RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 SAP25Q8TEE9 199 aa20.63■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 FAM131CQ96AQ9 280 aa20.63■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 CFAP57Q96MR6 1250 aa20.63■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 PSMB7Q99436 277 aa20.63■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 ZYG11BQ9C0D3 744 aa20.63■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 ATP13A1Q9HD20 1204 aa20.63■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 ANLNQ9NQW6 1124 aa20.63■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 LHX6Q9UPM6 363 aa20.63■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 ILVBLA1L0T0 632 aa20.62■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 MT-CO1P00395 513 aa20.62■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 RRM1P23921 792 aa20.62■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 HNF1BP35680 557 aa20.62■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 FLT3P36888 993 aa20.62■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 NOMO3P69849 1222 aa20.62■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 ATP11AP98196 1134 aa20.62■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 HS1BP3Q53T59 392 aa20.62■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa20.62■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 NEK5Q6P3R8 708 aa20.62■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 DHRS13Q6UX07 377 aa20.62■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 LINGO4Q6UY18 593 aa20.62■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 FAM131BQ86XD5 332 aa20.62■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 OR2A12Q8NGT7 310 aa20.62■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 KLHDC7BQ96G42 594 aa20.62■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa20.62■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 IL36AQ9UHA7 158 aa20.62■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa20.62■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 DOCK4Q8N1I0 1966 aa20.62■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa20.61■□□□□ 0.89
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ACTB-212ENST00000484841 K7ERQ8 282 aa20.61■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 RFPL3O75679 317 aa20.61■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 PCDH8O95206 1070 aa20.61■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 SDC4P31431 198 aa20.61■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 DNA2P51530 1060 aa20.61■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 SLC20A2Q08357 652 aa20.61■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 SYCP1Q15431 976 aa20.61■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 CDO1Q16878 200 aa20.61■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 C22orf39Q6P5X5 142 aa20.61■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 ARCQ7LC44 396 aa20.61■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 ZNF683Q8IZ20 524 aa20.61■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 MDM1Q8TC05 714 aa20.61■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa20.61■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa20.61■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 TMEM59LQ9UK28 342 aa20.61■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa20.61■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa20.61■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 FRYQ5TBA9 3013 aa20.6■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 A0A1W2PQU0 124 aa20.6■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 FAM149AA5PLN7 773 aa20.6■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 C10orf142B7Z368 130 aa20.6■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 I6L893 689 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 TAF4O00268 1085 aa20.6■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 SLC31A1O15431 190 aa20.6■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 ENDOD1O94919 500 aa20.6■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 C1SP09871 688 aa20.6■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 JUPP14923 745 aa20.6■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 SOX5P35711 763 aa20.6■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 ETFBP38117 255 aa20.6■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 RXRGP48443 463 aa20.6■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 CDR2Q01850 454 aa20.6■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 SHBQ15464 509 aa20.6■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 ARSIQ5FYB1 569 aa20.6■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 TRIM72Q6ZMU5 477 aa20.6■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 TMPRSS12Q86WS5 348 aa20.6■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 DRC7Q8IY82 874 aa20.6■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 EMC1Q8N766 993 aa20.6■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 OR7D4Q8NG98 312 aa20.6■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 TNKS2Q9H2K2 1166 aa20.6■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 NLRC4Q9NPP4 1024 aa20.6■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
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ACTB-212ENST00000484841 DOCK9Q9BZ29 2069 aa20.59■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 TRABD2BA6NFA1 517 aa20.59■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 CTSLP07711 333 aa20.59■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 AKT2P31751 481 aa20.59■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 STAT1P42224 750 aa20.59■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 BNIP3Q12983 259 aa20.59■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa20.59■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 SASS6Q6UVJ0 657 aa20.59■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 KLK6Q92876 244 aa20.59■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 MYOCQ99972 504 aa20.59■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 CEP44Q9C0F1 390 aa20.59■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 CEP295Q9C0D2 2601 aa20.58■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 CAPNS1P04632 268 aa20.58■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 THEGLP0DJG4 465 aa20.58■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 GLDCP23378 1020 aa20.58■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 NSFP46459 744 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
ACTB-212ENST00000484841 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
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