RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526255.1

RCOR3-208, Transcript of REST corepressor 3, human

TSL 1 (best)

Gene RCOR3, Length 909 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RCOR3-208	ENST00000526255	ADSSL1	Q8N142	457 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	CLPB	Q9H078	707 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	USP44	Q9H0E7	712 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	SFXN1	Q9H9B4	322 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	TLR8	Q9NR97	1041 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	POLG2	Q9UHN1	485 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	PKP3	Q9Y446	797 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	MROH2A	A6NES4	1674 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	SAMD9	Q5K651	1589 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	KIF14	Q15058	1648 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	GRID2IP	A4D2P6	1211 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	LINC00473	A8K010	186 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	TTC34	A8MYJ7	566 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255		H7C1Q1	480 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	PTP4A3	O75365	173 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	GFPT2	O94808	682 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	MLYCD	O95822	493 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	TTLL1	O95922	423 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	RFPL3S	P0C7P2	107 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	LYL1	P12980	280 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	HOXB9	P17482	250 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	DRD4	P21917	467 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	CXCR5	P32302	372 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	HNF1B	P35680	557 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	STAT1	P42224	750 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	AVPR1B	P47901	424 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	B4GALNT1	Q00973	533 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	ALKBH1	Q13686	389 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	LARS2	Q15031	903 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	PTPA	Q15257	358 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	ITPRIPL1	Q6GPH6	555 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	GJB7	Q6PEY0	223 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	TNIP2	Q8NFZ5	429 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	RAB40A	Q8WXH6	277 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	ERP27	Q96DN0	273 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	TRIM44	Q96DX7	344 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	HIC2	Q96JB3	615 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	MAP7D2	Q96T17	732 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	BARD1	Q99728	777 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	PDCL3	Q9H2J4	239 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	USP29	Q9HBJ7	922 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	KL	Q9UEF7	1012 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	ZNHIT2	Q9UHR6	403 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	SYNM	O15061	1565 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	PZP	P20742	1482 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	IQGAP1	P46940	1657 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	FSD2	A1L4K1	749 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	C16orf96	A6NNT2	1141 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	BTBD19	C9JJ37	291 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	QSOX1	O00391	747 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	TSPAN4	O14817	238 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	DOK2	O60496	412 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	UBL4A	P11441	157 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	NDUFB7	P17568	137 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	PRKCH	P24723	683 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	GGT5	P36269	586 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	PAFAH1B1	P43034	410 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	CCT8	P50990	548 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	MRPS35	P82673	323 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	FOXI1	Q12951	378 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	CNGA3	Q16281	694 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	RUNDC3A	Q59EK9	446 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	VWA5B1	Q5TIE3	1220 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	MTFR2	Q6P444	385 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	TERB1	Q8NA31	727 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	NCSTN	Q92542	709 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	C5orf34	Q96MH7	638 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	MMS19	Q96T76	1030 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	HNRNPUL1	Q9BUJ2	856 aa	Known RBP eCLIP	4.54	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	NPL	Q9BXD5	320 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	HDHD5	Q9BXW7	423 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	ADGRE3	Q9BY15	652 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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