RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504295.1

COPB2-204, Transcript of coatomer protein complex subunit beta 2, humanhuman

TSL 2

Gene COPB2, Length 3,524 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2-204ENST00000504295 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa6.51□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 BPIFB1Q8TDL5 484 aa6.51□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 OR52B2Q96RD2 323 aa6.51□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 TEX13BQ9BXU2 312 aa6.51□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 GBA3Q9H227 469 aa6.51□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 LRRC4Q9HBW1 653 aa6.51□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 PALMDQ9NP74 551 aa6.51□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 RNF146Q9NTX7 359 aa6.51□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa6.51□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 CHMP2BQ9UQN3 213 aa6.51□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa6.51□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 LRP4O75096 1905 aa6.51□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 TLDC2A0PJX2 215 aa6.5□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa6.5□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 ANKRD28O15084 1053 aa6.5□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 SLC7A4O43246 635 aa6.5□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 OPHN1O60890 802 aa6.5□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 AP1G2O75843 785 aa6.5□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 SUPT7LO94864 414 aa6.5□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 UGT2B4P06133 528 aa6.5□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 CYP2C8P10632 490 aa6.5□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 RBP3P10745 1247 aa6.5□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 HADHAP40939 763 aa6.5□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 LIG4P49917 911 aa6.5□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 AQP5P55064 265 aa6.5□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 GBE1Q04446 702 aa6.5□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 IKZF1Q13422 519 aa6.5□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 RCN2Q14257 317 aa6.5□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 PDK3Q15120 406 aa6.5□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 PSMD5Q16401 504 aa6.5□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 DUOXA2Q1HG44 320 aa6.5□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 HSDL1Q3SXM5 330 aa6.5□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 NADK2Q4G0N4 442 aa6.5□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 ATG16L1Q676U5 607 aa6.5□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 SWSAP1Q6NVH7 229 aa6.5□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa6.5□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 SATL1Q86VE3 508 aa6.5□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 GALNT13Q8IUC8 556 aa6.5□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 CCDC185Q8N715 623 aa6.5□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 NPWQ8N729 165 aa6.5□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 SLAIN1Q8ND83 568 aa6.5□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 GPR150Q8NGU9 434 aa6.5□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 TRIB2Q92519 343 aa6.5□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 ZBTB10Q96DT7 871 aa6.5□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 CEP170P1Q96L14 293 aa6.5□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 FCRL1Q96LA6 429 aa6.5□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 RTP3Q9BQQ7 232 aa6.5□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 MAGEB5Q9BZ81 275 aa6.5□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 BRINP2Q9C0B6 783 aa6.5□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 TNKS2Q9H2K2 1166 aa6.5□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 FAM92AA1XBS5 289 aa6.5□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 MED7O43513 233 aa6.5□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 NEBLO76041 1014 aa6.5□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 SEC14L2O76054 403 aa6.5□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 OR6B1O95007 311 aa6.5□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 DNAJB2P25686 324 aa6.5□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 EPHA3P29320 983 aa6.5□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 CCT8P50990 548 aa6.5□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 TMEM259Q4ZIN3 620 aa6.5□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 TECRLQ5HYJ1 363 aa6.5□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 JADE1Q6IE81 842 aa6.5□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa6.5□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 EXOC8Q8IYI6 725 aa6.5□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 SYCP3Q8IZU3 236 aa6.5□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 FIBCD1Q8N539 461 aa6.5□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 ZNF781Q8N8C0 355 aa6.5□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 CD99L2Q8TCZ2 262 aa6.5□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 FNBP1Q96RU3 617 aa6.5□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 MMP19Q99542 508 aa6.5□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 TUBA1CQ9BQE3 449 aa6.5□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 MSTO1Q9BUK6 570 aa6.5□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 SPATC1LQ9H0A9 340 aa6.5□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 GSTO2Q9H4Y5 243 aa6.5□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 ACAD9Q9H845 621 aa6.5□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 C8orf4Q9NR00 106 aa6.5□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 SRRDQ9UH36 339 aa6.5□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 TRIM17Q9Y577 477 aa6.5□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa6.5□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 SERTM1A2A2V5 107 aa6.5□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 LACTBL1A8MY62 500 aa6.5□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 AXIN1O15169 862 aa6.5□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 B4GALT5O43286 388 aa6.5□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 AKAP10O43572 662 aa6.5□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 MFSD11O43934 449 aa6.5□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 TKTP29401 623 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
COPB2-204ENST00000504295 HTR7P34969 479 aa6.5□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms