RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574601.1

RPS3AP23-202, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 23, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP23, Length 686 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP23-202ENST00000574601 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
RPS3AP23-202ENST00000574601 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
RPS3AP23-202ENST00000574601 SPATA20Q8TB22 786 aa3.11□□□□□ -1.91
RPS3AP23-202ENST00000574601 TMEM163Q8TC26 289 aa3.11□□□□□ -1.91
RPS3AP23-202ENST00000574601 UHRF2Q96PU4 802 aa3.11□□□□□ -1.91
RPS3AP23-202ENST00000574601 COLEC11Q9BWP8 271 aa3.11□□□□□ -1.91
RPS3AP23-202ENST00000574601 ARL15Q9NXU5 204 aa3.11□□□□□ -1.91
RPS3AP23-202ENST00000574601 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa3.11□□□□□ -1.91
RPS3AP23-202ENST00000574601 MALT1Q9UDY8 824 aa3.11□□□□□ -1.91
RPS3AP23-202ENST00000574601 RAB21Q9UL25 225 aa3.11□□□□□ -1.91
RPS3AP23-202ENST00000574601 DTNAQ9Y4J8 743 aa3.11□□□□□ -1.91
RPS3AP23-202ENST00000574601 CUX1P39880 1505 aa3.1□□□□□ -1.91
RPS3AP23-202ENST00000574601 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa3.1□□□□□ -1.91
RPS3AP23-202ENST00000574601 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa3.1□□□□□ -1.91
RPS3AP23-202ENST00000574601 ANKRD62A6NC57 917 aa3.1□□□□□ -1.91
RPS3AP23-202ENST00000574601 MAGEA13PA6NCF6 341 aa3.1□□□□□ -1.91
RPS3AP23-202ENST00000574601 APOL1O14791 398 aa3.1□□□□□ -1.91
RPS3AP23-202ENST00000574601 CLGNO14967 610 aa3.1□□□□□ -1.91
RPS3AP23-202ENST00000574601 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
RPS3AP23-202ENST00000574601 TMCC1O94876 653 aa3.1□□□□□ -1.91
RPS3AP23-202ENST00000574601 NTSR2O95665 410 aa3.1□□□□□ -1.91
RPS3AP23-202ENST00000574601 TSHRP16473 764 aa3.1□□□□□ -1.91
RPS3AP23-202ENST00000574601 AMD1P17707 334 aa3.1□□□□□ -1.91
RPS3AP23-202ENST00000574601 PEX5P50542 639 aa3.1□□□□□ -1.91
RPS3AP23-202ENST00000574601 ZBTB16Q05516 673 aa3.1□□□□□ -1.91
RPS3AP23-202ENST00000574601 GALEQ14376 348 aa3.1□□□□□ -1.91
RPS3AP23-202ENST00000574601 ZNF569Q5MCW4 686 aa3.1□□□□□ -1.91
RPS3AP23-202ENST00000574601 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
RPS3AP23-202ENST00000574601 C9orf139Q6ZV77 190 aa3.1□□□□□ -1.91
RPS3AP23-202ENST00000574601 TRABD2AQ86V40 505 aa3.1□□□□□ -1.91
RPS3AP23-202ENST00000574601 NAGSQ8N159 534 aa3.1□□□□□ -1.91
RPS3AP23-202ENST00000574601 TXLNBQ8N3L3 684 aa3.1□□□□□ -1.91
RPS3AP23-202ENST00000574601 DBF4BQ8NFT6 615 aa3.1□□□□□ -1.91
RPS3AP23-202ENST00000574601 GDF15Q99988 308 aa3.1□□□□□ -1.91
RPS3AP23-202ENST00000574601 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
RPS3AP23-202ENST00000574601 CCDC134Q9H6E4 229 aa3.1□□□□□ -1.91
RPS3AP23-202ENST00000574601 EPS8L2Q9H6S3 715 aa3.1□□□□□ -1.91
RPS3AP23-202ENST00000574601 GAREM1Q9H706 876 aa3.1□□□□□ -1.91
RPS3AP23-202ENST00000574601 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
RPS3AP23-202ENST00000574601 CLIP1P30622 1438 aa3.1□□□□□ -1.91
RPS3AP23-202ENST00000574601 EEA1Q15075 1411 aa3.1□□□□□ -1.91
RPS3AP23-202ENST00000574601 SNED1Q8TER0 1413 aa3.1□□□□□ -1.91
RPS3AP23-202ENST00000574601 CEP164Q9UPV0 1460 aa3.09□□□□□ -1.91
RPS3AP23-202ENST00000574601 TOP2BQ02880 1626 aa3.09□□□□□ -1.91
RPS3AP23-202ENST00000574601 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa3.09□□□□□ -1.91
RPS3AP23-202ENST00000574601 A0A1B0GVY2 172 aa3.09□□□□□ -1.91
RPS3AP23-202ENST00000574601 EYA2O00167 538 aa3.09□□□□□ -1.91
RPS3AP23-202ENST00000574601 HSPB6O14558 160 aa3.09□□□□□ -1.91
RPS3AP23-202ENST00000574601 KPNA5O15131 536 aa3.09□□□□□ -1.91
RPS3AP23-202ENST00000574601 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
RPS3AP23-202ENST00000574601 STT3AP46977 705 aa3.09□□□□□ -1.91
RPS3AP23-202ENST00000574601 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
RPS3AP23-202ENST00000574601 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
RPS3AP23-202ENST00000574601 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
RPS3AP23-202ENST00000574601 GRM4Q14833 912 aa3.09□□□□□ -1.91
RPS3AP23-202ENST00000574601 GFOD2Q3B7J2 385 aa3.09□□□□□ -1.91
RPS3AP23-202ENST00000574601 FAM171A1Q5VUB5 890 aa3.09□□□□□ -1.91
RPS3AP23-202ENST00000574601 CYB5RLQ6IPT4 315 aa3.09□□□□□ -1.91
RPS3AP23-202ENST00000574601 SLC30A9Q6PML9 568 aa3.09□□□□□ -1.91
RPS3AP23-202ENST00000574601 SMIM29Q86T20 159 aa3.09□□□□□ -1.91
RPS3AP23-202ENST00000574601 EXOC8Q8IYI6 725 aa3.09□□□□□ -1.91
RPS3AP23-202ENST00000574601 ANKRD44Q8N8A2 993 aa3.09□□□□□ -1.91
RPS3AP23-202ENST00000574601 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa3.09□□□□□ -1.91
RPS3AP23-202ENST00000574601 WDR60Q8WVS4 1066 aa3.09□□□□□ -1.91
RPS3AP23-202ENST00000574601 CD101Q93033 1021 aa3.09□□□□□ -1.91
RPS3AP23-202ENST00000574601 BICD1Q96G01 975 aa3.09□□□□□ -1.91
RPS3AP23-202ENST00000574601 CCDC136Q96JN2 1154 aa3.09□□□□□ -1.91
RPS3AP23-202ENST00000574601 PGLYRP2Q96PD5 576 aa3.09□□□□□ -1.91
RPS3AP23-202ENST00000574601 DUX3Q96PT4 197 aa3.09□□□□□ -1.91
RPS3AP23-202ENST00000574601 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa3.09□□□□□ -1.91
RPS3AP23-202ENST00000574601 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa3.09□□□□□ -1.91
RPS3AP23-202ENST00000574601 EGLN1Q9GZT9 426 aa3.09□□□□□ -1.91
RPS3AP23-202ENST00000574601 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
RPS3AP23-202ENST00000574601 ARAP1Q96P48 1450 aa3.09□□□□□ -1.92
RPS3AP23-202ENST00000574601 HMGXB3Q12766 1538 aa3.09□□□□□ -1.92
RPS3AP23-202ENST00000574601 FAM234BA2RU67 622 aa3.08□□□□□ -1.92
RPS3AP23-202ENST00000574601 C17orf102A2RUQ5 167 aa3.08□□□□□ -1.92
RPS3AP23-202ENST00000574601 PRAC2D3DTV9 90 aa3.08□□□□□ -1.92
RPS3AP23-202ENST00000574601 TULP2O00295 520 aa3.08□□□□□ -1.92
RPS3AP23-202ENST00000574601 HLA-DQA2P01906 255 aa3.08□□□□□ -1.92
RPS3AP23-202ENST00000574601 ANXA6P08133 673 aa3.08□□□□□ -1.92
RPS3AP23-202ENST00000574601 ERVK11-1P61568 191 aa3.08□□□□□ -1.92
RPS3AP23-202ENST00000574601 ST3GAL1Q11201 340 aa3.08□□□□□ -1.92
RPS3AP23-202ENST00000574601 MYBPHQ13203 477 aa3.08□□□□□ -1.92
RPS3AP23-202ENST00000574601 PKP1Q13835 747 aa3.08□□□□□ -1.92
RPS3AP23-202ENST00000574601 ARL13BQ3SXY8 428 aa3.08□□□□□ -1.92
RPS3AP23-202ENST00000574601 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
RPS3AP23-202ENST00000574601 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa3.08□□□□□ -1.92
RPS3AP23-202ENST00000574601 DGKHQ86XP1 1220 aa3.08□□□□□ -1.92
RPS3AP23-202ENST00000574601 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa3.08□□□□□ -1.92
RPS3AP23-202ENST00000574601 NEK9Q8TD19 979 aa3.08□□□□□ -1.92
RPS3AP23-202ENST00000574601 TXNDC15Q96J42 360 aa3.08□□□□□ -1.92
RPS3AP23-202ENST00000574601 MYH16Q9H6N6 1097 aa3.08□□□□□ -1.92
RPS3AP23-202ENST00000574601 CDH22Q9UJ99 828 aa3.08□□□□□ -1.92
RPS3AP23-202ENST00000574601 NFU1Q9UMS0 254 aa3.08□□□□□ -1.92
RPS3AP23-202ENST00000574601 GAB2Q9UQC2 676 aa3.08□□□□□ -1.92
RPS3AP23-202ENST00000574601 PKP3Q9Y446 797 aa3.08□□□□□ -1.92
RPS3AP23-202ENST00000574601 XPNPEP2O43895 674 aa3.07□□□□□ -1.92
RPS3AP23-202ENST00000574601 GLP2RO95838 553 aa3.07□□□□□ -1.92
RPS3AP23-202ENST00000574601 PTMAP06454 111 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms