RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	GANC	Q8TET4	914 aa		17.7	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	CFAP57	Q96MR6	1250 aa		17.7	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	DNAJC7	Q99615	494 aa		17.7	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	ZYG11B	Q9C0D3	744 aa		17.7	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	CEP44	Q9C0F1	390 aa		17.7	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	MTG2	Q9H4K7	406 aa		17.7	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	GAREM1	Q9H706	876 aa		17.7	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	ANLN	Q9NQW6	1124 aa		17.7	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		17.7	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	PARVA	Q9NVD7	372 aa		17.7	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF212	Q9UDV6	495 aa		17.7	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	DMTF1	Q9Y222	760 aa		17.7	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	NUMA1	Q14980	2115 aa		17.69	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM170A	A1A519	330 aa		17.69	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	PCDHGA12	O60330	932 aa		17.69	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	RNGTT	O60942	597 aa	Known RBP	17.69	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	MFAP3L	O75121	409 aa		17.69	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	CNTN5	O94779	1100 aa		17.69	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	OR1E1	P30953	314 aa		17.69	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	MAPKAPK2	P49137	400 aa		17.69	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	STK19	P49842	368 aa	Predicted RBP	17.69	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	ADK	P55263	362 aa	Known RBP	17.69	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	GEMIN4	P57678	1058 aa	Known RBP	17.69	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	SCAP	Q12770	1279 aa		17.69	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	OVGP1	Q12889	678 aa		17.69	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	HLA-B	Q31612	363 aa		17.69	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC14	Q49A88	953 aa		17.69	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	ALF	Q53S48	1182 aa		17.69	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	C2CD6	Q53TS8	623 aa		17.69	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	MANEAL	Q5VSG8	457 aa		17.69	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	TRNP1	Q6NT89	227 aa		17.69	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	MON1B	Q7L1V2	547 aa		17.69	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	CACUL1	Q86Y37	369 aa		17.69	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	AADAT	Q8N5Z0	425 aa		17.69	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	OR52K2	Q8NGK3	314 aa		17.69	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	RXFP2	Q8WXD0	754 aa		17.69	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC42	Q96M95	316 aa		17.69	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	SYT11	Q9BT88	431 aa		17.69	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	MRPL47	Q9HD33	250 aa	Known RBP	17.69	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	FSCN3	Q9NQT6	498 aa		17.69	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	METTL5	Q9NRN9	209 aa	Known RBP	17.69	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	TM7SF3	Q9NS93	570 aa		17.69	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	OR12D3	Q9UGF7	316 aa		17.69	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	ANKRD6	Q9Y2G4	727 aa		17.69	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	CHD8	Q9HCK8	2581 aa		17.68	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A1W2PP55	124 aa		17.68	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	DDX3X	O00571	662 aa	Known RBP eCLIP	17.68	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	YKT6	O15498	198 aa		17.68	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	FLRT2	O43155	660 aa		17.68	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	PLRG1	O43660	514 aa	Known RBP	17.68	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	AKR1B10	O60218	316 aa		17.68	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	CBFA2T3	O75081	653 aa		17.68	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	FSBP	O95073	299 aa		17.68	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	IL1B	P01584	269 aa		17.68	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	PRNP	P04156	253 aa		17.68	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	SRC	P12931	536 aa		17.68	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	RHOQ	P17081	205 aa		17.68	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	DRD3	P35462	400 aa		17.68	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	CSNK1E	P49674	416 aa	Known RBP	17.68	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	IRAK1	P51617	712 aa		17.68	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	BNC1	Q01954	994 aa		17.68	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	TBX2	Q13207	712 aa	Predicted RBP	17.68	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	ACCSL	Q4AC99	568 aa		17.68	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	17.68	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		17.68	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	NCEH1	Q6PIU2	408 aa		17.68	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	IQCH	Q86VS3	1027 aa		17.68	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		17.68	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM131B	Q86XD5	332 aa		17.68	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	SNX19	Q92543	992 aa		17.68	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	ISG20	Q96AZ6	181 aa	Known RBP	17.68	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	PSMB7	Q99436	277 aa		17.68	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	CDC6	Q99741	560 aa		17.68	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	ACE2	Q9BYF1	805 aa	Predicted RBP	17.68	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	DONSON	Q9NYP3	566 aa		17.68	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	SERGEF	Q9UGK8	458 aa		17.68	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	VPS51	Q9UID3	782 aa		17.68	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	PCDHB9	Q9Y5E1	797 aa		17.68	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	SCIN	Q9Y6U3	715 aa		17.68	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A1B0GVT2	93 aa		17.67	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	SSU72P8	A0A1W2PR75	194 aa		17.67	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	MAGEC1	O60732	1142 aa		17.67	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	HTR7	P34969	479 aa		17.67	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	EIF4A3	P38919	411 aa	Known RBP	17.67	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	CTSK	P43235	329 aa		17.67	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	PSMD8	P48556	350 aa		17.67	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	ADPRH	P54922	357 aa		17.67	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	TRIP6	Q15654	476 aa	Known RBP	17.67	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC45A4	Q5BKX6	768 aa		17.67	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC122	Q5T0U0	273 aa		17.67	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	PHLDB2	Q86SQ0	1253 aa		17.67	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	TRIM69	Q86WT6	500 aa		17.67	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	NAXD	Q8IW45	347 aa		17.67	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		17.67	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	OR14C36	Q8NHC7	312 aa		17.67	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	ISCU	Q9H1K1	167 aa		17.67	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	MAGEH1	Q9H213	219 aa		17.67	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	ERVMER34-1	Q9H9K5	563 aa		17.67	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	PREB	Q9HCU5	417 aa		17.67	■□□□□ 0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM248	Q9NWD8	314 aa		17.67	■□□□□ 0.42

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