RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578093.1

PTPRM-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 3

Gene PTPRM, Length 464 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-206	ENST00000578093	IFI16	Q16666	785 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	WDR72	Q3MJ13	1102 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	SYCP2L	Q5T4T6	812 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	FYB2	Q5VWT5	728 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	CLEC20A	Q6ZU45	233 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	HTR3D	Q70Z44	454 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	GATAD2A	Q86YP4	633 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	ZC3H3	Q8IXZ2	948 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	SYCP3	Q8IZU3	236 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	MFSD4A	Q8N468	514 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	C12orf29	Q8N999	325 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	PIWIL2	Q8TC59	973 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	SLC2A14	Q8TDB8	520 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	SCFD1	Q8WVM8	642 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	SNX19	Q92543	992 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	UBXN4	Q92575	508 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	SMARCD1	Q96GM5	515 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	TMX3	Q96JJ7	454 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	HEXIM2	Q96MH2	286 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	SLC6A18	Q96N87	628 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	FCRL3	Q96P31	734 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	XPO6	Q96QU8	1125 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	TWNK	Q96RR1	684 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	MED10	Q9BTT4	135 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	TRIM55	Q9BYV6	548 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	ZDHHC5	Q9C0B5	715 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	SEMA4C	Q9C0C4	833 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	SNX25	Q9H3E2	840 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	CAAP1	Q9H8G2	361 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	TM9SF3	Q9HD45	589 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	DMAP1	Q9NPF5	467 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	ITM2C	Q9NQX7	267 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	AGPAT3	Q9NRZ7	376 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	FAM49B	Q9NUQ9	324 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	PANK4	Q9NVE7	773 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	EHD2	Q9NZN4	543 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	THAP10	Q9P2Z0	257 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	SUCO	Q9UBS9	1254 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	FBXO10	Q9UK96	956 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	EXOC7	Q9UPT5	735 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	ZBTB32	Q9Y2Y4	487 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	NFE2L3	Q9Y4A8	694 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	PIEZO2	Q9H5I5	2752 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	TDRD6	O60522	2096 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	KIF26B	Q2KJY2	2108 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	ZNF233	A6NK53	670 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	WNT9A	O14904	365 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	WNT1	P04628	370 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	IGHV4-34	P06331	123 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	CEACAM5	P06731	702 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	EPHX1	P07099	455 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	HMBS	P08397	361 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	NAT2	P11245	290 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	RARG	P13631	454 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	KRT10	P13645	584 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	TNNI1	P19237	187 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	ITIH2	P19823	946 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	ADORA2B	P29275	332 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	STAT6	P42226	847 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	CTSK	P43235	329 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	GRK6	P43250	576 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	ACADVL	P49748	655 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	CYP2J2	P51589	502 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	SGSH	P51688	502 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	PMS1	P54277	932 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	OXCT1	P55809	520 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	DLG4	P78352	724 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	SEMG2	Q02383	582 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	ALCAM	Q13740	583 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	STARD3	Q14849	445 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	PSMD6	Q15008	389 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	ZNF699	Q32M78	642 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	PRAMEF14	Q5SWL7	426 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	SDE2	Q6IQ49	451 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	FAM214B	Q7L5A3	538 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	EPM2AIP1	Q7L775	607 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	SCD5	Q86SK9	330 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	ACOT1	Q86TX2	421 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	TMPRSS6	Q8IU80	811 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	NELFCD	Q8IXH7	590 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	GALNT15	Q8N3T1	639 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	PDILT	Q8N807	584 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	CADM4	Q8NFZ8	388 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	WFDC5	Q8TCV5	224 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	CCDC127	Q96BQ5	260 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	BIRC7	Q96CA5	298 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	NXPE2	Q96DL1	559 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	MISP3	Q96FF7	219 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	SIPA1	Q96FS4	1042 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	PIWIL1	Q96J94	861 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	PANK2	Q9BZ23	570 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	NACA2	Q9H009	215 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	LHX5	Q9H2C1	402 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	TRIT1	Q9H3H1	467 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75

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