RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498284.1

PTPRK-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 524 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-215ENST00000498284 HDAC6Q9UBN7 1215 aa4.79□□□□□ -1.64
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PTPRK-215ENST00000498284 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
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PTPRK-215ENST00000498284 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
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PTPRK-215ENST00000498284 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP4.77□□□□□ -1.65
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PTPRK-215ENST00000498284 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP4.77□□□□□ -1.65
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PTPRK-215ENST00000498284 TNFRSF1BP20333 461 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 TNFSF8P32971 234 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 CLCNKBP51801 687 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 MAPK7Q13164 816 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-215ENST00000498284 LAMB3Q13751 1172 aa4.75□□□□□ -1.65
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