RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561685.1

RRN3-204, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

TSL 5

Gene RRN3, Length 615 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-204ENST00000561685 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa3.6□□□□□ -1.83
RRN3-204ENST00000561685 CUL7Q14999 1698 aa3.6□□□□□ -1.83
RRN3-204ENST00000561685 STMND1H3BQB6 276 aa3.6□□□□□ -1.83
RRN3-204ENST00000561685 I6L893 689 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
RRN3-204ENST00000561685 DNPH1O43598 174 aa3.6□□□□□ -1.83
RRN3-204ENST00000561685 ASNA1O43681 348 aa3.6□□□□□ -1.83
RRN3-204ENST00000561685 LDB3O75112 727 aa3.6□□□□□ -1.83
RRN3-204ENST00000561685 PARNO95453 639 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
RRN3-204ENST00000561685 PEPDP12955 493 aa3.6□□□□□ -1.83
RRN3-204ENST00000561685 UNGP13051 313 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
RRN3-204ENST00000561685 GNLYP22749 145 aa3.6□□□□□ -1.83
RRN3-204ENST00000561685 AVPR1AP37288 418 aa3.6□□□□□ -1.83
RRN3-204ENST00000561685 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
RRN3-204ENST00000561685 RCAN1P53805 252 aa3.6□□□□□ -1.83
RRN3-204ENST00000561685 ZBTB16Q05516 673 aa3.6□□□□□ -1.83
RRN3-204ENST00000561685 KIF5AQ12840 1032 aa3.6□□□□□ -1.83
RRN3-204ENST00000561685 HLFQ16534 295 aa3.6□□□□□ -1.83
RRN3-204ENST00000561685 C5orf22Q49AR2 442 aa3.6□□□□□ -1.83
RRN3-204ENST00000561685 GFI1BQ5VTD9 330 aa3.6□□□□□ -1.83
RRN3-204ENST00000561685 C9orf57Q5W0N0 161 aa3.6□□□□□ -1.83
RRN3-204ENST00000561685 Q6ZSV7 163 aa3.6□□□□□ -1.83
RRN3-204ENST00000561685 USP43Q70EL4 1123 aa3.6□□□□□ -1.83
RRN3-204ENST00000561685 SYTL1Q8IYJ3 562 aa3.6□□□□□ -1.83
RRN3-204ENST00000561685 LRRC57Q8N9N7 239 aa3.6□□□□□ -1.83
RRN3-204ENST00000561685 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
RRN3-204ENST00000561685 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
RRN3-204ENST00000561685 TMEM163Q8TC26 289 aa3.6□□□□□ -1.83
RRN3-204ENST00000561685 FAM216AQ8WUB2 273 aa3.6□□□□□ -1.83
RRN3-204ENST00000561685 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa3.6□□□□□ -1.83
RRN3-204ENST00000561685 C18orf8Q96DM3 657 aa3.6□□□□□ -1.83
RRN3-204ENST00000561685 CCDC136Q96JN2 1154 aa3.6□□□□□ -1.83
RRN3-204ENST00000561685 TNIP3Q96KP6 325 aa3.6□□□□□ -1.83
RRN3-204ENST00000561685 FRG2BQ96QU4 278 aa3.6□□□□□ -1.83
RRN3-204ENST00000561685 MYD88Q99836 296 aa3.6□□□□□ -1.83
RRN3-204ENST00000561685 MECRQ9BV79 373 aa3.6□□□□□ -1.83
RRN3-204ENST00000561685 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
RRN3-204ENST00000561685 HIPK3Q9H422 1215 aa3.6□□□□□ -1.83
RRN3-204ENST00000561685 SLC25A13Q9UJS0 675 aa3.6□□□□□ -1.83
RRN3-204ENST00000561685 PHTF1Q9UMS5 762 aa3.6□□□□□ -1.83
RRN3-204ENST00000561685 RAP2CQ9Y3L5 183 aa3.6□□□□□ -1.83
RRN3-204ENST00000561685 POGZQ7Z3K3 1410 aa3.6□□□□□ -1.83
RRN3-204ENST00000561685 FAM90A18PA6NE21 464 aa3.59□□□□□ -1.83
RRN3-204ENST00000561685 FAM90A16PA6NEW6 464 aa3.59□□□□□ -1.83
RRN3-204ENST00000561685 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa3.59□□□□□ -1.83
RRN3-204ENST00000561685 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa3.59□□□□□ -1.83
RRN3-204ENST00000561685 SLC16A5O15375 505 aa3.59□□□□□ -1.83
RRN3-204ENST00000561685 ASAP2O43150 1006 aa3.59□□□□□ -1.83
RRN3-204ENST00000561685 TMCC1O94876 653 aa3.59□□□□□ -1.83
RRN3-204ENST00000561685 FAM90A15PP0C7V4 464 aa3.59□□□□□ -1.83
RRN3-204ENST00000561685 FAM90A14PP0C7W9 464 aa3.59□□□□□ -1.83
RRN3-204ENST00000561685 COMPP49747 757 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
RRN3-204ENST00000561685 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
RRN3-204ENST00000561685 PICALMQ13492 652 aa3.59□□□□□ -1.83
RRN3-204ENST00000561685 ZACNQ401N2 412 aa3.59□□□□□ -1.83
RRN3-204ENST00000561685 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
RRN3-204ENST00000561685 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa3.59□□□□□ -1.83
RRN3-204ENST00000561685 SPSB3Q6PJ21 355 aa3.59□□□□□ -1.83
RRN3-204ENST00000561685 PRSS57Q6UWY2 283 aa3.59□□□□□ -1.83
RRN3-204ENST00000561685 ZNF367Q7RTV3 350 aa3.59□□□□□ -1.83
RRN3-204ENST00000561685 C16orf82Q7Z2V1 217 aa3.59□□□□□ -1.83
RRN3-204ENST00000561685 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa3.59□□□□□ -1.83
RRN3-204ENST00000561685 CLIP4Q8N3C7 705 aa3.59□□□□□ -1.83
RRN3-204ENST00000561685 TMEM217Q8N7C4 229 aa3.59□□□□□ -1.83
RRN3-204ENST00000561685 OR14A16Q8NHC5 309 aa3.59□□□□□ -1.83
RRN3-204ENST00000561685 FAM71BQ8TC56 605 aa3.59□□□□□ -1.83
RRN3-204ENST00000561685 SLC2A12Q8TD20 617 aa3.59□□□□□ -1.83
RRN3-204ENST00000561685 SLC35F5Q8WV83 523 aa3.59□□□□□ -1.83
RRN3-204ENST00000561685 RTP4Q96DX8 246 aa3.59□□□□□ -1.83
RRN3-204ENST00000561685 SGCZQ96LD1 299 aa3.59□□□□□ -1.83
RRN3-204ENST00000561685 PDE11AQ9HCR9 933 aa3.59□□□□□ -1.83
RRN3-204ENST00000561685 MDFICQ9P1T7 246 aa3.59□□□□□ -1.83
RRN3-204ENST00000561685 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
RRN3-204ENST00000561685 RAI2Q9Y5P3 530 aa3.59□□□□□ -1.83
RRN3-204ENST00000561685 CD109Q6YHK3 1445 aa3.59□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 CEP350Q5VT06 3117 aa3.59□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa3.59□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 KIAA0556O60303 1618 aa3.59□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa3.58□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 C17orf102A2RUQ5 167 aa3.58□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa3.58□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 SMTNL1A8MU46 457 aa3.58□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 CAND2O75155 1236 aa3.58□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 ZNF432O94892 652 aa3.58□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 SOX30O94993 753 aa3.58□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 PPP1R3DO95685 299 aa3.58□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 ABCB4P21439 1286 aa3.58□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 PRKCHP24723 683 aa3.58□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 GNALP38405 381 aa3.58□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 TECP42680 631 aa3.58□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 AMTP48728 403 aa3.58□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 NUDT6P53370 316 aa3.58□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 ERVFC1-1P60608 527 aa3.58□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 STARD3Q14849 445 aa3.58□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 PLCB4Q15147 1175 aa3.58□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 BTBD16Q32M84 506 aa3.58□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa3.58□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 NFRKBQ6P4R8 1299 aa3.58□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 TMEM71Q6P5X7 295 aa3.58□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 KSR2Q6VAB6 950 aa3.58□□□□□ -1.84
RRN3-204ENST00000561685 RAB11FIP2Q7L804 512 aa3.58□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms