RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533557.5

BBS1-222, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 1,043 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-222	ENST00000533557	FAXDC2	Q96IV6	333 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	SEMA3C	Q99985	751 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	DUSP23	Q9BVJ7	150 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	MIS12	Q9H081	205 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	HESX1	Q9UBX0	185 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	RABGEF1	Q9UJ41	708 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		12.46	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	SPTY2D1-AS1	A0A0U1RR47	76 aa		12.46	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	NTN3	O00634	580 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	GJB6	O95452	261 aa		12.46	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	PAK4	O96013	591 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	ITGA2B	P08514	1039 aa		12.46	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	SETSIP	P0DME0	302 aa		12.46	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	VDR	P11473	427 aa		12.46	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	AKT2	P31751	481 aa		12.46	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	VASP	P50552	380 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	HNRNPK	P61978	463 aa	Known RBP eCLIP	12.46	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	CENPC	Q03188	943 aa		12.46	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	C1orf61	Q13536	156 aa		12.46	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	CUL2	Q13617	745 aa		12.46	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	NFIL3	Q16649	462 aa		12.46	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	RESP18	Q5W5W9	173 aa		12.46	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	VASH2	Q86V25	355 aa		12.46	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	CHSY1	Q86X52	802 aa		12.46	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	RBFA	Q8N0V3	343 aa		12.46	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	OR2A12	Q8NGT7	310 aa		12.46	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		12.46	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	KLF6	Q99612	283 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	DDX50	Q9BQ39	737 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	FEM1A	Q9BSK4	669 aa		12.46	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	EXOC1	Q9NV70	894 aa		12.46	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	SALL4	Q9UJQ4	1053 aa		12.46	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	TYW5	A2RUC4	315 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	AGRP	O00253	132 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	AQP9	O43315	295 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	SMAD6	O43541	496 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	CALU	O43852	315 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	ITGB2	P05107	769 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	PRR29	P0C7W0	189 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	SRC	P12931	536 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	KRT13	P13646	458 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	GTF2H1	P32780	548 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	UGT1A5	P35504	534 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	NNMT	P40261	264 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	MXI1	P50539	228 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	LRMP	Q12912	555 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	ADAM9	Q13443	819 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	ZCWPW2	Q504Y3	356 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	NEK5	Q6P3R8	708 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	XKR5	Q6UX68	686 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	NYAP1	Q6ZVC0	841 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	PTAR1	Q7Z6K3	402 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	PTRH1	Q86Y79	214 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	TTC39C	Q8N584	583 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	SH2D3C	Q8N5H7	860 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	LMX1A	Q8TE12	382 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	KAT5	Q92993	513 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	PPP1R13B	Q96KQ4	1090 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	PSMG3-AS1	Q96PY0	264 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	CCDC3	Q9BQI4	270 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	ARHGAP9	Q9BRR9	750 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	BOC	Q9BWV1	1114 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	FOXP3	Q9BZS1	431 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	CLPB	Q9H078	707 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	EIF2AK3	Q9NZJ5	1116 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	MAN2B2	Q9Y2E5	1009 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	PCDHGA7	Q9Y5G6	932 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	PCDHGA4	Q9Y5G9	962 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	HS3ST3A1	Q9Y663	406 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	CSNK1G3	Q9Y6M4	447 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557		A6NNZ2	444 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	C1QTNF3-AMACR	E9PGA6	284 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	KPNA3	O00505	521 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	PLD2	O14939	933 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	ALOX15B	O15296	676 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	SNAP91	O60641	907 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	TCEA3	O75764	348 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	PCDH8	O95206	1070 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	YEATS4	O95619	227 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	IGLV3-25	P01717	112 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	CELA2B	P08218	269 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF18	P17022	549 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	JUND	P17535	347 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	BRD2	P25440	801 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	CHRNA3	P32297	505 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	GGCX	P38435	758 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	MLLT3	P42568	568 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	RPL34	P49207	117 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
BBS1-222	ENST00000533557	SULT2A1	Q06520	285 aa		12.44	□□□□□ -0.42

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