RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517517.1

RRM2B-204, Transcript of ribonucleotide reductase regulatory TP53 inducible subunit M2B, human

TSL 4

Gene RRM2B, Length 573 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRM2B-204	ENST00000517517	CCR5	P51681	352 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RRM2B-204	ENST00000517517	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
RRM2B-204	ENST00000517517	ATP11A	P98196	1134 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RRM2B-204	ENST00000517517	CDR2	Q01850	454 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RRM2B-204	ENST00000517517	NCAPH	Q15003	741 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RRM2B-204	ENST00000517517	CCDC14	Q49A88	953 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RRM2B-204	ENST00000517517	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
RRM2B-204	ENST00000517517	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
RRM2B-204	ENST00000517517	GATAD2A	Q86YP4	633 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RRM2B-204	ENST00000517517	OR2A12	Q8NGT7	310 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RRM2B-204	ENST00000517517	PIP4K2C	Q8TBX8	421 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RRM2B-204	ENST00000517517	VOPP1	Q96AW1	172 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RRM2B-204	ENST00000517517	ARRDC3	Q96B67	414 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RRM2B-204	ENST00000517517	MUC3B	Q9H195	1237 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RRM2B-204	ENST00000517517	RRN3	Q9NYV6	651 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RRM2B-204	ENST00000517517	STAP1	Q9ULZ2	295 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RRM2B-204	ENST00000517517	NEU3	Q9UQ49	428 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RRM2B-204	ENST00000517517	HS3ST2	Q9Y278	367 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RRM2B-204	ENST00000517517	IGSF10	Q6WRI0	2623 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RRM2B-204	ENST00000517517	CHD5	Q8TDI0	1954 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RRM2B-204	ENST00000517517	TBC1D3D	A0A087WVF3	549 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RRM2B-204	ENST00000517517	TBC1D3I	A0A087WXS9	549 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RRM2B-204	ENST00000517517	TBC1D3E	A0A087X179	549 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RRM2B-204	ENST00000517517	TBC1D3K	A0A087X1G2	549 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RRM2B-204	ENST00000517517		A0A1B0GTQ1	180 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RRM2B-204	ENST00000517517	TBC1D3F	A6NER0	549 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RRM2B-204	ENST00000517517	GOLGA8CP	A6NN73	597 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RRM2B-204	ENST00000517517	TBC1D3L	B9A6J9	549 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RRM2B-204	ENST00000517517	FAM72C	H0Y354	149 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RRM2B-204	ENST00000517517	SRGAP2	O75044	1071 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RRM2B-204	ENST00000517517	CD160	O95971	181 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RRM2B-204	ENST00000517517	RHOC	P08134	193 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RRM2B-204	ENST00000517517	TBC1D3H	P0C7X1	549 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RRM2B-204	ENST00000517517	UNG	P13051	313 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RRM2B-204	ENST00000517517	HNRNPD	Q14103	355 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RRM2B-204	ENST00000517517	SYCP1	Q15431	976 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RRM2B-204	ENST00000517517	TEAD4	Q15561	434 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RRM2B-204	ENST00000517517	PIP5KL1	Q5T9C9	394 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RRM2B-204	ENST00000517517	FAM72A	Q5TYM5	149 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RRM2B-204	ENST00000517517	TBC1D3G	Q6DHY5	549 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RRM2B-204	ENST00000517517	TBC1D3C	Q6IPX1	549 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RRM2B-204	ENST00000517517	FAM72D	Q6L9T8	149 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RRM2B-204	ENST00000517517	FAM72B	Q86X60	149 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RRM2B-204	ENST00000517517	TBC1D3	Q8IZP1	549 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RRM2B-204	ENST00000517517	RXFP2	Q8WXD0	754 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RRM2B-204	ENST00000517517	OR8D1	Q8WZ84	308 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RRM2B-204	ENST00000517517	C1orf74	Q96LT6	269 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RRM2B-204	ENST00000517517	C11orf70	Q9BRQ4	267 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RRM2B-204	ENST00000517517	TNKS2	Q9H2K2	1166 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RRM2B-204	ENST00000517517	SLC25A13	Q9UJS0	675 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RRM2B-204	ENST00000517517	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RRM2B-204	ENST00000517517	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RRM2B-204	ENST00000517517	FLRT2	O43155	660 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RRM2B-204	ENST00000517517	PLRG1	O43660	514 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RRM2B-204	ENST00000517517	PCDHGA12	O60330	932 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RRM2B-204	ENST00000517517	TRIM16	O95361	564 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RRM2B-204	ENST00000517517	F9	P00740	461 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RRM2B-204	ENST00000517517	ATP1A3	P13637	1013 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RRM2B-204	ENST00000517517	CD38	P28907	300 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RRM2B-204	ENST00000517517	RDX	P35241	583 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RRM2B-204	ENST00000517517	NNMT	P40261	264 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RRM2B-204	ENST00000517517	CCT8	P50990	548 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RRM2B-204	ENST00000517517	OXCT1	P55809	520 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RRM2B-204	ENST00000517517	CLDN6	P56747	220 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RRM2B-204	ENST00000517517	SNX16	P57768	344 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RRM2B-204	ENST00000517517	ARF5	P84085	180 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RRM2B-204	ENST00000517517	BNIP3	Q12983	259 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RRM2B-204	ENST00000517517	CDO1	Q16878	200 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RRM2B-204	ENST00000517517	MANEAL	Q5VSG8	457 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RRM2B-204	ENST00000517517	CCNI2	Q6ZMN8	369 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RRM2B-204	ENST00000517517	ADAT2	Q7Z6V5	191 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RRM2B-204	ENST00000517517	ZCCHC14	Q8WYQ9	949 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RRM2B-204	ENST00000517517	KLK6	Q92876	244 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RRM2B-204	ENST00000517517	SERAC1	Q96JX3	654 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RRM2B-204	ENST00000517517	ACE2	Q9BYF1	805 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RRM2B-204	ENST00000517517	AASDHPPT	Q9NRN7	309 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RRM2B-204	ENST00000517517	LIMA1	Q9UHB6	759 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RRM2B-204	ENST00000517517	FASN	P49327	2511 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RRM2B-204	ENST00000517517	TDRD6	O60522	2096 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RRM2B-204	ENST00000517517	TRPM6	Q9BX84	2022 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RRM2B-204	ENST00000517517	OR1E1	P30953	314 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RRM2B-204	ENST00000517517	CHRNA3	P32297	505 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RRM2B-204	ENST00000517517	ACVRL1	P37023	503 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RRM2B-204	ENST00000517517	HDAC4	P56524	1084 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RRM2B-204	ENST00000517517	NXPH1	P58417	271 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RRM2B-204	ENST00000517517	SCAP	Q12770	1279 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RRM2B-204	ENST00000517517	DPY19L3	Q6ZPD9	716 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RRM2B-204	ENST00000517517	ARC	Q7LC44	396 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RRM2B-204	ENST00000517517	KANSL1	Q7Z3B3	1105 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RRM2B-204	ENST00000517517	SETD3	Q86TU7	594 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RRM2B-204	ENST00000517517	ZNF677	Q86XU0	584 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RRM2B-204	ENST00000517517	CCDC185	Q8N715	623 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RRM2B-204	ENST00000517517	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RRM2B-204	ENST00000517517	SAP25	Q8TEE9	199 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RRM2B-204	ENST00000517517	HAPLN3	Q96S86	360 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RRM2B-204	ENST00000517517	ELF4	Q99607	663 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RRM2B-204	ENST00000517517	SPON2	Q9BUD6	331 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RRM2B-204	ENST00000517517	WASF2	Q9Y6W5	498 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RRM2B-204	ENST00000517517	BPTF	Q12830	3046 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RRM2B-204	ENST00000517517	TCRBV5S1A1T	A0A578	114 aa		13.74	□□□□□ -0.21

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.9 ms