RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609232.5

CTCFL-222, Transcript of CCCTC-binding factor like, human

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTCFL, Length 3,668 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTCFL-222	ENST00000609232	ATP6AP2	A0A1C7CYW4	349 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	DPYSL4	O14531	572 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	DNALI1	O14645	258 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	ZBTB24	O43167	697 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	SNX3	O60493	162 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	CDH16	O75309	829 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	DAB1	O75553	588 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	ATP6AP2	O75787	350 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	HDC	P19113	662 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	NFKB1	P19838	968 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	SLC12A2	P55011	1212 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	CAV1	Q03135	178 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	TAF10	Q12962	218 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	CHI3L2	Q15782	390 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	VARS2	Q5ST30	1063 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	SCIMP	Q6UWF3	145 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	TMC7	Q7Z402	723 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	RASSF3	Q86WH2	238 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	DENND1C	Q8IV53	801 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	CDC26	Q8NHZ8	85 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	RTP3	Q9BQQ7	232 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	CCSER2	Q9H7U1	834 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	IL1RL2	Q9HB29	575 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	CYLD	Q9NQC7	956 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	GMIP	Q9P107	970 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	PSAT1	Q9Y617	370 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	AK5	Q9Y6K8	562 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	TCRBV9S1A1T	A0A576	114 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	ARHGAP10	A1A4S6	786 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	MEI4	A8MW99	385 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232		H3BRJ5	948 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	ATP6V1G1	O75348	118 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	LRIG2	O94898	1065 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	FAM163B	P0C2L3	166 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	PHB	P35232	272 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	STRADA	Q7RTN6	431 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	SLC35B2	Q8TB61	432 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	NKD2	Q969F2	451 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	FCRL2	Q96LA5	508 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	ANLN	Q9NQW6	1124 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	DLGAP2	Q9P1A6	1054 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	ADAM28	Q9UKQ2	775 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	PCDHB8	Q9UN66	801 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	CNTN5	O94779	1100 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	ITGAV	P06756	1048 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	LINGO3	P0C6S8	592 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	TGM2	P21980	687 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	SLC5A3	P53794	718 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	RPS24	P62847	133 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	GALNT3	Q14435	633 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	SPATA21	Q7Z572	469 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	PIGW	Q7Z7B1	504 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	TTC7B	Q86TV6	843 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	MTDH	Q86UE4	582 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	NUDCD3	Q8IVD9	361 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	COLGALT2	Q8IYK4	626 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	TEX9	Q8N6V9	391 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	KCTD13	Q8WZ19	329 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	TLCD1	Q96CP7	247 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	NUDCD1	Q96RS6	583 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	SP110	Q9HB58	689 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	PCDH9	Q9HC56	1237 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	DTL	Q9NZJ0	730 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	EFR3B	Q9Y2G0	817 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232		V9GYQ6	96 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	SPAG17	Q6Q759	2223 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	FAM237B	A0A1B0GVD1	139 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	ZNF189	O75820	626 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	GSTA2	P09210	222 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	CDK7	P50613	346 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	USP46	P62068	366 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	OASL	Q15646	514 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	CNGA3	Q16281	694 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	10.01	□□□□□ -0.81	3e-11	■■■■■ 115.3
CTCFL-222	ENST00000609232	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	CROCCP2	Q86T23	111 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	TAC4	Q86UU9	113 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	MFN1	Q8IWA4	741 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	HTR3C	Q8WXA8	447 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	SLCO2A1	Q92959	643 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	RNF31	Q96EP0	1072 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	SERPINB12	Q96P63	405 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	FICD	Q9BVA6	458 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	IGFLR1	Q9H665	355 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	RUVBL2	Q9Y230	463 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	ARL2BP	Q9Y2Y0	163 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232		M0QZQ0	153 aa		10	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	SMAP	O00193	183 aa		10	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	ADAM12	O43184	909 aa		10	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	FES	P07332	822 aa		10	□□□□□ -0.81

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50 ms