RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572083.5

CCDC40-206, Transcript of coiled-coil domain containing 40, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC40, Length 816 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC40-206ENST00000572083 SCAMP1O15126 338 aa20.36■□□□□ 0.85
CCDC40-206ENST00000572083 SLC28A2O43868 658 aa20.36■□□□□ 0.85
CCDC40-206ENST00000572083 SRCP12931 536 aa20.36■□□□□ 0.85
CCDC40-206ENST00000572083 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
CCDC40-206ENST00000572083 OXCT1P55809 520 aa20.36■□□□□ 0.85
CCDC40-206ENST00000572083 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
CCDC40-206ENST00000572083 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
CCDC40-206ENST00000572083 TAF5Q15542 800 aa20.36■□□□□ 0.85
CCDC40-206ENST00000572083 ISXQ2M1V0 245 aa20.36■□□□□ 0.85
CCDC40-206ENST00000572083 SEL1L3Q68CR1 1132 aa20.36■□□□□ 0.85
CCDC40-206ENST00000572083 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
CCDC40-206ENST00000572083 RNF34Q969K3 372 aa20.36■□□□□ 0.85
CCDC40-206ENST00000572083 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa20.36■□□□□ 0.85
CCDC40-206ENST00000572083 DDIT4Q9NX09 232 aa20.36■□□□□ 0.85
CCDC40-206ENST00000572083 VANGL2Q9ULK5 521 aa20.36■□□□□ 0.85
CCDC40-206ENST00000572083 BSNQ9UPA5 3926 aa20.36■□□□□ 0.85
CCDC40-206ENST00000572083 PMS2P1A4D2B8 440 aa20.35■□□□□ 0.85
CCDC40-206ENST00000572083 NEMP2A6NFY4 417 aa20.35■□□□□ 0.85
CCDC40-206ENST00000572083 PCDH8O95206 1070 aa20.35■□□□□ 0.85
CCDC40-206ENST00000572083 MT-CO1P00395 513 aa20.35■□□□□ 0.85
CCDC40-206ENST00000572083 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
CCDC40-206ENST00000572083 KCNC4Q03721 635 aa20.35■□□□□ 0.85
CCDC40-206ENST00000572083 CDKN3Q16667 212 aa20.35■□□□□ 0.85
CCDC40-206ENST00000572083 NEK5Q6P3R8 708 aa20.35■□□□□ 0.85
CCDC40-206ENST00000572083 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa20.35■□□□□ 0.85
CCDC40-206ENST00000572083 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
CCDC40-206ENST00000572083 LMO3Q8TAP4 145 aa20.35■□□□□ 0.85
CCDC40-206ENST00000572083 MED8Q96G25 268 aa20.35■□□□□ 0.85
CCDC40-206ENST00000572083 DUSP23Q9BVJ7 150 aa20.35■□□□□ 0.85
CCDC40-206ENST00000572083 SLC4A5Q9BY07 1137 aa20.35■□□□□ 0.85
CCDC40-206ENST00000572083 MUC3BQ9H195 1237 aa20.35■□□□□ 0.85
CCDC40-206ENST00000572083 USP29Q9HBJ7 922 aa20.35■□□□□ 0.85
CCDC40-206ENST00000572083 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
CCDC40-206ENST00000572083 EVA1BQ9NVM1 165 aa20.35■□□□□ 0.85
CCDC40-206ENST00000572083 OR51B4Q9Y5P0 310 aa20.35■□□□□ 0.85
CCDC40-206ENST00000572083 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
CCDC40-206ENST00000572083 A6NNZ2 444 aa20.34■□□□□ 0.85
CCDC40-206ENST00000572083 ARHGAP6O43182 974 aa20.34■□□□□ 0.85
CCDC40-206ENST00000572083 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
CCDC40-206ENST00000572083 CCR1P32246 355 aa20.34■□□□□ 0.85
CCDC40-206ENST00000572083 CHRNA3P32297 505 aa20.34■□□□□ 0.85
CCDC40-206ENST00000572083 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP20.34■□□□□ 0.85
CCDC40-206ENST00000572083 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
CCDC40-206ENST00000572083 AUHQ13825 339 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
CCDC40-206ENST00000572083 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
CCDC40-206ENST00000572083 GUSBP11Q6P575 273 aa20.34■□□□□ 0.85
CCDC40-206ENST00000572083 FOXR1Q6PIV2 292 aa20.34■□□□□ 0.85
CCDC40-206ENST00000572083 CRTC1Q6UUV9 634 aa20.34■□□□□ 0.85
CCDC40-206ENST00000572083 Q6ZSR6 202 aa20.34■□□□□ 0.85
CCDC40-206ENST00000572083 ATP11CQ8NB49 1132 aa20.34■□□□□ 0.85
CCDC40-206ENST00000572083 OR2A12Q8NGT7 310 aa20.34■□□□□ 0.85
CCDC40-206ENST00000572083 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa20.34■□□□□ 0.85
CCDC40-206ENST00000572083 IFT43Q96FT9 208 aa20.34■□□□□ 0.85
CCDC40-206ENST00000572083 KREMEN1Q96MU8 473 aa20.34■□□□□ 0.85
CCDC40-206ENST00000572083 PPP1R9BQ96SB3 815 aa20.34■□□□□ 0.85
CCDC40-206ENST00000572083 DYRK4Q9NR20 520 aa20.34■□□□□ 0.85
CCDC40-206ENST00000572083 RMND1Q9NWS8 449 aa20.34■□□□□ 0.85
CCDC40-206ENST00000572083 SSUH2Q9Y2M2 353 aa20.34■□□□□ 0.85
CCDC40-206ENST00000572083 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
CCDC40-206ENST00000572083 A0A1W2PQ27 194 aa20.33■□□□□ 0.85
CCDC40-206ENST00000572083 A0A1W2PQ64 194 aa20.33■□□□□ 0.85
CCDC40-206ENST00000572083 CPED1A4D0V7 1026 aa20.33■□□□□ 0.85
CCDC40-206ENST00000572083 K7ENP7 123 aa20.33■□□□□ 0.85
CCDC40-206ENST00000572083 K7ERQ8 282 aa20.33■□□□□ 0.85
CCDC40-206ENST00000572083 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
CCDC40-206ENST00000572083 SNAP91O60641 907 aa20.33■□□□□ 0.85
CCDC40-206ENST00000572083 SLC2A3P11169 496 aa20.33■□□□□ 0.85
CCDC40-206ENST00000572083 KRT5P13647 590 aa20.33■□□□□ 0.85
CCDC40-206ENST00000572083 RRM1P23921 792 aa20.33■□□□□ 0.85
CCDC40-206ENST00000572083 GCNT1Q02742 428 aa20.33■□□□□ 0.85
CCDC40-206ENST00000572083 LRRC63Q05C16 580 aa20.33■□□□□ 0.85
CCDC40-206ENST00000572083 COBLL1Q53SF7 1204 aa20.33■□□□□ 0.85
CCDC40-206ENST00000572083 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
CCDC40-206ENST00000572083 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
CCDC40-206ENST00000572083 IGF2-ASQ6U949 168 aa20.33■□□□□ 0.85
CCDC40-206ENST00000572083 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
CCDC40-206ENST00000572083 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa20.33■□□□□ 0.85
CCDC40-206ENST00000572083 CHST14Q8NCH0 376 aa20.33■□□□□ 0.85
CCDC40-206ENST00000572083 CCDC114Q96M63 670 aa20.33■□□□□ 0.85
CCDC40-206ENST00000572083 SLC46A1Q96NT5 459 aa20.33■□□□□ 0.85
CCDC40-206ENST00000572083 MED15Q96RN5 788 aa20.33■□□□□ 0.85
CCDC40-206ENST00000572083 THAP9Q9H5L6 903 aa20.33■□□□□ 0.85
CCDC40-206ENST00000572083 HS3ST2Q9Y278 367 aa20.33■□□□□ 0.85
CCDC40-206ENST00000572083 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa20.33■□□□□ 0.85
CCDC40-206ENST00000572083 POM121BA6NF01 834 aa20.32■□□□□ 0.84
CCDC40-206ENST00000572083 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
CCDC40-206ENST00000572083 WISP1O95388 367 aa20.32■□□□□ 0.84
CCDC40-206ENST00000572083 SKOR1P84550 965 aa20.32■□□□□ 0.84
CCDC40-206ENST00000572083 CDK17Q00537 523 aa20.32■□□□□ 0.84
CCDC40-206ENST00000572083 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
CCDC40-206ENST00000572083 FZD2Q14332 565 aa20.32■□□□□ 0.84
CCDC40-206ENST00000572083 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
CCDC40-206ENST00000572083 CCDC40Q4G0X9 1142 aa20.32■□□□□ 0.84
CCDC40-206ENST00000572083 TMEM259Q4ZIN3 620 aa20.32■□□□□ 0.84
CCDC40-206ENST00000572083 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
CCDC40-206ENST00000572083 C14orf80Q86SX3 495 aa20.32■□□□□ 0.84
CCDC40-206ENST00000572083 TMEM110Q86TL2 294 aa20.32■□□□□ 0.84
CCDC40-206ENST00000572083 DEFB106AQ8N104 65 aa20.32■□□□□ 0.84
CCDC40-206ENST00000572083 STK32AQ8WU08 396 aa20.32■□□□□ 0.84
CCDC40-206ENST00000572083 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms