RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492182.5

XPO1-222, Transcript of exportin 1, human

TSL 2

Gene XPO1, Length 827 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
XPO1-222	ENST00000492182	CALCA	P01258	141 aa		10.26	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	DGKA	P23743	735 aa		10.26	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	SKOR1	P84550	965 aa		10.26	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	CCDC15	Q0P6D6	951 aa		10.26	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	KCNMA1	Q12791	1236 aa		10.26	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	CETN1	Q12798	172 aa		10.26	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	CNTN1	Q12860	1018 aa		10.26	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	ARID5B	Q14865	1188 aa		10.26	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	STIL	Q15468	1287 aa		10.26	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		10.26	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		10.26	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	ZNF542P	Q5EBM4	170 aa		10.26	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		10.26	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	TAC4	Q86UU9	113 aa		10.26	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	TRIM69	Q86WT6	500 aa		10.26	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	CCAR2	Q8N163	923 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	SCML4	Q8N228	414 aa		10.26	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	OR4C6	Q8NH72	309 aa		10.26	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	IFI44	Q8TCB0	444 aa		10.26	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	RFFL	Q8WZ73	363 aa		10.26	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	VCPIP1	Q96JH7	1222 aa		10.26	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	LMLN	Q96KR4	655 aa		10.26	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	CCDC114	Q96M63	670 aa		10.26	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	RPRD1A	Q96P16	312 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		10.26	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	MUC3B	Q9H195	1237 aa		10.26	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	POLR1B	Q9H9Y6	1135 aa		10.26	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	XPO7	Q9UIA9	1087 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	VPS28	Q9UK41	221 aa		10.26	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	SATB2	Q9UPW6	733 aa		10.26	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182		A0A1B0GVM2	712 aa		10.25	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182		A0A1W2PQU0	124 aa		10.25	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182		B8ZZF3	427 aa		10.25	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182		H3BM21	787 aa		10.25	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	LAT	O43561	262 aa		10.25	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	OPA1	O60313	960 aa		10.25	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	PAEP	P09466	180 aa		10.25	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	KRT10	P13645	584 aa		10.25	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	KRT5	P13647	590 aa		10.25	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	CMA1	P23946	247 aa		10.25	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	NDUFA8	P51970	172 aa		10.25	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	OXCT1	P55809	520 aa		10.25	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	KRT85	P78386	507 aa		10.25	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	DPYD	Q12882	1025 aa		10.25	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	SLC12A1	Q13621	1099 aa		10.25	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		10.25	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	KIAA1614	Q5VZ46	1190 aa		10.25	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	CRTC1	Q6UUV9	634 aa		10.25	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	CCDC81	Q6ZN84	652 aa		10.25	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182		Q6ZVU0	165 aa		10.25	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	CACTIN-AS1	Q8N1I8	211 aa		10.25	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	SLC35F5	Q8WV83	523 aa		10.25	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	TFAP2B	Q92481	460 aa		10.25	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	BTN2A3P	Q96KV6	586 aa		10.25	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	HSFY1	Q96LI6	401 aa		10.25	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	APOLD1	Q96LR9	279 aa		10.25	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	DPH1	Q9BZG8	443 aa		10.25	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	PREB	Q9HCU5	417 aa		10.25	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	ARHGAP20	Q9P2F6	1191 aa		10.25	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	ARMCX3	Q9UH62	379 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	SARDH	Q9UL12	918 aa		10.25	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	IGSF10	Q6WRI0	2623 aa		10.25	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	BPTF	Q12830	3046 aa		10.25	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	GCN1	Q92616	2671 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	ZNF559-ZNF177	A0A0A6YYI6	481 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	TCAF2	A6NFQ2	919 aa		10.24	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	SLC16A3	O15427	465 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	ARHGAP6	O43182	974 aa		10.24	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	NEBL	O76041	1014 aa		10.24	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	TRUB2	O95900	331 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	CKMT1A	P12532	417 aa		10.24	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	C6	P13671	934 aa		10.24	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	HNRNPA2B1	P22626	353 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	ACADSB	P45954	432 aa		10.24	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	RECQL	P46063	649 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	LSS	P48449	732 aa		10.24	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	CLDN2	P57739	230 aa		10.24	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	ERVPABLB-1	P60509	514 aa		10.24	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	ZNF177	Q13360	481 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	NNT	Q13423	1086 aa		10.24	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	DLG2	Q15700	870 aa		10.24	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	CNGA2	Q16280	664 aa		10.24	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	CDKN3	Q16667	212 aa		10.24	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	TTC39B	Q5VTQ0	682 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	AGBL4	Q5VU57	503 aa		10.24	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	OR6B2	Q6IFH4	312 aa		10.24	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	PCSK4	Q6UW60	755 aa		10.24	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		10.24	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	RRAGA	Q7L523	313 aa		10.24	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	KANSL1	Q7Z3B3	1105 aa		10.24	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	SLC25A45	Q8N413	288 aa		10.24	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		10.24	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	OR13H1	Q8NG92	308 aa		10.24	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	ARRDC3	Q96B67	414 aa		10.24	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	DUSP23	Q9BVJ7	150 aa		10.24	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	SEMA4C	Q9C0C4	833 aa		10.24	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	POPDC2	Q9HBU9	364 aa		10.24	□□□□□ -0.77
XPO1-222	ENST00000492182	KLHL11	Q9NVR0	708 aa		10.24	□□□□□ -0.77

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms