLMAP	Q14BN4	828 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	C10orf25	Q5T742	122 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ARHGAP40	Q5TG30	622 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	KIAA1328	Q86T90	577 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CNBD1	Q8NA66	436 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	C1orf162	Q8NEQ5	155 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NEK11	Q8NG66	645 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ATL2	Q8NHH9	583 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NELFB	Q8WX92	580 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ATG4A	Q8WYN0	398 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	JAKMIP2	Q96AA8	810 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	LRRC45	Q96CN5	670 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SLC46A1	Q96NT5	459 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CAPS2	Q9BXY5	557 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FAM129A	Q9BZQ8	928 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FAM204A	Q9H8W3	233 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ACTR5	Q9H9F9	607 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63

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