RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568829.1

SPNS1-211, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 5

Gene SPNS1, Length 780 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-211ENST00000568829 CBX4O00257 560 aa16.99■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 KCNK3O14649 394 aa16.99■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 RTN2O75298 545 aa16.99■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 ENDOD1O94919 500 aa16.99■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 CALB1P05937 261 aa16.99■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 MMP8P22894 467 aa16.99■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 NUMBP49757 651 aa16.99■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 NXPH1P58417 271 aa16.99■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 MYL5Q02045 173 aa16.99■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 AGBL4Q5VU57 503 aa16.99■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 CDKAL1Q5VV42 579 aa16.99■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa16.99■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 STRADAQ7RTN6 431 aa16.99■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 FAM131BQ86XD5 332 aa16.99■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 ATP13A1Q9HD20 1204 aa16.99■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 MPP6Q9NZW5 540 aa16.99■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 IL36AQ9UHA7 158 aa16.99■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 SARDHQ9UL12 918 aa16.99■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 DKK1O94907 266 aa16.98■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 AKT2P31751 481 aa16.98■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 HNF1BP35680 557 aa16.98■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 RXRGP48443 463 aa16.98■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 MAPKAPK2P49137 400 aa16.98■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 IRAK1P51617 712 aa16.98■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 ATP11AP98196 1134 aa16.98■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 IL9RQ01113 521 aa16.98■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 SCAPQ12770 1279 aa16.98■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 STX1AQ16623 288 aa16.98■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 C22orf39Q6P5X5 142 aa16.98■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 ZNF683Q8IZ20 524 aa16.98■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 OR52K2Q8NGK3 314 aa16.98■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 OR2A12Q8NGT7 310 aa16.98■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 KLHDC7BQ96G42 594 aa16.98■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 SELENOOQ9BVL4 669 aa16.98■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 HDAC8Q9BY41 377 aa16.98■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 OSBPL2Q9H1P3 480 aa16.98■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 GANQ9H2C0 597 aa16.98■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 EBF2Q9HAK2 575 aa16.98■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 NLRC4Q9NPP4 1024 aa16.98■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 DONSONQ9NYP3 566 aa16.98■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 ADAM22Q9P0K1 906 aa16.98■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 OR12D3Q9UGF7 316 aa16.98■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 BTBD3Q9Y2F9 522 aa16.98■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 A0A0D9SEW6 157 aa16.97■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 C10orf142B7Z368 130 aa16.97■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 SNAP91O60641 907 aa16.97■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 MBD3O95983 291 aa16.97■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 MT-CO1P00395 513 aa16.97■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 WNT1P04628 370 aa16.97■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 KRT3P12035 628 aa16.97■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 RRM1P23921 792 aa16.97■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 ADRA1BP35368 520 aa16.97■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 PTPN9P43378 593 aa16.97■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 JAM2P57087 298 aa16.97■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 PPP2CBP62714 309 aa16.97■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 PPP2CAP67775 309 aa16.97■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 GNA12Q03113 381 aa16.97■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 CDO1Q16878 200 aa16.97■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 C2CD6Q53TS8 623 aa16.97■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 KCNT1Q5JUK3 1230 aa16.97■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 BNIPLQ7Z465 357 aa16.97■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 TMPRSS12Q86WS5 348 aa16.97■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 PROSER1Q86XN7 944 aa16.97■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 SAP25Q8TEE9 199 aa16.97■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 RXFP2Q8WXD0 754 aa16.97■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 LRIG1Q96JA1 1093 aa16.97■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 PSMB7Q99436 277 aa16.97■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 C11orf70Q9BRQ4 267 aa16.97■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 FANCLQ9NW38 375 aa16.97■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa16.97■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 KNL1Q8NG31 2342 aa16.97■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa16.96■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 ENC1O14682 589 aa16.96■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 PCDH8O95206 1070 aa16.96■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 RHOQP17081 205 aa16.96■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 DNA2P51530 1060 aa16.96■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 NEK3P51956 506 aa16.96■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 COPB1P53618 953 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 FMO1Q01740 532 aa16.96■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 UBXN1Q04323 297 aa16.96■□□□□ 0.31
SPNS1-211ENST00000568829 ILKQ13418 452 aa16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms