RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558394.5

TSPAN3-204, Transcript of tetraspanin 3, humanhuman

TSL 4

Gene TSPAN3, Length 550 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN3-204ENST00000558394 ARL13BQ3SXY8 428 aa18.28■□□□□ 0.52
TSPAN3-204ENST00000558394 ZCWPW2Q504Y3 356 aa18.28■□□□□ 0.52
TSPAN3-204ENST00000558394 OR6B2Q6IFH4 312 aa18.28■□□□□ 0.52
TSPAN3-204ENST00000558394 GUSBP11Q6P575 273 aa18.28■□□□□ 0.52
TSPAN3-204ENST00000558394 GCNT7Q6ZNI0 430 aa18.28■□□□□ 0.52
TSPAN3-204ENST00000558394 USP53Q70EK8 1073 aa18.28■□□□□ 0.52
TSPAN3-204ENST00000558394 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa18.28■□□□□ 0.52
TSPAN3-204ENST00000558394 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa18.28■□□□□ 0.52
TSPAN3-204ENST00000558394 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
TSPAN3-204ENST00000558394 GLMNQ92990 594 aa18.28■□□□□ 0.52
TSPAN3-204ENST00000558394 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
TSPAN3-204ENST00000558394 NOX5Q96PH1 765 aa18.28■□□□□ 0.52
TSPAN3-204ENST00000558394 IL12RB2Q99665 862 aa18.28■□□□□ 0.52
TSPAN3-204ENST00000558394 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa18.28■□□□□ 0.52
TSPAN3-204ENST00000558394 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP18.28■□□□□ 0.52
TSPAN3-204ENST00000558394 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa18.28■□□□□ 0.52
TSPAN3-204ENST00000558394 U3KQA8 63 aa18.28■□□□□ 0.52
TSPAN3-204ENST00000558394 TRPM6Q9BX84 2022 aa18.28■□□□□ 0.52
TSPAN3-204ENST00000558394 KCNU1A8MYU2 1149 aa18.27■□□□□ 0.52
TSPAN3-204ENST00000558394 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
TSPAN3-204ENST00000558394 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
TSPAN3-204ENST00000558394 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
TSPAN3-204ENST00000558394 SLC2A3P11169 496 aa18.27■□□□□ 0.52
TSPAN3-204ENST00000558394 CHRNA3P32297 505 aa18.27■□□□□ 0.52
TSPAN3-204ENST00000558394 SYKP43405 635 aa18.27■□□□□ 0.52
TSPAN3-204ENST00000558394 ACADSBP45954 432 aa18.27■□□□□ 0.52
TSPAN3-204ENST00000558394 RPIAP49247 311 aa18.27■□□□□ 0.52
TSPAN3-204ENST00000558394 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
TSPAN3-204ENST00000558394 SYPL2Q5VXT5 272 aa18.27■□□□□ 0.52
TSPAN3-204ENST00000558394 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
TSPAN3-204ENST00000558394 CRTC1Q6UUV9 634 aa18.27■□□□□ 0.52
TSPAN3-204ENST00000558394 BEND5Q7L4P6 421 aa18.27■□□□□ 0.52
TSPAN3-204ENST00000558394 PARGQ86W56 976 aa18.27■□□□□ 0.52
TSPAN3-204ENST00000558394 SH2D3CQ8N5H7 860 aa18.27■□□□□ 0.52
TSPAN3-204ENST00000558394 WDR48Q8TAF3 677 aa18.27■□□□□ 0.52
TSPAN3-204ENST00000558394 NT5C1BQ96P26 610 aa18.27■□□□□ 0.52
TSPAN3-204ENST00000558394 FEM1AQ9BSK4 669 aa18.27■□□□□ 0.52
TSPAN3-204ENST00000558394 SALL4Q9UJQ4 1053 aa18.27■□□□□ 0.52
TSPAN3-204ENST00000558394 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa18.27■□□□□ 0.52
TSPAN3-204ENST00000558394 RP1P56715 2156 aa18.26■□□□□ 0.51
TSPAN3-204ENST00000558394 CCDC187A0A096LP49 1063 aa18.26■□□□□ 0.51
TSPAN3-204ENST00000558394 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
TSPAN3-204ENST00000558394 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
TSPAN3-204ENST00000558394 AQP9O43315 295 aa18.26■□□□□ 0.51
TSPAN3-204ENST00000558394 F13A1P00488 732 aa18.26■□□□□ 0.51
TSPAN3-204ENST00000558394 PRNPP04156 253 aa18.26■□□□□ 0.51
TSPAN3-204ENST00000558394 ITGA2BP08514 1039 aa18.26■□□□□ 0.51
TSPAN3-204ENST00000558394 PRR29P0C7W0 189 aa18.26■□□□□ 0.51
TSPAN3-204ENST00000558394 SFTPCP11686 197 aa18.26■□□□□ 0.51
TSPAN3-204ENST00000558394 CMA1P23946 247 aa18.26■□□□□ 0.51
TSPAN3-204ENST00000558394 KRT83P78385 493 aa18.26■□□□□ 0.51
TSPAN3-204ENST00000558394 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP18.26■□□□□ 0.51
TSPAN3-204ENST00000558394 DEFB133Q30KQ1 61 aa18.26■□□□□ 0.51
TSPAN3-204ENST00000558394 CLEC14AQ86T13 490 aa18.26■□□□□ 0.51
TSPAN3-204ENST00000558394 PPM1KQ8N3J5 372 aa18.26■□□□□ 0.51
TSPAN3-204ENST00000558394 UBR7Q8N806 425 aa18.26■□□□□ 0.51
TSPAN3-204ENST00000558394 EXD3Q8N9H8 876 aa18.26■□□□□ 0.51
TSPAN3-204ENST00000558394 ATP11CQ8NB49 1132 aa18.26■□□□□ 0.51
TSPAN3-204ENST00000558394 LMX1AQ8TE12 382 aa18.26■□□□□ 0.51
TSPAN3-204ENST00000558394 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
TSPAN3-204ENST00000558394 PPP1R16AQ96I34 528 aa18.26■□□□□ 0.51
TSPAN3-204ENST00000558394 TSG101Q99816 390 aa18.26■□□□□ 0.51
TSPAN3-204ENST00000558394 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
TSPAN3-204ENST00000558394 MUC3BQ9H195 1237 aa18.26■□□□□ 0.51
TSPAN3-204ENST00000558394 CAAP1Q9H8G2 361 aa18.26■□□□□ 0.51
TSPAN3-204ENST00000558394 FAM204AQ9H8W3 233 aa18.26■□□□□ 0.51
TSPAN3-204ENST00000558394 POPDC2Q9HBU9 364 aa18.26■□□□□ 0.51
TSPAN3-204ENST00000558394 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
TSPAN3-204ENST00000558394 PTPN13Q12923 2485 aa18.26■□□□□ 0.51
TSPAN3-204ENST00000558394 CSF2P04141 144 aa18.25■□□□□ 0.51
TSPAN3-204ENST00000558394 NTRK1P04629 796 aa18.25■□□□□ 0.51
TSPAN3-204ENST00000558394 NME1P15531 152 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
TSPAN3-204ENST00000558394 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
TSPAN3-204ENST00000558394 RABIFP47224 123 aa18.25■□□□□ 0.51
TSPAN3-204ENST00000558394 INHBCP55103 352 aa18.25■□□□□ 0.51
TSPAN3-204ENST00000558394 SPIDRQ14159 915 aa18.25■□□□□ 0.51
TSPAN3-204ENST00000558394 COLEC12Q5KU26 742 aa18.25■□□□□ 0.51
TSPAN3-204ENST00000558394 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
TSPAN3-204ENST00000558394 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
TSPAN3-204ENST00000558394 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
TSPAN3-204ENST00000558394 TMIEQ8NEW7 156 aa18.25■□□□□ 0.51
TSPAN3-204ENST00000558394 NAT6Q93015 286 aa18.25■□□□□ 0.51
TSPAN3-204ENST00000558394 MED15Q96RN5 788 aa18.25■□□□□ 0.51
TSPAN3-204ENST00000558394 RCOR1Q9UKL0 485 aa18.25■□□□□ 0.51
TSPAN3-204ENST00000558394 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
TSPAN3-204ENST00000558394 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa18.24■□□□□ 0.51
TSPAN3-204ENST00000558394 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa18.24■□□□□ 0.51
TSPAN3-204ENST00000558394 TPP1O14773 563 aa18.24■□□□□ 0.51
TSPAN3-204ENST00000558394 MUSKO15146 869 aa18.24■□□□□ 0.51
TSPAN3-204ENST00000558394 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
TSPAN3-204ENST00000558394 CTSLP07711 333 aa18.24■□□□□ 0.51
TSPAN3-204ENST00000558394 JUNDP17535 347 aa18.24■□□□□ 0.51
TSPAN3-204ENST00000558394 CCR1P32246 355 aa18.24■□□□□ 0.51
TSPAN3-204ENST00000558394 RPS21P63220 83 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
TSPAN3-204ENST00000558394 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
TSPAN3-204ENST00000558394 DPYDQ12882 1025 aa18.24■□□□□ 0.51
TSPAN3-204ENST00000558394 FZD2Q14332 565 aa18.24■□□□□ 0.51
TSPAN3-204ENST00000558394 SEL1L3Q68CR1 1132 aa18.24■□□□□ 0.51
TSPAN3-204ENST00000558394 FBXL22Q6P050 247 aa18.24■□□□□ 0.51
TSPAN3-204ENST00000558394 JAMLQ86YT9 394 aa18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms