RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 GSDMBQ8TAX9 411 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-204ENST00000587718 SMOQ99835 787 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-204ENST00000587718 PCDHB8Q9UN66 801 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-204ENST00000587718 SEC24AO95486 1093 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-204ENST00000587718 METTL18O95568 372 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-204ENST00000587718 DHRS4L1P0CG22 281 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-204ENST00000587718 SEMA3BQ13214 749 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-204ENST00000587718 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP26.01■■□□□ 1.754e-8■■■■■ 41.9
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC1A5Q15758 541 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-204ENST00000587718 PARP6Q2NL67 630 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-204ENST00000587718 CTXN3Q4LDR2 81 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-204ENST00000587718 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-204ENST00000587718 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-204ENST00000587718 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-204ENST00000587718 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-204ENST00000587718 TPGS2Q68CL5 300 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-204ENST00000587718 SH2D5Q6ZV89 423 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-204ENST00000587718 PACS2Q86VP3 889 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-204ENST00000587718 GPR152Q8TDT2 470 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-204ENST00000587718 NOTCH4Q99466 2003 aa26.01■■□□□ 1.75
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CAPNS1-204ENST00000587718 FAM86C1Q9NVL1 165 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM159BA6NKW6 160 aa26■■□□□ 1.75
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CAPNS1-204ENST00000587718 DCLK1O15075 740 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-204ENST00000587718 BEST1O76090 585 aa26■■□□□ 1.75
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CAPNS1-204ENST00000587718 NRLP54845 237 aa26■■□□□ 1.75
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CAPNS1-204ENST00000587718 PM20D1Q6GTS8 502 aa26■■□□□ 1.75
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CAPNS1-204ENST00000587718 LRRC8BQ6P9F7 803 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-204ENST00000587718 LVRNQ6Q4G3 990 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-204ENST00000587718 POTEHQ6S545 545 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF534Q76KX8 674 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-204ENST00000587718 NPAS3Q8IXF0 933 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-204ENST00000587718 KIF9Q9HAQ2 790 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-204ENST00000587718 USH1CQ9Y6N9 552 aa26■■□□□ 1.75
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CAPNS1-204ENST00000587718 CAPN9O14815 690 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-204ENST00000587718 KRT38O76015 456 aa25.99■■□□□ 1.75
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CAPNS1-204ENST00000587718 CCNFP41002 786 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-204ENST00000587718 ARPP19P56211 112 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF280DQ6N043 979 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-204ENST00000587718 CGB2Q6NT52 195 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-204ENST00000587718 RFX8Q6ZV50 586 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-204ENST00000587718 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-204ENST00000587718 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-204ENST00000587718 PCED1BQ96HM7 432 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-204ENST00000587718 RTP3Q9BQQ7 232 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-204ENST00000587718 PHTF1Q9UMS5 762 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-204ENST00000587718 HHLA1C9JL84 531 aa25.99■■□□□ 1.75
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CAPNS1-204ENST00000587718 ALDH1A2O94788 518 aa25.99■■□□□ 1.75
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CAPNS1-204ENST00000587718 FYNP06241 537 aa25.99■■□□□ 1.75
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CAPNS1-204ENST00000587718 ALDH3A1P30838 453 aa25.99■■□□□ 1.75
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CAPNS1-204ENST00000587718 HTR7P34969 479 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF33AQ06730 810 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-204ENST00000587718 BNIP1Q12981 228 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-204ENST00000587718 DBN1Q16643 649 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC5A9Q2M3M2 681 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-204ENST00000587718 TIFABQ6ZNK6 161 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-204ENST00000587718 TRIM42Q8IWZ5 723 aa25.99■■□□□ 1.75
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CAPNS1-204ENST00000587718 ZMIZ2Q8NF64 920 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
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CAPNS1-204ENST00000587718 MFSD11O43934 449 aa25.98■■□□□ 1.75
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CAPNS1-204ENST00000587718 PTPN2P17706 415 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-204ENST00000587718 TYMPP19971 482 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-204ENST00000587718 MX2P20592 715 aa25.98■■□□□ 1.75
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CAPNS1-204ENST00000587718 CFAP36Q96G28 342 aa25.98■■□□□ 1.75
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CAPNS1-204ENST00000587718 LRG1P02750 347 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-204ENST00000587718 UNC5AQ6ZN44 842 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-204ENST00000587718 MTSS1LQ765P7 747 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-204ENST00000587718 TCP10LQ8TDR4 215 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-204ENST00000587718 VAT1Q99536 393 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC40A1Q9NP59 571 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-204ENST00000587718 PIGVQ9NUD9 493 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-204ENST00000587718 MOCS1Q9NZB8 636 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-204ENST00000587718 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-204ENST00000587718 INSL5Q9Y5Q6 135 aa25.97■■□□□ 1.75
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