RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541295.5

LMO3-225, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

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Gene LMO3, Length 3,498 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-225ENST00000541295 NDE1Q9NXR1 346 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 CFAP97Q9P2B7 532 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 KLHL9Q9P2J3 617 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 CPNE7Q9UBL6 633 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 SLC39A10Q9ULF5 831 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 V9GY48 417 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 FAM196BA6NMK8 535 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 ATP2A1O14983 1001 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 CABYRO75952 493 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 OPN1LWP04000 364 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 FGF4P08620 206 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 PRPS2P11908 318 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 RCVRNP35243 200 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 GGCXP38435 758 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 PPP3CCP48454 512 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 DRG2P55039 364 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
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LMO3-225ENST00000541295 GRIK4Q16099 956 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 STX1AQ16623 288 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 LRRC36Q1X8D7 754 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 DNAL1Q4LDG9 190 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 FOXB2Q5VYV0 432 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 GSTA5Q7RTV2 222 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 CLEC10AQ8IUN9 316 aa6.29□□□□□ -1.4
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LMO3-225ENST00000541295 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP6.29□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 TRPV3Q8NET8 790 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 OR52N1Q8NH53 320 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 BAP1Q92560 729 aa6.29□□□□□ -1.4
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LMO3-225ENST00000541295 ADAM33Q9BZ11 813 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 OSBPL7Q9BZF2 842 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 C2orf40Q9H1Z8 148 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 LHX5Q9H2C1 402 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
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LMO3-225ENST00000541295 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
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LMO3-225ENST00000541295 ARHGAP6O43182 974 aa6.29□□□□□ -1.4
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LMO3-225ENST00000541295 CCNJQ5T5M9 372 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 ADGRF1Q5T601 910 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 ARMCX5Q6P1M9 558 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 C1orf94Q6P1W5 598 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 WDR93Q6P2C0 686 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 FRA10AC1Q70Z53 315 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 FBXO27Q8NI29 283 aa6.29□□□□□ -1.4
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LMO3-225ENST00000541295 C17orf62Q9BQA9 187 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 FERMT1Q9BQL6 677 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 CDADC1Q9BWV3 514 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 GON7Q9BXV9 100 aa6.29□□□□□ -1.4
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LMO3-225ENST00000541295 KLHL11Q9NVR0 708 aa6.29□□□□□ -1.4
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LMO3-225ENST00000541295 GRHPRQ9UBQ7 328 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 TINAGQ9UJW2 476 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP6.29□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 SNX13Q9Y5W8 968 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 DUOX1Q9NRD9 1551 aa6.28□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 FAM47DPA6NHR8 397 aa6.28□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 HMX3A6NHT5 357 aa6.28□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 EVPLLA8MZ36 301 aa6.28□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 hCG_2039718K7EN88 272 aa6.28□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 GPR37O15354 613 aa6.28□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 OPHN1O60890 802 aa6.28□□□□□ -1.4
LMO3-225ENST00000541295 RAD17O75943 681 aa6.28□□□□□ -1.4
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